More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2038 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 653 aa  1281    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0554  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.12 
 
 		 675 aa  349  8e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2571  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.15 
 
 		 634 aa  306  7e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0964097 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3356  histidine kinase  35.75 
 
 		 633 aa  291  4e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0508  histidine kinase  35.11 
 
 		 663 aa  289  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.217821  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0992  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.27 
 
 		 662 aa  287  4e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0340  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.59 
 
 		 816 aa  277  4e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4855  putative two-component hybrid histidine kinase, periplasmic sensor  43.11 
 
 		 591 aa  273  8.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268249  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.24 
 
 		 1172 aa  266  8e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  39.66 
 
 		 1159 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0510  histidine kinase  32.34 
 
 		 629 aa  262  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  39.42 
 
 		 1159 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4194  histidine kinase  41.16 
 
 		 452 aa  261  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100725  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1150  signal transduction histidine kinase-like protein  42.9 
 
 		 609 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.33 
 
 		 1159 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.25 
 
 		 621 aa  257  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481716  hitchhiker  0.00124548 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2939  histidine kinase  40.37 
 
 		 447 aa  257  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.012617 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.33 
 
 		 1159 aa  256  8e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.08 
 
 		 1158 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 		 1159 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2688  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.7 
 
 		 589 aa  255  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0699  signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 		 744 aa  254  5.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.324444  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.53 
 
 		 817 aa  253  7e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.75 
 
 		 1316 aa  252  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.52 
 
 		 1146 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  35.52 
 
 		 1146 aa  247  6e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3952  histidine kinase  39.84 
 
 		 747 aa  246  9e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1792  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.52 
 
 		 1146 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.52 
 
 		 1146 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  38.08 
 
 		 1157 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3120  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 		 554 aa  244  5e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0189072  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2683  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.49 
 
 		 567 aa  243  7e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.259535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6380  putative two-component sensor histidine kinase  39.18 
 
 		 596 aa  243  7.999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.05 
 
 		 645 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  39.66 
 
 		 1158 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3079  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.75 
 
 		 556 aa  241  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.17 
 
 		 635 aa  241  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  35.85 
 
 		 1148 aa  240  5.999999999999999e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  35.68 
 
 		 1161 aa  239  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.42 
 
 		 1145 aa  239  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 		 1146 aa  238  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 1146 aa  238  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 1146 aa  238  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1814  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.85 
 
 		 662 aa  237  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3519  histidine kinase  41.21 
 
 		 448 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0922492  normal  0.751112 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4376  histidine kinase  41.56 
 
 		 593 aa  237  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904194  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 		 1156 aa  236  7e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 		 1140 aa  236  8e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178694  hitchhiker  0.00103188 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  39.03 
 
 		 1150 aa  236  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2352  histidine kinase  38.42 
 
 		 441 aa  235  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2557  histidine kinase  34.98 
 
 		 1142 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257497  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2664  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.79 
 
 		 655 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4096  histidine kinase  40.11 
 
 		 604 aa  235  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000005496 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4849  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.51 
 
 		 655 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0479308  normal  0.0448623 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  34.31 
 
 		 1055 aa  234  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02398  sensor histidine kinase  37.68 
 
 		 881 aa  234  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  35.25 
 
 		 1145 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.5 
 
 		 1177 aa  234  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2340  histidine kinase  38.23 
 
 		 487 aa  234  5e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266723 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.76 
 
 		 1172 aa  234  5e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0265  sensor histidine kinase  39.71 
 
 		 697 aa  233  6e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.65 
 
 		 1152 aa  233  7.000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2922  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.75 
 
 		 883 aa  233  7.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301068 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  33.98 
 
 		 1147 aa  232  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1972  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.7 
 
 		 574 aa  232  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0539187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3301  putative two-component sensor  37.17 
 
 		 577 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15238  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.39 
 
 		 1159 aa  231  4e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2202  histidine kinase  40.85 
 
 		 447 aa  230  5e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1871  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.99 
 
 		 856 aa  230  6e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1926  ATPase domain-containing protein  40.85 
 
 		 454 aa  230  7e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.82384 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7668  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.59 
 
 		 571 aa  229  9e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.88 
 
 		 631 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3756  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.13 
 
 		 672 aa  228  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.866154  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1817  histidine kinase  41.01 
 
 		 454 aa  228  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2078  sensor histidine kinase/response regulator  35.68 
 
 		 1141 aa  229  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.45474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2881  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 632 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365727 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1470  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 1140 aa  228  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2335  histidine kinase  37.28 
 
 		 610 aa  229  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249479  normal  0.165398 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2456  composite two-component regulatory (sensor kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  37.62 
 
 		 638 aa  228  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0262  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.5 
 
 		 545 aa  228  3e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.446369  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.53 
 
 		 1145 aa  228  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  33.67 
 
 		 1177 aa  228  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1882  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  33.84 
 
 		 854 aa  224  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6120  histidine kinase  41.16 
 
 		 606 aa  224  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1534  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.25 
 
 		 1140 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.254728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.83 
 
 		 1445 aa  223  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.47 
 
 		 1169 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2537  fused sensor protein/response regulator  35.48 
 
 		 842 aa  223  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0291  sensor histidine kinase  35.99 
 
 		 545 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.74 
 
 		 1174 aa  221  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 		 1138 aa  221  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3355  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.28 
 
 		 880 aa  221  3.9999999999999997e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607488  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  36.75 
 
 		 1174 aa  221  3.9999999999999997e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.77 
 
 		 1169 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  37.25 
 
 		 1169 aa  221  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 		 1163 aa  220  6e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5115  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.66 
 
 		 609 aa  220  7.999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0345398 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.4 
 
 		 1167 aa  220  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2060  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 		 1111 aa  219  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.749505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1570  Signal transduction histidine kinase-like  30 
 
 		 666 aa  218  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.733845  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>