More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1575 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1575  histidine kinase  100 
 
 		 777 aa  1530    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.179984 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0992  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.58 
 
 		 662 aa  261  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3301  putative two-component sensor  39.9 
 
 		 577 aa  241  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15238  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2571  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.71 
 
 		 634 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0964097 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0340  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.99 
 
 		 816 aa  232  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38740  putative two-component sensor  40.77 
 
 		 594 aa  232  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.924619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1150  signal transduction histidine kinase-like protein  41.18 
 
 		 609 aa  228  3e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2688  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.11 
 
 		 589 aa  228  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.69 
 
 		 621 aa  225  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481716  hitchhiker  0.00124548 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1972  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.53 
 
 		 574 aa  224  6e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0539187 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3120  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.46 
 
 		 554 aa  224  7e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0189072  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2352  histidine kinase  39.51 
 
 		 441 aa  222  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2880  signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 		 733 aa  219  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1526  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.65 
 
 		 733 aa  219  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0396333  normal  0.047905 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.6 
 
 		 1167 aa  216  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  35.83 
 
 		 1169 aa  216  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1450  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 548 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000168793 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0554  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.18 
 
 		 675 aa  214  5.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2939  histidine kinase  38.65 
 
 		 447 aa  214  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.012617 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2683  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 		 567 aa  213  9e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.259535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.57 
 
 		 733 aa  213  9e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0106  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.86 
 
 		 657 aa  213  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.816197  normal  0.0449615 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3079  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.73 
 
 		 556 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.6 
 
 		 1174 aa  212  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4096  histidine kinase  36.92 
 
 		 604 aa  212  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000005496 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6120  histidine kinase  39.54 
 
 		 606 aa  211  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3605  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.12 
 
 		 610 aa  211  5e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7668  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.97 
 
 		 571 aa  210  7e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3319  putative two-component sensor  36.15 
 
 		 868 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.71 
 
 		 817 aa  209  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38970  putative two-component sensor  36.67 
 
 		 881 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.687207  normal  0.985828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4194  histidine kinase  37.66 
 
 		 452 aa  208  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100725  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.35 
 
 		 653 aa  207  5e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0510  histidine kinase  37.05 
 
 		 629 aa  206  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5108  two-component sensor  35.11 
 
 		 564 aa  205  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3717  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 663 aa  205  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3951  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.7 
 
 		 540 aa  204  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252359  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1871  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.12 
 
 		 856 aa  204  6e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.49 
 
 		 1163 aa  204  7e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  34.37 
 
 		 1169 aa  203  9e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46370  putative two-component sensor  36.51 
 
 		 540 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304755  hitchhiker  0.00684988 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5189  Signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 539 aa  202  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 		 1168 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  34.45 
 
 		 1174 aa  201  3.9999999999999996e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  36.65 
 
 		 1150 aa  200  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3756  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.21 
 
 		 672 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.866154  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  34.94 
 
 		 1159 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.86 
 
 		 1152 aa  199  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4376  histidine kinase  37.44 
 
 		 593 aa  199  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904194  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  32 
 
 		 1161 aa  198  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2537  fused sensor protein/response regulator  34.95 
 
 		 842 aa  198  4.0000000000000005e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1300  histidine kinase  38.35 
 
 		 468 aa  197  7e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0380592 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.69 
 
 		 1159 aa  197  9e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  34.43 
 
 		 1159 aa  196  9e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.99 
 
 		 561 aa  196  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 		 1159 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3519  histidine kinase  39.66 
 
 		 448 aa  196  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0922492  normal  0.751112 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1814  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 		 662 aa  195  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0467  sensor histidine kinase  38.08 
 
 		 758 aa  195  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4855  putative two-component hybrid histidine kinase, periplasmic sensor  36.02 
 
 		 591 aa  194  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268249  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2327  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.09 
 
 		 591 aa  194  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693405 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 		 1152 aa  193  8e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.68675 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.98 
 
 		 1172 aa  193  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  32.13 
 
 		 1147 aa  193  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3356  histidine kinase  41.84 
 
 		 633 aa  192  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 		 1158 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.42 
 
 		 1171 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0010  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.04 
 
 		 884 aa  192  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0699  signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 744 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.324444  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 		 631 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.04 
 
 		 884 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.465168  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2335  histidine kinase  36.27 
 
 		 610 aa  191  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249479  normal  0.165398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1159 aa  191  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3355  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.94 
 
 		 880 aa  191  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1156 aa  190  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2340  histidine kinase  33.96 
 
 		 487 aa  190  8e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266723 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2922  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 		 883 aa  190  9e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301068 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 		 645 aa  190  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.68 
 
 		 1169 aa  190  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5115  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 		 609 aa  189  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0345398 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4849  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.82 
 
 		 655 aa  189  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0479308  normal  0.0448623 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  31.55 
 
 		 1177 aa  189  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1251  histidine kinase  35.71 
 
 		 477 aa  189  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0537245  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0898  sensor histidine kinase/response regulator  34.04 
 
 		 537 aa  188  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.535257  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1570  Signal transduction histidine kinase-like  31.65 
 
 		 666 aa  188  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.733845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3952  histidine kinase  34.34 
 
 		 747 aa  188  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.07 
 
 		 1172 aa  187  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6022  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  33.6 
 
 		 596 aa  187  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.277911  normal  0.668143 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3253  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 		 545 aa  187  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0508  histidine kinase  41.51 
 
 		 663 aa  187  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.217821  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2676  histidine kinase  36.27 
 
 		 676 aa  187  9e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00458174  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2664  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.86 
 
 		 655 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  31.45 
 
 		 1055 aa  186  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2593  hybrid histidine kinase  36.41 
 
 		 477 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2881  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 		 632 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.86 
 
 		 635 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2743  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  38.52 
 
 		 611 aa  186  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 		 1145 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.58 
 
 		 1445 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0068  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  32.74 
 
 		 1156 aa  185  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>