More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2352 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2352  histidine kinase  100 
 
 		 441 aa  871    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1251  histidine kinase  51.82 
 
 		 477 aa  425  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0537245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2593  hybrid histidine kinase  51.82 
 
 		 477 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1930  histidine kinase  50.64 
 
 		 476 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.592963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3952  histidine kinase  43.34 
 
 		 747 aa  294  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2939  histidine kinase  40.32 
 
 		 447 aa  288  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.012617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4194  histidine kinase  40.18 
 
 		 452 aa  286  4e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100725  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1817  histidine kinase  41.61 
 
 		 454 aa  282  9e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2202  histidine kinase  40.92 
 
 		 447 aa  276  4e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1926  ATPase domain-containing protein  40.92 
 
 		 454 aa  276  6e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.82384 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3519  histidine kinase  40.27 
 
 		 448 aa  271  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0922492  normal  0.751112 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2880  signal transduction histidine kinase  41.32 
 
 		 733 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1526  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.32 
 
 		 733 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0396333  normal  0.047905 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.33 
 
 		 733 aa  266  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0467  sensor histidine kinase  41.6 
 
 		 758 aa  265  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.81 
 
 		 1174 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.68 
 
 		 1168 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2676  histidine kinase  39.81 
 
 		 676 aa  256  6e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00458174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.1 
 
 		 1167 aa  256  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.07 
 
 		 1169 aa  255  9e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  40.89 
 
 		 1169 aa  255  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  39.81 
 
 		 1169 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.21 
 
 		 1163 aa  249  7e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.31 
 
 		 1168 aa  249  8e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.78 
 
 		 1169 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.21 
 
 		 1169 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.05 
 
 		 1172 aa  248  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2340  histidine kinase  37.28 
 
 		 487 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266723 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0699  signal transduction histidine kinase  40.39 
 
 		 744 aa  246  6.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.324444  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.19 
 
 		 1172 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  38.42 
 
 		 1159 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  38.42 
 
 		 1159 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 		 1152 aa  240  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.68675 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3319  putative two-component sensor  37.85 
 
 		 868 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4564  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 		 1169 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.86 
 
 		 1316 aa  238  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3079  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.44 
 
 		 556 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.94 
 
 		 1138 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38970  putative two-component sensor  38.1 
 
 		 881 aa  236  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.687207  normal  0.985828 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3301  putative two-component sensor  39.45 
 
 		 577 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15238  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.46 
 
 		 1177 aa  234  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1972  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.27 
 
 		 574 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0539187 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 		 645 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2683  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.06 
 
 		 567 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.259535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.13 
 
 		 1171 aa  230  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3120  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.56 
 
 		 554 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0189072  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  33.92 
 
 		 1055 aa  229  5e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 		 1146 aa  229  8e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 		 1159 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.56 
 
 		 1159 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.35 
 
 		 635 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2688  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.34 
 
 		 589 aa  226  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.16 
 
 		 1159 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 1177 aa  226  6e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2664  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.74 
 
 		 655 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.81 
 
 		 1170 aa  226  7e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  34.22 
 
 		 1145 aa  226  8e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  34.22 
 
 		 1146 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 		 1146 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.05 
 
 		 1145 aa  224  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 		 1146 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.31 
 
 		 1146 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  36.18 
 
 		 1157 aa  224  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.47 
 
 		 1145 aa  224  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.98 
 
 		 1146 aa  223  6e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1792  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.98 
 
 		 1146 aa  223  6e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  35.6 
 
 		 1161 aa  223  7e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38740  putative two-component sensor  37.78 
 
 		 594 aa  223  7e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.924619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2537  fused sensor protein/response regulator  32.33 
 
 		 842 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.47 
 
 		 1156 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  33.01 
 
 		 1147 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  39.05 
 
 		 1174 aa  220  3e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0340  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 		 816 aa  219  6e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1150  signal transduction histidine kinase-like protein  37.72 
 
 		 609 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.7 
 
 		 1158 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.44 
 
 		 817 aa  218  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2557  histidine kinase  32.32 
 
 		 1142 aa  218  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257497  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1470  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.74 
 
 		 1140 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3605  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.74 
 
 		 610 aa  216  7e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.15 
 
 		 1152 aa  216  7e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  36.16 
 
 		 1158 aa  216  8e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0992  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.22 
 
 		 662 aa  215  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2571  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.06 
 
 		 634 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0964097 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2922  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.79 
 
 		 883 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301068 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00719  Multidomain protein contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  35.75 
 
 		 1147 aa  213  3.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.9 
 
 		 653 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2078  sensor histidine kinase/response regulator  33.75 
 
 		 1141 aa  213  7e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.45474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2246  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 		 854 aa  213  7e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00766594  normal  0.0928411 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0291  sensor histidine kinase  35.82 
 
 		 545 aa  212  1e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0262  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 		 545 aa  210  3e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.446369  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4849  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.46 
 
 		 655 aa  210  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0479308  normal  0.0448623 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1871  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.62 
 
 		 856 aa  210  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7668  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 		 571 aa  209  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4855  putative two-component hybrid histidine kinase, periplasmic sensor  37.09 
 
 		 591 aa  209  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268249  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1882  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  30.54 
 
 		 854 aa  208  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 		 1140 aa  207  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178694  hitchhiker  0.00103188 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1814  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.71 
 
 		 662 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.91 
 
 		 621 aa  206  6e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481716  hitchhiker  0.00124548 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 		 1159 aa  206  9e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5115  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 		 609 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0345398 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>