More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4855 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4855  putative two-component hybrid histidine kinase, periplasmic sensor  100 
 
 		 591 aa  1185    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268249  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2688  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  50.8 
 
 		 589 aa  462  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.76 
 
 		 621 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481716  hitchhiker  0.00124548 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0992  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 662 aa  332  9e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0106  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.52 
 
 		 657 aa  312  9e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.816197  normal  0.0449615 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2571  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  46.08 
 
 		 634 aa  291  2e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0964097 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1150  signal transduction histidine kinase-like protein  35.1 
 
 		 609 aa  268  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.8 
 
 		 1172 aa  263  6e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3756  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.75 
 
 		 672 aa  259  8e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.866154  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.19 
 
 		 653 aa  254  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1814  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.64 
 
 		 662 aa  251  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4849  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37 
 
 		 655 aa  246  9e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0479308  normal  0.0448623 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.39 
 
 		 1140 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178694  hitchhiker  0.00103188 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5115  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.08 
 
 		 609 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0345398 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38970  putative two-component sensor  42.06 
 
 		 881 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.687207  normal  0.985828 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.32 
 
 		 1145 aa  241  4e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0340  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.27 
 
 		 816 aa  240  6.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.39 
 
 		 1146 aa  238  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.36 
 
 		 817 aa  238  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3319  putative two-component sensor  42.22 
 
 		 868 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4705  sensor histidine kinase CorS  39.61 
 
 		 491 aa  237  6e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226442  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  35.82 
 
 		 1146 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.82 
 
 		 1146 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1792  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.82 
 
 		 1146 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.82 
 
 		 1146 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7668  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 		 571 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.3 
 
 		 1146 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  36.07 
 
 		 1145 aa  233  5e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.83 
 
 		 645 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.04 
 
 		 635 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.3 
 
 		 1146 aa  233  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2340  histidine kinase  37.99 
 
 		 487 aa  232  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2664  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.33 
 
 		 655 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.89 
 
 		 1159 aa  229  9e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.12 
 
 		 1316 aa  228  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  37.47 
 
 		 1169 aa  228  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.33 
 
 		 1445 aa  227  4e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2078  sensor histidine kinase/response regulator  36.16 
 
 		 1141 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.45474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2335  histidine kinase  32.87 
 
 		 610 aa  226  9e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249479  normal  0.165398 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2939  histidine kinase  38.19 
 
 		 447 aa  225  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.012617 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.87 
 
 		 631 aa  226  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1470  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.57 
 
 		 1140 aa  224  3e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2683  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.56 
 
 		 567 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.259535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1972  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.11 
 
 		 574 aa  224  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0539187 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0554  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.4 
 
 		 675 aa  224  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3120  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.05 
 
 		 554 aa  223  7e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0189072  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4194  histidine kinase  38.5 
 
 		 452 aa  223  8e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100725  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3079  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.56 
 
 		 556 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  35.31 
 
 		 1147 aa  222  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2557  histidine kinase  35.92 
 
 		 1142 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257497  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3717  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.03 
 
 		 663 aa  221  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143813 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1300  histidine kinase  37.91 
 
 		 468 aa  219  8.999999999999998e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0380592 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  34.55 
 
 		 1177 aa  219  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3301  putative two-component sensor  38.7 
 
 		 577 aa  219  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15238  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  34.54 
 
 		 1148 aa  218  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.41 
 
 		 1156 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  35.68 
 
 		 1159 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6120  histidine kinase  35.36 
 
 		 606 aa  218  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  37.07 
 
 		 1157 aa  217  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  35.42 
 
 		 1159 aa  216  8e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  34.83 
 
 		 1055 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3356  histidine kinase  40.94 
 
 		 633 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  35.88 
 
 		 1161 aa  214  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2456  composite two-component regulatory (sensor kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  33.03 
 
 		 638 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3605  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.26 
 
 		 610 aa  212  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 		 1158 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3355  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.38 
 
 		 880 aa  211  4e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2698  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.06 
 
 		 595 aa  211  4e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.155122 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1450  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.6 
 
 		 548 aa  210  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000168793 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1871  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 		 856 aa  210  5e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1882  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  33.69 
 
 		 854 aa  210  7e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.43 
 
 		 1170 aa  210  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2352  histidine kinase  37.09 
 
 		 441 aa  209  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1534  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.33 
 
 		 1140 aa  208  3e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.254728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2613  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.26 
 
 		 1166 aa  208  3e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.03 
 
 		 1159 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2881  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 		 632 aa  207  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365727 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  34.92 
 
 		 1158 aa  206  9e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  34.91 
 
 		 1169 aa  206  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.2 
 
 		 1169 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 		 1152 aa  205  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.68675 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.41 
 
 		 1159 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.07 
 
 		 1168 aa  203  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.06 
 
 		 1172 aa  203  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.23 
 
 		 1169 aa  203  7e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2537  fused sensor protein/response regulator  35.11 
 
 		 842 aa  203  9e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.52 
 
 		 1159 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4376  histidine kinase  29.44 
 
 		 593 aa  202  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904194  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2060  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 1111 aa  202  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.749505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0508  histidine kinase  39.14 
 
 		 663 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.217821  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  34.44 
 
 		 1174 aa  202  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2743  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  32.97 
 
 		 611 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 		 1169 aa  200  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1251  histidine kinase  36.9 
 
 		 477 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0537245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2593  hybrid histidine kinase  36.9 
 
 		 477 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.66 
 
 		 1152 aa  197  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1570  Signal transduction histidine kinase-like  31.91 
 
 		 666 aa  197  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.733845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38740  putative two-component sensor  35.55 
 
 		 594 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.924619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 		 1168 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2327  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.64 
 
 		 591 aa  196  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693405 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>