More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1570 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1570  Signal transduction histidine kinase-like  100 
 
 		 666 aa  1365    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.733845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1150  signal transduction histidine kinase-like protein  34.38 
 
 		 609 aa  228  4e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2571  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 		 634 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0964097 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 		 817 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3301  putative two-component sensor  32.73 
 
 		 577 aa  207  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15238  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3756  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.95 
 
 		 672 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.866154  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4855  putative two-component hybrid histidine kinase, periplasmic sensor  31.91 
 
 		 591 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268249  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0992  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.39 
 
 		 662 aa  197  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2688  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.42 
 
 		 589 aa  197  6e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1972  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.38 
 
 		 574 aa  197  7e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0539187 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38740  putative two-component sensor  32.47 
 
 		 594 aa  194  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.924619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.08 
 
 		 1172 aa  191  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.95 
 
 		 817 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3079  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.87 
 
 		 556 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.85 
 
 		 653 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3120  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.87 
 
 		 554 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0189072  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6120  histidine kinase  31.36 
 
 		 606 aa  184  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4376  histidine kinase  31.08 
 
 		 593 aa  182  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904194  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.12 
 
 		 1168 aa  182  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  28.74 
 
 		 1169 aa  182  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38970  putative two-component sensor  30.05 
 
 		 881 aa  182  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.687207  normal  0.985828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2683  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 		 567 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.259535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.71 
 
 		 1174 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.64 
 
 		 1316 aa  181  4.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.24 
 
 		 1152 aa  180  7e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.68675 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  30.49 
 
 		 1159 aa  180  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  30.38 
 
 		 1157 aa  180  8e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2939  histidine kinase  28.42 
 
 		 447 aa  179  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.012617 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  30.49 
 
 		 1159 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3319  putative two-component sensor  29.29 
 
 		 868 aa  179  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0106  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 		 657 aa  178  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.816197  normal  0.0449615 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.26 
 
 		 1167 aa  178  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2676  histidine kinase  30.07 
 
 		 676 aa  177  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00458174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4096  histidine kinase  32.02 
 
 		 604 aa  177  5e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000005496 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.79 
 
 		 1159 aa  177  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  29.86 
 
 		 1161 aa  177  7e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2246  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.85 
 
 		 854 aa  176  9e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00766594  normal  0.0928411 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.1 
 
 		 621 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481716  hitchhiker  0.00124548 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.1 
 
 		 1177 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7668  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.95 
 
 		 571 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0340  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.38 
 
 		 816 aa  175  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.53 
 
 		 1159 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.44 
 
 		 1158 aa  174  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.53 
 
 		 1159 aa  174  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4006  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.45 
 
 		 782 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0554  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.28 
 
 		 675 aa  173  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.91 
 
 		 1156 aa  172  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2593  hybrid histidine kinase  31.92 
 
 		 477 aa  171  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4194  histidine kinase  28.39 
 
 		 452 aa  171  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100725  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1251  histidine kinase  31.92 
 
 		 477 aa  170  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0537245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0699  signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 744 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.324444  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  26.54 
 
 		 1445 aa  169  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1300  histidine kinase  28.39 
 
 		 468 aa  169  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0380592 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.61 
 
 		 1172 aa  169  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2352  histidine kinase  29.1 
 
 		 441 aa  168  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3519  histidine kinase  29.24 
 
 		 448 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0922492  normal  0.751112 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1930  histidine kinase  28.74 
 
 		 476 aa  166  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.592963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00719  Multidomain protein contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  29.36 
 
 		 1147 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.93 
 
 		 1171 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1575  histidine kinase  31.67 
 
 		 777 aa  165  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.179984 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  29.87 
 
 		 1158 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6380  putative two-component sensor histidine kinase  28.86 
 
 		 596 aa  165  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.32 
 
 		 645 aa  165  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2340  histidine kinase  27.46 
 
 		 487 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266723 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  27.8 
 
 		 1177 aa  164  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  26.71 
 
 		 1148 aa  162  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  28.36 
 
 		 1055 aa  163  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  27.54 
 
 		 1147 aa  162  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.14 
 
 		 1163 aa  162  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2664  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.32 
 
 		 655 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0510  histidine kinase  28.04 
 
 		 629 aa  161  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2335  histidine kinase  29.35 
 
 		 610 aa  161  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249479  normal  0.165398 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2314  histidine kinase  26.07 
 
 		 487 aa  161  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.421015  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.35 
 
 		 631 aa  161  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.06 
 
 		 635 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.64 
 
 		 1169 aa  160  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.89 
 
 		 1145 aa  160  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3356  histidine kinase  26.5 
 
 		 633 aa  160  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.83 
 
 		 733 aa  160  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.91 
 
 		 1146 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1882  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  28.53 
 
 		 854 aa  158  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0508  histidine kinase  31 
 
 		 663 aa  159  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.217821  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.03 
 
 		 1146 aa  159  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02398  sensor histidine kinase  26.46 
 
 		 881 aa  158  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2537  fused sensor protein/response regulator  28.68 
 
 		 842 aa  158  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1765  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.49 
 
 		 586 aa  158  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316397  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  26.62 
 
 		 1174 aa  157  6e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4564  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.9 
 
 		 1169 aa  157  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.84 
 
 		 1170 aa  157  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4027  histidine kinase  34.6 
 
 		 471 aa  156  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0361881  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  25.43 
 
 		 1146 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.43 
 
 		 1146 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.43 
 
 		 1146 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5115  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 609 aa  156  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0345398 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1792  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.43 
 
 		 1146 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103598  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4705  sensor histidine kinase CorS  36.32 
 
 		 491 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226442  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2881  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.87 
 
 		 632 aa  155  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365727 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1871  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 856 aa  155  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1926  ATPase domain-containing protein  27.7 
 
 		 454 aa  155  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.82384 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2202  histidine kinase  27.7 
 
 		 447 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>