More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0554 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0554  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 675 aa  1328    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.94 
 
 		 653 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2571  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.21 
 
 		 634 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0964097 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3356  histidine kinase  34.5 
 
 		 633 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0992  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.39 
 
 		 662 aa  264  4.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0340  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.74 
 
 		 816 aa  261  4e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0265  sensor histidine kinase  48.24 
 
 		 697 aa  247  4.9999999999999997e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3756  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.71 
 
 		 672 aa  247  6.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.866154  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4855  putative two-component hybrid histidine kinase, periplasmic sensor  40.65 
 
 		 591 aa  246  9e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268249  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.01 
 
 		 1172 aa  242  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.68 
 
 		 621 aa  240  6.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481716  hitchhiker  0.00124548 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7668  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.31 
 
 		 571 aa  236  8e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  36.75 
 
 		 1159 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1150  signal transduction histidine kinase-like protein  40.32 
 
 		 609 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  36.75 
 
 		 1159 aa  234  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2340  histidine kinase  36.62 
 
 		 487 aa  234  5e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266723 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 1152 aa  231  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0508  histidine kinase  39.86 
 
 		 663 aa  231  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.217821  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3079  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.75 
 
 		 556 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.31 
 
 		 1172 aa  228  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3717  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.98 
 
 		 663 aa  228  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143813 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2683  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.25 
 
 		 567 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.259535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 1174 aa  226  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  40.66 
 
 		 1150 aa  226  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2456  composite two-component regulatory (sensor kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  38.89 
 
 		 638 aa  225  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3120  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.4 
 
 		 554 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0189072  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 		 1316 aa  226  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.58 
 
 		 817 aa  224  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02398  sensor histidine kinase  38.31 
 
 		 881 aa  224  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4376  histidine kinase  39.95 
 
 		 593 aa  223  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904194  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  35 
 
 		 1157 aa  223  8e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.39 
 
 		 1159 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 		 1158 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.9 
 
 		 1159 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1814  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.62 
 
 		 662 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0510  histidine kinase  31.81 
 
 		 629 aa  220  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4849  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 		 655 aa  220  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0479308  normal  0.0448623 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2698  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.44 
 
 		 595 aa  220  7.999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.155122 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6120  histidine kinase  39.45 
 
 		 606 aa  219  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2688  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.08 
 
 		 589 aa  219  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3355  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.7 
 
 		 880 aa  219  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.49 
 
 		 1156 aa  219  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 		 1167 aa  217  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  34.29 
 
 		 1158 aa  216  8e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1526  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.35 
 
 		 733 aa  216  9e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0396333  normal  0.047905 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2880  signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 733 aa  216  9e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2335  histidine kinase  38.07 
 
 		 610 aa  216  9e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249479  normal  0.165398 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.07 
 
 		 631 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 		 1159 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  34.83 
 
 		 1055 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1926  ATPase domain-containing protein  37.83 
 
 		 454 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.82384 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2202  histidine kinase  37.83 
 
 		 447 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 		 1145 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  37.9 
 
 		 1169 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 		 1163 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1817  histidine kinase  38.14 
 
 		 454 aa  214  5.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.32 
 
 		 1146 aa  212  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.92 
 
 		 1445 aa  213  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1882  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  32.59 
 
 		 854 aa  212  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3301  putative two-component sensor  37.8 
 
 		 577 aa  212  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15238  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  34.25 
 
 		 1148 aa  211  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.79 
 
 		 1145 aa  211  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1930  histidine kinase  37.78 
 
 		 476 aa  211  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.592963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0262  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.93 
 
 		 545 aa  211  5e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.446369  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.1 
 
 		 1146 aa  210  6e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.1 
 
 		 1146 aa  210  7e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2664  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 		 655 aa  210  8e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1972  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38 
 
 		 574 aa  210  8e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0539187 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 		 635 aa  210  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  34.99 
 
 		 1169 aa  209  9e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  33.26 
 
 		 1168 aa  209  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 		 1159 aa  209  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  33.64 
 
 		 1146 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5115  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 		 609 aa  208  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0345398 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 		 1146 aa  209  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 		 1146 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1575  histidine kinase  39.57 
 
 		 777 aa  208  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.179984 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.28 
 
 		 1168 aa  209  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2060  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 1111 aa  209  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.749505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4096  histidine kinase  38.72 
 
 		 604 aa  209  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000005496 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1792  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 		 1146 aa  208  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103598  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  33.72 
 
 		 1145 aa  207  4e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3519  histidine kinase  37.91 
 
 		 448 aa  207  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0922492  normal  0.751112 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1251  histidine kinase  38.24 
 
 		 477 aa  207  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0537245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2593  hybrid histidine kinase  37.64 
 
 		 477 aa  207  5e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0106  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.9 
 
 		 657 aa  207  6e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.816197  normal  0.0449615 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2881  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.63 
 
 		 632 aa  207  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365727 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2922  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.96 
 
 		 883 aa  206  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301068 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.92 
 
 		 645 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2078  sensor histidine kinase/response regulator  33.26 
 
 		 1141 aa  206  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.45474  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  33.92 
 
 		 1174 aa  205  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2557  histidine kinase  33.1 
 
 		 1142 aa  205  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257497  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.95 
 
 		 1138 aa  205  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.87 
 
 		 1169 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1470  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 		 1140 aa  205  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4194  histidine kinase  37.22 
 
 		 452 aa  204  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100725  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  34.32 
 
 		 1177 aa  204  5e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1450  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.73 
 
 		 548 aa  204  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000168793 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2743  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  37.19 
 
 		 611 aa  204  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2537  fused sensor protein/response regulator  31.92 
 
 		 842 aa  203  7e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>