More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0510 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0510  histidine kinase  100 
 
 		 629 aa  1246    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2571  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.85 
 
 		 634 aa  269  1e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0964097 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0340  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.81 
 
 		 816 aa  264  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0992  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.21 
 
 		 662 aa  258  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0508  histidine kinase  33.59 
 
 		 663 aa  252  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.217821  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.91 
 
 		 653 aa  249  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6120  histidine kinase  40.1 
 
 		 606 aa  243  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4376  histidine kinase  41.71 
 
 		 593 aa  239  8e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904194  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3756  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 672 aa  234  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.866154  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 		 1172 aa  234  4.0000000000000004e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.18 
 
 		 1167 aa  234  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.77 
 
 		 1174 aa  231  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  37.86 
 
 		 1169 aa  229  8e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1150  signal transduction histidine kinase-like protein  38.38 
 
 		 609 aa  228  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2939  histidine kinase  38.04 
 
 		 447 aa  225  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.012617 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4096  histidine kinase  39.43 
 
 		 604 aa  223  7e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000005496 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1814  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.74 
 
 		 662 aa  223  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3356  histidine kinase  33.39 
 
 		 633 aa  222  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  33.26 
 
 		 1159 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  33.26 
 
 		 1159 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0699  signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 744 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.324444  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4849  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.26 
 
 		 655 aa  219  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0479308  normal  0.0448623 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4194  histidine kinase  37.25 
 
 		 452 aa  217  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100725  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0554  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.33 
 
 		 675 aa  217  5e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5115  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37 
 
 		 609 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0345398 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  32.42 
 
 		 1161 aa  212  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.96 
 
 		 1156 aa  209  9e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  31.77 
 
 		 1148 aa  209  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2340  histidine kinase  33.89 
 
 		 487 aa  209  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266723 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3319  putative two-component sensor  33.8 
 
 		 868 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.86 
 
 		 1171 aa  208  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.23 
 
 		 1163 aa  207  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.43 
 
 		 817 aa  207  5e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.94 
 
 		 1177 aa  206  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4855  putative two-component hybrid histidine kinase, periplasmic sensor  35.81 
 
 		 591 aa  205  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268249  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  33.25 
 
 		 1174 aa  204  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7668  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 571 aa  205  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 		 1316 aa  204  4e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1450  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 548 aa  204  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000168793 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2688  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.93 
 
 		 589 aa  203  6e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 		 1170 aa  203  8e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2060  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.47 
 
 		 1111 aa  202  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.749505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  32.52 
 
 		 1055 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38970  putative two-component sensor  31.57 
 
 		 881 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.687207  normal  0.985828 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  33.33 
 
 		 1157 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.38 
 
 		 1168 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.59 
 
 		 1172 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3301  putative two-component sensor  36.08 
 
 		 577 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15238  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 		 621 aa  200  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481716  hitchhiker  0.00124548 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3605  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.15 
 
 		 610 aa  200  7.999999999999999e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 		 1158 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 		 645 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1300  histidine kinase  36.54 
 
 		 468 aa  199  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0380592 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  31.92 
 
 		 1147 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.53 
 
 		 1152 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1575  histidine kinase  38.54 
 
 		 777 aa  199  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.179984 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0265  sensor histidine kinase  44.21 
 
 		 697 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1169 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2613  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.55 
 
 		 1166 aa  198  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.05 
 
 		 1169 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38740  putative two-component sensor  36.56 
 
 		 594 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.924619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.38 
 
 		 635 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.41 
 
 		 1159 aa  197  7e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  33.73 
 
 		 1150 aa  197  7e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0523  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  31.4 
 
 		 1179 aa  196  9e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.183484 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.82 
 
 		 1159 aa  196  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2664  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.24 
 
 		 655 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 		 1138 aa  195  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2683  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 		 567 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.259535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0106  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 		 657 aa  194  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.816197  normal  0.0449615 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2627  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 		 1116 aa  195  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594612  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.64 
 
 		 1145 aa  194  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46370  putative two-component sensor  36.82 
 
 		 540 aa  194  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304755  hitchhiker  0.00684988 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3079  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 		 556 aa  193  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5108  two-component sensor  34.38 
 
 		 564 aa  193  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3951  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.32 
 
 		 540 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252359  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.1 
 
 		 1169 aa  192  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2352  histidine kinase  34.39 
 
 		 441 aa  192  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  31.23 
 
 		 1177 aa  192  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3120  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 		 554 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0189072  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  33.82 
 
 		 1169 aa  192  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1871  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.35 
 
 		 856 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  32.6 
 
 		 1158 aa  190  9e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3139  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.75 
 
 		 1161 aa  189  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.305564 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 		 561 aa  189  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2202  histidine kinase  36.34 
 
 		 447 aa  188  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1926  ATPase domain-containing protein  36.46 
 
 		 454 aa  188  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.82384 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.19 
 
 		 1140 aa  188  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178694  hitchhiker  0.00103188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.17 
 
 		 1159 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2880  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 733 aa  187  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1526  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.17 
 
 		 733 aa  187  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0396333  normal  0.047905 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2881  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.87 
 
 		 632 aa  187  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365727 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  30.77 
 
 		 1145 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2922  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.91 
 
 		 883 aa  186  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301068 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.5 
 
 		 733 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2676  histidine kinase  33.33 
 
 		 676 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00458174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6380  putative two-component sensor histidine kinase  33.5 
 
 		 596 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.02 
 
 		 1159 aa  184  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.53 
 
 		 1146 aa  184  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 1168 aa  183  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.303418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>