More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1814 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5115  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  82.67 
 
 
609 aa  993    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0345398 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4849  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  88.52 
 
 
655 aa  1140    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0479308  normal  0.0448623 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1814  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
662 aa  1341    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1150  signal transduction histidine kinase-like protein  34.06 
 
 
609 aa  279  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2571  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.41 
 
 
634 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0964097 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4855  putative two-component hybrid histidine kinase, periplasmic sensor  34.64 
 
 
591 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268249  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0992  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.05 
 
 
662 aa  253  8.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  37.04 
 
 
1147 aa  239  8e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2688  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.78 
 
 
589 aa  232  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0340  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.22 
 
 
816 aa  231  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.12 
 
 
621 aa  230  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481716  hitchhiker  0.00124548 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  36.46 
 
 
1055 aa  230  8e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  37.76 
 
 
1148 aa  229  1e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7668  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.24 
 
 
571 aa  229  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  35.44 
 
 
1177 aa  228  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.1 
 
 
631 aa  227  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2335  histidine kinase  33.1 
 
 
610 aa  226  8e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249479  normal  0.165398 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  36.9 
 
 
1159 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0510  histidine kinase  37.84 
 
 
629 aa  224  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 
1156 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.91 
 
 
1163 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3756  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
672 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.866154  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 
1159 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  36.39 
 
 
1159 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.37 
 
 
1159 aa  220  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.45 
 
 
1172 aa  220  7e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.13 
 
 
1158 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2456  composite two-component regulatory (sensor kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  34.12 
 
 
638 aa  218  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.37 
 
 
1159 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  36.76 
 
 
1445 aa  217  5e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2683  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 
567 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.259535  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3079  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 
556 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2340  histidine kinase  36.14 
 
 
487 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266723 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1972  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.24 
 
 
574 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0539187 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4096  histidine kinase  38.54 
 
 
604 aa  214  4.9999999999999996e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000005496 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  36.87 
 
 
1157 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  36.8 
 
 
1169 aa  214  4.9999999999999996e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  36.87 
 
 
1158 aa  214  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  34.92 
 
 
1161 aa  214  5.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0554  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 
675 aa  213  7e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71067  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3301  putative two-component sensor  35.66 
 
 
577 aa  211  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15238  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.39 
 
 
817 aa  211  5e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0699  signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 
744 aa  210  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.324444  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  32.94 
 
 
1145 aa  209  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3120  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.9 
 
 
554 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0189072  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1146 aa  209  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1146 aa  209  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4376  histidine kinase  37.65 
 
 
593 aa  209  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904194  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  33.73 
 
 
1146 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 
1146 aa  209  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6120  histidine kinase  38.42 
 
 
606 aa  208  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2352  histidine kinase  36.71 
 
 
441 aa  208  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 
1146 aa  208  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.55 
 
 
653 aa  208  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1792  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 
1146 aa  207  4e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103598  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.02 
 
 
1146 aa  207  6e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38740  putative two-component sensor  35.93 
 
 
594 aa  206  8e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.924619  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 
1169 aa  206  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2557  histidine kinase  32.61 
 
 
1142 aa  205  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257497  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3605  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.84 
 
 
610 aa  204  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796778  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.46 
 
 
1174 aa  204  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0106  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 
657 aa  203  6e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.816197  normal  0.0449615 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0508  histidine kinase  37.66 
 
 
663 aa  204  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.217821  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2881  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
632 aa  203  8e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.365727 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2078  sensor histidine kinase/response regulator  32.61 
 
 
1141 aa  203  8e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.45474  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.83 
 
 
1140 aa  203  9e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178694  hitchhiker  0.00103188 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 
1145 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3717  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.24 
 
 
663 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.143813 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.82 
 
 
1168 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 
1169 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.78 
 
 
1159 aa  200  9e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  36.12 
 
 
1150 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  35.93 
 
 
1169 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.24 
 
 
1171 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.22 
 
 
1172 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1470  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 
1140 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.38 
 
 
1168 aa  198  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2743  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  34.47 
 
 
611 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4564  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 
1169 aa  197  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519353  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1450  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 
548 aa  197  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000168793 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 
1167 aa  197  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  34.49 
 
 
1174 aa  197  7e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.73 
 
 
1316 aa  196  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0467  sensor histidine kinase  35.73 
 
 
758 aa  195  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.42 
 
 
561 aa  195  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
1177 aa  194  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3356  histidine kinase  36.59 
 
 
633 aa  193  9e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.38 
 
 
1152 aa  193  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3355  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.01 
 
 
880 aa  192  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607488  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5108  two-component sensor  31.34 
 
 
564 aa  192  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1575  histidine kinase  38.12 
 
 
777 aa  190  5.999999999999999e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.179984 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.66 
 
 
1169 aa  190  9e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2537  fused sensor protein/response regulator  30.77 
 
 
842 aa  189  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1300  histidine kinase  36.53 
 
 
468 aa  189  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0380592 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38970  putative two-component sensor  33.42 
 
 
881 aa  188  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.687207  normal  0.985828 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2593  hybrid histidine kinase  33.89 
 
 
477 aa  188  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1534  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1140 aa  187  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.254728  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1930  histidine kinase  34.74 
 
 
476 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.592963  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.33 
 
 
645 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.33 
 
 
635 aa  185  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>