More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0265 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0265  sensor histidine kinase  100 
 
 		 697 aa  1417    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3356  histidine kinase  40.68 
 
 		 633 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0554  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  48.86 
 
 		 675 aa  225  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2571  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39 
 
 		 634 aa  219  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0964097 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  48.88 
 
 		 653 aa  219  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4376  histidine kinase  46.22 
 
 		 593 aa  206  9e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904194  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0508  histidine kinase  38.61 
 
 		 663 aa  205  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.217821  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6120  histidine kinase  46.12 
 
 		 606 aa  204  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1150  signal transduction histidine kinase-like protein  43.71 
 
 		 609 aa  200  7e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0340  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.34 
 
 		 816 aa  197  5.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0510  histidine kinase  45.14 
 
 		 629 aa  193  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0992  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.8 
 
 		 662 aa  189  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3605  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.35 
 
 		 610 aa  187  6e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4849  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.61 
 
 		 655 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0479308  normal  0.0448623 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 		 1316 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 		 1163 aa  183  8.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 		 1172 aa  182  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1814  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 		 662 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0106  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.54 
 
 		 657 aa  180  7e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.816197  normal  0.0449615 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  33.67 
 
 		 1159 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4096  histidine kinase  38.83 
 
 		 604 aa  179  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000005496 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  36.08 
 
 		 1169 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2688  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.27 
 
 		 589 aa  179  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2627  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 		 1116 aa  179  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594612  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.06 
 
 		 1174 aa  179  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5115  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 		 609 aa  178  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0345398 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  33.33 
 
 		 1169 aa  177  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 		 1158 aa  176  9e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.42 
 
 		 1159 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33 
 
 		 1156 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2060  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.55 
 
 		 1111 aa  176  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.749505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  32.92 
 
 		 1159 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2939  histidine kinase  35.53 
 
 		 447 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.012617 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2327  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.02 
 
 		 591 aa  176  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693405 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1300  histidine kinase  37.42 
 
 		 468 aa  175  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0380592 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3717  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.01 
 
 		 663 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143813 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.39 
 
 		 561 aa  174  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1450  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 		 548 aa  174  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000168793 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02398  sensor histidine kinase  34.58 
 
 		 881 aa  174  6.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 		 1159 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4855  putative two-component hybrid histidine kinase, periplasmic sensor  41.24 
 
 		 591 aa  173  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268249  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4194  histidine kinase  34.95 
 
 		 452 aa  172  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100725  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2352  histidine kinase  36.03 
 
 		 441 aa  172  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.73 
 
 		 1145 aa  172  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46370  putative two-component sensor  35.79 
 
 		 540 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304755  hitchhiker  0.00684988 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.49 
 
 		 1168 aa  172  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2078  sensor histidine kinase/response regulator  36.83 
 
 		 1141 aa  171  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.45474  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  33.58 
 
 		 1174 aa  171  6e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 		 1171 aa  171  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.25 
 
 		 1167 aa  170  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1159 aa  170  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.97 
 
 		 1169 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0068  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35.48 
 
 		 1156 aa  169  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2058  histidine kinase  37.69 
 
 		 499 aa  169  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.38 
 
 		 1169 aa  169  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.49 
 
 		 1168 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 		 1152 aa  168  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  31.84 
 
 		 1161 aa  168  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1871  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.16 
 
 		 856 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.95 
 
 		 1146 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.95 
 
 		 1146 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.95 
 
 		 1146 aa  168  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.11 
 
 		 1145 aa  167  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3319  putative two-component sensor  37.1 
 
 		 868 aa  167  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  32.37 
 
 		 1158 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3951  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.27 
 
 		 540 aa  167  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252359  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  35.28 
 
 		 1146 aa  167  9e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1792  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.28 
 
 		 1146 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.28 
 
 		 1146 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.28 
 
 		 1146 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  34.63 
 
 		 1145 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.98 
 
 		 621 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481716  hitchhiker  0.00124548 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.85 
 
 		 1169 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02256  Multidomain protein, contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  36.47 
 
 		 1006 aa  166  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.371064  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3519  histidine kinase  33.25 
 
 		 448 aa  165  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0922492  normal  0.751112 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 		 1172 aa  164  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.31 
 
 		 1159 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  31.37 
 
 		 1157 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0262  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33 
 
 		 545 aa  164  5.0000000000000005e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.446369  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4705  sensor histidine kinase CorS  35.58 
 
 		 491 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226442  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1470  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.67 
 
 		 1140 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.16 
 
 		 1140 aa  164  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178694  hitchhiker  0.00103188 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4564  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.73 
 
 		 1169 aa  164  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1497  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.24 
 
 		 880 aa  164  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2557  histidine kinase  35.16 
 
 		 1142 aa  163  9e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257497  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3355  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.66 
 
 		 880 aa  163  9e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0523  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  36.79 
 
 		 1179 aa  163  9e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.183484 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2340  histidine kinase  40.32 
 
 		 487 aa  163  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266723 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5108  two-component sensor  32.42 
 
 		 564 aa  162  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38970  putative two-component sensor  37.54 
 
 		 881 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.687207  normal  0.985828 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3253  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.77 
 
 		 545 aa  161  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3460  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 		 1175 aa  161  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.549126 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.73 
 
 		 620 aa  161  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0291  sensor histidine kinase  32.75 
 
 		 545 aa  161  4e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6380  putative two-component sensor histidine kinase  37.16 
 
 		 596 aa  161  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5189  Signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 539 aa  160  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2664  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 655 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  29.7 
 
 		 1147 aa  160  6e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3284  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.56 
 
 		 1168 aa  160  6e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.431447 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2246  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.22 
 
 		 854 aa  160  7e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00766594  normal  0.0928411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>