More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0620 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0620  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 645 aa  1295    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.83 
 
 		 1075 aa  306  7e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3769  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.83 
 
 		 710 aa  303  5.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.312808  normal  0.729669 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2769  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.78 
 
 		 773 aa  298  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.91 
 
 		 1070 aa  297  4e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.96 
 
 		 882 aa  294  3e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3526  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  47.84 
 
 		 835 aa  290  5.0000000000000004e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.722503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 		 916 aa  288  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  44.5 
 
 		 900 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.91 
 
 		 674 aa  287  4e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2547  histidine kinase  46.23 
 
 		 698 aa  286  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.795977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2536  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 		 801 aa  284  3.0000000000000004e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.08 
 
 		 973 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.6 
 
 		 1363 aa  283  8.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 		 1177 aa  282  1e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3242  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.38 
 
 		 1027 aa  281  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.073449  normal  0.0177381 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 		 902 aa  281  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.21 
 
 		 1116 aa  282  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  42.24 
 
 		 544 aa  281  3e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 		 995 aa  280  7e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.29 
 
 		 765 aa  280  8e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.28 
 
 		 803 aa  280  8e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 		 969 aa  279  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 		 1622 aa  278  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.25 
 
 		 827 aa  277  5e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  39.58 
 
 		 968 aa  277  5e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1746  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 		 903 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3965  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 		 1158 aa  274  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 		 1199 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  39.75 
 
 		 982 aa  274  5.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 		 982 aa  273  7e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.02 
 
 		 865 aa  272  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.08 
 
 		 589 aa  272  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0113735 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.75 
 
 		 1120 aa  272  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  39.67 
 
 		 882 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4006  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.36 
 
 		 782 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  32.19 
 
 		 853 aa  270  5e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 		 877 aa  270  5e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.83 
 
 		 764 aa  270  5.9999999999999995e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 		 1340 aa  270  8e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4471  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.93 
 
 		 627 aa  268  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.611462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2790  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.2 
 
 		 592 aa  268  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0688167 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.39 
 
 		 969 aa  268  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.9 
 
 		 817 aa  267  5e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.13 
 
 		 627 aa  267  5.999999999999999e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  42.27 
 
 		 781 aa  266  7e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 		 902 aa  265  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.7 
 
 		 1121 aa  265  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.16 
 
 		 1313 aa  265  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.08 
 
 		 1433 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.99 
 
 		 1124 aa  266  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.57 
 
 		 1287 aa  266  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.27 
 
 		 1691 aa  265  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 		 785 aa  265  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.24 
 
 		 791 aa  265  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.55 
 
 		 724 aa  264  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  41.43 
 
 		 666 aa  265  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0715  histidine kinase  43.9 
 
 		 553 aa  265  3e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519915  normal  0.60104 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.15 
 
 		 940 aa  264  4e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 		 1271 aa  263  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0244  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 		 1066 aa  261  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.69 
 
 		 524 aa  262  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.79 
 
 		 717 aa  261  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1497  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.94 
 
 		 880 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2847  PAS  41.65 
 
 		 764 aa  260  5.0000000000000005e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.445085  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.55 
 
 		 957 aa  260  6e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1879  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.38 
 
 		 604 aa  260  6e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.02 
 
 		 939 aa  259  7e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 		 1548 aa  259  8e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2504  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 		 1132 aa  259  8e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3041  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.03 
 
 		 873 aa  259  9e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616698  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2127  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.52 
 
 		 815 aa  259  9e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  36.14 
 
 		 772 aa  259  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 		 645 aa  259  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.16 
 
 		 1127 aa  259  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1622  PAS  38.17 
 
 		 802 aa  258  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.2135  normal  0.458803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.05 
 
 		 1350 aa  258  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 		 1007 aa  259  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.54 
 
 		 873 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  39.45 
 
 		 606 aa  258  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.64 
 
 		 738 aa  258  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.4 
 
 		 846 aa  257  4e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.33 
 
 		 1369 aa  257  4e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.76 
 
 		 1044 aa  257  5e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  42.01 
 
 		 582 aa  256  6e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5153  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 		 1002 aa  257  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.04 
 
 		 984 aa  256  8e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5761  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.18 
 
 		 1204 aa  256  8e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.122146 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.84 
 
 		 606 aa  256  8e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 		 1118 aa  256  9e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  41.09 
 
 		 589 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 		 898 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  39.81 
 
 		 641 aa  256  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3277  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.55 
 
 		 741 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.01 
 
 		 871 aa  255  2.0000000000000002e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.363033  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 		 989 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2249  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 		 1143 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.673162  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.94 
 
 		 1407 aa  254  3e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 		 1350 aa  254  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3466  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 		 1362 aa  254  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185791  normal  0.474676 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>