More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4096 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4096  histidine kinase  100 
 
 		 604 aa  1169    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000005496 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6120  histidine kinase  41.39 
 
 		 606 aa  260  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4376  histidine kinase  38.62 
 
 		 593 aa  260  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904194  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2571  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.98 
 
 		 634 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0964097 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1150  signal transduction histidine kinase-like protein  34.02 
 
 		 609 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0992  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.03 
 
 		 662 aa  250  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.01 
 
 		 817 aa  238  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7668  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.49 
 
 		 571 aa  233  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2881  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.42 
 
 		 632 aa  225  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365727 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2688  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 		 589 aa  222  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3079  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.28 
 
 		 556 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1300  histidine kinase  38.85 
 
 		 468 aa  221  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0380592 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1972  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 		 574 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0539187 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2335  histidine kinase  32.67 
 
 		 610 aa  219  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249479  normal  0.165398 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2456  composite two-component regulatory (sensor kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  33.11 
 
 		 638 aa  218  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3120  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.68 
 
 		 554 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0189072  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.67 
 
 		 631 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1814  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.8 
 
 		 662 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4849  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.02 
 
 		 655 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0479308  normal  0.0448623 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0340  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.83 
 
 		 816 aa  217  5e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0510  histidine kinase  39.79 
 
 		 629 aa  216  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2683  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.78 
 
 		 567 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.259535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.25 
 
 		 1172 aa  215  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2743  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  39.68 
 
 		 611 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.68 
 
 		 1169 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.6 
 
 		 1168 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 1169 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  37.3 
 
 		 1169 aa  213  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 653 aa  212  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5115  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.76 
 
 		 609 aa  211  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0345398 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.18 
 
 		 1158 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 		 1169 aa  209  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3319  putative two-component sensor  35.44 
 
 		 868 aa  209  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38970  putative two-component sensor  36.08 
 
 		 881 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.687207  normal  0.985828 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38740  putative two-component sensor  38.75 
 
 		 594 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.924619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2327  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.71 
 
 		 591 aa  207  5e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693405 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  34.7 
 
 		 1148 aa  206  7e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1316 aa  206  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3301  putative two-component sensor  37 
 
 		 577 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15238  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0699  signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 		 744 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.324444  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2340  histidine kinase  34.57 
 
 		 487 aa  205  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266723 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.44 
 
 		 1174 aa  205  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.32 
 
 		 1146 aa  205  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1871  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.41 
 
 		 856 aa  205  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.32 
 
 		 1138 aa  205  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.79 
 
 		 1168 aa  204  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 1159 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.82 
 
 		 1156 aa  204  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.9 
 
 		 1170 aa  203  6e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 		 1146 aa  203  6e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  31.76 
 
 		 1146 aa  203  7e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1575  histidine kinase  38.83 
 
 		 777 aa  203  9e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.179984 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.7 
 
 		 645 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1792  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 		 1146 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.46 
 
 		 1159 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.03 
 
 		 621 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481716  hitchhiker  0.00124548 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4564  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 		 1169 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 		 1146 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.55 
 
 		 1140 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178694  hitchhiker  0.00103188 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.41 
 
 		 1167 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 635 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0554  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.91 
 
 		 675 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71067  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  32.01 
 
 		 1145 aa  201  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  33.08 
 
 		 1147 aa  201  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3605  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.48 
 
 		 610 aa  200  6e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 		 1159 aa  200  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2537  fused sensor protein/response regulator  31.31 
 
 		 842 aa  200  6e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1526  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.26 
 
 		 733 aa  200  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0396333  normal  0.047905 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2880  signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 		 733 aa  200  7e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  34.31 
 
 		 1150 aa  200  7e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  33.57 
 
 		 1169 aa  199  9e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0106  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 		 657 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.816197  normal  0.0449615 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 		 1146 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.31 
 
 		 1152 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.51 
 
 		 1145 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  35 
 
 		 1158 aa  198  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.32 
 
 		 1146 aa  198  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1470  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.51 
 
 		 1140 aa  197  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2078  sensor histidine kinase/response regulator  31.9 
 
 		 1141 aa  198  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.45474  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  34.44 
 
 		 1157 aa  197  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2352  histidine kinase  35.05 
 
 		 441 aa  197  6e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3756  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.66 
 
 		 672 aa  197  7e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.866154  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1882  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  29.75 
 
 		 854 aa  196  8.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2664  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 		 655 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.63 
 
 		 1172 aa  196  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2676  histidine kinase  35.54 
 
 		 676 aa  196  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00458174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.54 
 
 		 1177 aa  196  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4855  putative two-component hybrid histidine kinase, periplasmic sensor  35.81 
 
 		 591 aa  195  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268249  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 		 1163 aa  195  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.53 
 
 		 1159 aa  194  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  35.7 
 
 		 1159 aa  194  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3717  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 		 663 aa  194  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143813 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  33.07 
 
 		 1055 aa  194  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  35.26 
 
 		 1159 aa  194  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0563  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 		 591 aa  194  6e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  33.6 
 
 		 1177 aa  193  9e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.51 
 
 		 1445 aa  192  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1765  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.82 
 
 		 586 aa  192  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2557  histidine kinase  29.52 
 
 		 1142 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257497  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 		 1171 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>