More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2935 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 817 aa  1622    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0992  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.49 
 
 		 662 aa  305  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.92 
 
 		 1316 aa  294  5e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2571  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.67 
 
 		 634 aa  287  5.999999999999999e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0964097 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0340  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  44.74 
 
 		 816 aa  283  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3756  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.86 
 
 		 672 aa  281  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.866154  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7668  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.51 
 
 		 571 aa  281  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 635 aa  281  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 		 645 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2664  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 		 655 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38970  putative two-component sensor  33.03 
 
 		 881 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.687207  normal  0.985828 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1871  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 		 856 aa  274  5.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.02 
 
 		 621 aa  272  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481716  hitchhiker  0.00124548 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3319  putative two-component sensor  32.67 
 
 		 868 aa  270  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1882  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  30.36 
 
 		 854 aa  266  8.999999999999999e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2246  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.18 
 
 		 854 aa  265  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00766594  normal  0.0928411 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2688  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.82 
 
 		 589 aa  265  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  36.54 
 
 		 1445 aa  259  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2340  histidine kinase  38.64 
 
 		 487 aa  258  3e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266723 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2537  fused sensor protein/response regulator  26.85 
 
 		 842 aa  257  7e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  38.72 
 
 		 1157 aa  255  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.83 
 
 		 1172 aa  253  8.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1150  signal transduction histidine kinase-like protein  39.73 
 
 		 609 aa  251  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3717  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.42 
 
 		 663 aa  250  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4855  putative two-component hybrid histidine kinase, periplasmic sensor  40.36 
 
 		 591 aa  250  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268249  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.28 
 
 		 1169 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1972  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.58 
 
 		 574 aa  249  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0539187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4194  histidine kinase  42.59 
 
 		 452 aa  249  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100725  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  36.42 
 
 		 1169 aa  248  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  38.05 
 
 		 1159 aa  248  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  37.79 
 
 		 1159 aa  247  6e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2939  histidine kinase  40.64 
 
 		 447 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.012617 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.62 
 
 		 653 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.81 
 
 		 1169 aa  246  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6120  histidine kinase  40.15 
 
 		 606 aa  244  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.24 
 
 		 1156 aa  243  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4096  histidine kinase  39.01 
 
 		 604 aa  242  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000005496 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  38.3 
 
 		 1147 aa  242  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  35.81 
 
 		 1177 aa  241  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  34.83 
 
 		 1055 aa  240  5.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2683  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.42 
 
 		 567 aa  240  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.259535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3120  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.9 
 
 		 554 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0189072  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1300  histidine kinase  40.74 
 
 		 468 aa  239  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0380592 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 		 1168 aa  239  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 		 1159 aa  238  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.36 
 
 		 1167 aa  238  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.17 
 
 		 1177 aa  238  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.49 
 
 		 1169 aa  237  5.0000000000000005e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.51 
 
 		 1159 aa  236  9e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 		 1174 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 		 1159 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2078  sensor histidine kinase/response regulator  35.66 
 
 		 1141 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.45474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  36.62 
 
 		 1169 aa  236  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3079  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.63 
 
 		 556 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  37.18 
 
 		 1158 aa  234  6e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.6 
 
 		 1163 aa  234  7.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3301  putative two-component sensor  38.68 
 
 		 577 aa  233  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15238  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 		 1146 aa  232  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 		 1146 aa  232  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1146 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  33.33 
 
 		 1146 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.07 
 
 		 1158 aa  231  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1792  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1146 aa  231  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103598  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  33.33 
 
 		 1145 aa  231  6e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4376  histidine kinase  40.71 
 
 		 593 aa  230  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904194  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.94 
 
 		 1170 aa  230  7e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.95 
 
 		 1172 aa  229  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2352  histidine kinase  38.44 
 
 		 441 aa  229  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1146 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1146 aa  229  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  35.97 
 
 		 1161 aa  228  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  36.49 
 
 		 1148 aa  228  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 		 1140 aa  228  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178694  hitchhiker  0.00103188 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.31 
 
 		 1152 aa  227  7e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0554  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.18 
 
 		 675 aa  227  7e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.6 
 
 		 1145 aa  227  7e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4564  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 		 1169 aa  226  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3519  histidine kinase  38.06 
 
 		 448 aa  226  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0922492  normal  0.751112 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  32.77 
 
 		 1150 aa  226  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 		 1159 aa  226  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1570  Signal transduction histidine kinase-like  34.2 
 
 		 666 aa  226  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.733845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4849  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.93 
 
 		 655 aa  224  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0479308  normal  0.0448623 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2557  histidine kinase  33.86 
 
 		 1142 aa  223  8e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257497  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2880  signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 		 733 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1534  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.46 
 
 		 1140 aa  221  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.254728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1526  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.16 
 
 		 733 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0396333  normal  0.047905 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1470  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 		 1140 aa  221  5e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38740  putative two-component sensor  38.17 
 
 		 594 aa  221  6e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.924619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1814  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.39 
 
 		 662 aa  220  8.999999999999998e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.47 
 
 		 1168 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3952  histidine kinase  34.46 
 
 		 747 aa  217  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0106  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.35 
 
 		 657 aa  215  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.816197  normal  0.0449615 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2676  histidine kinase  33.75 
 
 		 676 aa  216  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00458174  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  36.09 
 
 		 1174 aa  214  3.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0699  signal transduction histidine kinase  35.73 
 
 		 744 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.324444  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6380  putative two-component sensor histidine kinase  34.76 
 
 		 596 aa  214  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.16 
 
 		 733 aa  214  7e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.16 
 
 		 1138 aa  211  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1500  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  34.22 
 
 		 1483 aa  211  6e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0510  histidine kinase  36.91 
 
 		 629 aa  210  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>