More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6380 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6380  putative two-component sensor histidine kinase  100 
 
 		 596 aa  1190    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0992  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.85 
 
 		 662 aa  224  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6120  histidine kinase  38.3 
 
 		 606 aa  219  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 		 653 aa  216  7e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0340  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.5 
 
 		 816 aa  210  7e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.76 
 
 		 817 aa  207  4e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2571  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.99 
 
 		 634 aa  203  6e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0964097 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 		 621 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481716  hitchhiker  0.00124548 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4855  putative two-component hybrid histidine kinase, periplasmic sensor  31.16 
 
 		 591 aa  196  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268249  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4376  histidine kinase  33.42 
 
 		 593 aa  194  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904194  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.47 
 
 		 1172 aa  191  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.87 
 
 		 1152 aa  191  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.68675 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.16 
 
 		 631 aa  190  5e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2335  histidine kinase  31.16 
 
 		 610 aa  190  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249479  normal  0.165398 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3519  histidine kinase  33.7 
 
 		 448 aa  189  9e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0922492  normal  0.751112 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0554  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.88 
 
 		 675 aa  189  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71067  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2456  composite two-component regulatory (sensor kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  33.33 
 
 		 638 aa  187  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1150  signal transduction histidine kinase-like protein  31.52 
 
 		 609 aa  187  5e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2881  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 		 632 aa  186  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365727 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.61 
 
 		 1445 aa  186  8e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2688  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.68 
 
 		 589 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2939  histidine kinase  32.17 
 
 		 447 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.012617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4194  histidine kinase  32.17 
 
 		 452 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100725  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1814  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.76 
 
 		 662 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.04 
 
 		 1145 aa  181  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2340  histidine kinase  31.73 
 
 		 487 aa  179  9e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266723 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4096  histidine kinase  33.61 
 
 		 604 aa  179  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000005496 
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  33.79 
 
 		 1174 aa  179  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.14 
 
 		 1167 aa  179  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4849  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 		 655 aa  179  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0479308  normal  0.0448623 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0508  histidine kinase  33.84 
 
 		 663 aa  178  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.217821  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3756  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 		 672 aa  177  7e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.866154  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0510  histidine kinase  33.16 
 
 		 629 aa  176  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2078  sensor histidine kinase/response regulator  32.64 
 
 		 1141 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.45474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.52 
 
 		 1174 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2743  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  33.6 
 
 		 611 aa  174  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2683  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.52 
 
 		 567 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.259535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2202  histidine kinase  36.2 
 
 		 447 aa  172  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1926  ATPase domain-containing protein  35.94 
 
 		 454 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.82384 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1300  histidine kinase  33.25 
 
 		 468 aa  172  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0380592 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7668  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.84 
 
 		 571 aa  171  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.12 
 
 		 1138 aa  171  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  31.27 
 
 		 1150 aa  168  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3079  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.65 
 
 		 556 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1792  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 		 1146 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.75 
 
 		 1168 aa  167  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 		 1146 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 		 1146 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3717  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.53 
 
 		 663 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143813 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1817  histidine kinase  35.84 
 
 		 454 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 		 1163 aa  167  6.9999999999999995e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  29.6 
 
 		 1146 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.63 
 
 		 1145 aa  166  8e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5115  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.66 
 
 		 609 aa  166  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0345398 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0472  histidine kinase  31.56 
 
 		 598 aa  166  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2557  histidine kinase  29.78 
 
 		 1142 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257497  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  28.54 
 
 		 1145 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3605  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 		 610 aa  165  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1570  Signal transduction histidine kinase-like  28.86 
 
 		 666 aa  165  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.733845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3120  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.63 
 
 		 554 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0189072  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2246  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.93 
 
 		 854 aa  165  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00766594  normal  0.0928411 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.54 
 
 		 1146 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4361  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.41 
 
 		 625 aa  164  6e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 		 1169 aa  163  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 		 1172 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.83 
 
 		 1316 aa  162  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1534  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 		 1140 aa  163  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.254728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0265  sensor histidine kinase  32.63 
 
 		 697 aa  162  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2880  signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 733 aa  162  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1526  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.89 
 
 		 733 aa  162  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0396333  normal  0.047905 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  29.14 
 
 		 1169 aa  162  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.36 
 
 		 1146 aa  162  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2698  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.89 
 
 		 595 aa  161  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.155122 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.42 
 
 		 1152 aa  161  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.36 
 
 		 1146 aa  161  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0106  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.48 
 
 		 657 aa  160  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.816197  normal  0.0449615 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3952  histidine kinase  32.34 
 
 		 747 aa  160  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.28 
 
 		 1159 aa  160  9e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 		 1169 aa  159  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2676  histidine kinase  30.77 
 
 		 676 aa  158  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00458174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 		 1177 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2060  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.06 
 
 		 1111 aa  158  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.749505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.62 
 
 		 1169 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  30.71 
 
 		 1159 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1882  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  27.78 
 
 		 854 aa  157  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1470  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.61 
 
 		 1140 aa  156  8e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  30.71 
 
 		 1159 aa  156  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.18 
 
 		 645 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4705  sensor histidine kinase CorS  30.73 
 
 		 491 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226442  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  30.35 
 
 		 1169 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00719  Multidomain protein contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  29.53 
 
 		 1147 aa  155  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 		 1171 aa  155  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.83 
 
 		 1159 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3356  histidine kinase  30.69 
 
 		 633 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.41 
 
 		 733 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.61 
 
 		 1159 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1972  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.24 
 
 		 574 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0539187 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2352  histidine kinase  31.27 
 
 		 441 aa  152  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  27.02 
 
 		 1147 aa  152  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1765  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 		 586 aa  152  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316397  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>