More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1227 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1227  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 		 787 aa  1621    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.76 
 
 		 785 aa  339  9e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3858  PAS sensor protein  42.41 
 
 		 797 aa  294  5e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.76 
 
 		 932 aa  293  1e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0229  histidine kinase  41.44 
 
 		 724 aa  286  1.0000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0610831  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  40.05 
 
 		 982 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.51 
 
 		 865 aa  280  6e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  40.86 
 
 		 735 aa  280  6e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3366  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.87 
 
 		 762 aa  277  6e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.28 
 
 		 763 aa  276  1.0000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.71 
 
 		 1287 aa  273  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  40.51 
 
 		 968 aa  271  2.9999999999999997e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1644  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.99 
 
 		 789 aa  271  2.9999999999999997e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841521  normal  0.594738 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.55 
 
 		 863 aa  270  7e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.26 
 
 		 1229 aa  270  8e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  39.03 
 
 		 631 aa  267  5e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1760  histidine kinase  40.1 
 
 		 671 aa  267  7e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  40.36 
 
 		 1028 aa  265  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 		 816 aa  265  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3325  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.84 
 
 		 667 aa  265  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.8 
 
 		 945 aa  266  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1639  histidine kinase  41.99 
 
 		 676 aa  264  4e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.576569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.32 
 
 		 1199 aa  264  4.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  38.07 
 
 		 661 aa  264  4.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0688  histidine kinase  38.99 
 
 		 691 aa  264  4.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0585  ATP-binding region ATPase domain protein  38.9 
 
 		 528 aa  263  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.215545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  39.01 
 
 		 1871 aa  263  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.51 
 
 		 1195 aa  262  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  37.32 
 
 		 655 aa  262  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3542  PAS sensor protein  39.49 
 
 		 656 aa  261  5.0000000000000005e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.11869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3925  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.61 
 
 		 662 aa  260  8e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.150145  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.51 
 
 		 902 aa  259  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.74 
 
 		 1313 aa  258  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.79 
 
 		 1127 aa  258  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  39.28 
 
 		 659 aa  258  4e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  39.68 
 
 		 543 aa  258  4e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 		 1452 aa  257  6e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.11 
 
 		 982 aa  256  8e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 		 631 aa  256  9e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.11 
 
 		 1009 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4076  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 		 876 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.62 
 
 		 1110 aa  255  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000219546 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.5 
 
 		 738 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.91 
 
 		 717 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5254  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.47 
 
 		 579 aa  254  6e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601488  normal  0.0228125 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.21 
 
 		 916 aa  253  8.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.58 
 
 		 1350 aa  253  8.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  38.27 
 
 		 1763 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  38.19 
 
 		 1560 aa  253  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 781 aa  253  1e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  38.54 
 
 		 544 aa  253  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  37.28 
 
 		 641 aa  252  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4243  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.25 
 
 		 653 aa  252  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.506182  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.96 
 
 		 764 aa  252  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.06 
 
 		 873 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3965  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.15 
 
 		 1158 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.11 
 
 		 1363 aa  251  4e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0659  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.9 
 
 		 570 aa  251  5e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2847  PAS  37.16 
 
 		 764 aa  251  5e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.445085  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1601  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.95 
 
 		 685 aa  250  6e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0518398  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.2 
 
 		 984 aa  250  8e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  37.27 
 
 		 1023 aa  250  9e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4224  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.56 
 
 		 877 aa  250  9e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3474  ATP-binding region ATPase domain protein  41.01 
 
 		 706 aa  249  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 959 aa  249  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.27 
 
 		 765 aa  249  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07851  hybrid sensory kinase  37.25 
 
 		 730 aa  248  2e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 		 827 aa  249  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  37.34 
 
 		 2109 aa  249  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  38.5 
 
 		 853 aa  248  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  36.75 
 
 		 736 aa  248  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.95 
 
 		 647 aa  248  4e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372822  normal  0.204987 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.76 
 
 		 973 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1560  response regulator, histidine kinase  41.64 
 
 		 697 aa  247  4.9999999999999997e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0213368  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.19 
 
 		 589 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0113735 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  38.54 
 
 		 578 aa  247  6e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.47 
 
 		 1135 aa  247  6e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.22 
 
 		 882 aa  247  6e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.32 
 
 		 1407 aa  247  8e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0516  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.42 
 
 		 850 aa  246  9e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.377634 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0141  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.58 
 
 		 778 aa  246  9e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  39.89 
 
 		 1177 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1614  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.68 
 
 		 873 aa  246  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.499982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  37.63 
 
 		 759 aa  246  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.85 
 
 		 1350 aa  246  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0551  PAS  38.98 
 
 		 1026 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.425664 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2934  PAS  39.36 
 
 		 955 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000914767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3508  sensor histidine kinase  38.3 
 
 		 729 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.26 
 
 		 1596 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0715  histidine kinase  37.56 
 
 		 553 aa  245  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519915  normal  0.60104 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.73 
 
 		 1433 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3075  histidine kinase  38.11 
 
 		 550 aa  245  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 		 1075 aa  245  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3431  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 756 aa  245  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  37.63 
 
 		 1135 aa  244  3.9999999999999997e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  39.69 
 
 		 794 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29290  hybrid histidine protein kinase  36.64 
 
 		 826 aa  244  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.56 
 
 		 860 aa  244  5e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.56 
 
 		 1222 aa  244  5e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  39.11 
 
 		 853 aa  244  6e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>