More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4361 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4361  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
625 aa  1238    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5981  histidine kinase  48.56 
 
 
619 aa  454  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.149513 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3590  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.07 
 
 
594 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 
631 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2335  histidine kinase  36.38 
 
 
610 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249479  normal  0.165398 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2881  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.07 
 
 
632 aa  306  9.000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.365727 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2456  composite two-component regulatory (sensor kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  35.97 
 
 
638 aa  303  6.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2743  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  35.07 
 
 
611 aa  279  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0992  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 
662 aa  224  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2688  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.33 
 
 
589 aa  207  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1150  signal transduction histidine kinase-like protein  30.56 
 
 
609 aa  200  5e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4855  putative two-component hybrid histidine kinase, periplasmic sensor  31.23 
 
 
591 aa  196  9e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268249  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2880  signal transduction histidine kinase  36.83 
 
 
733 aa  194  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0340  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.38 
 
 
816 aa  194  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1526  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.83 
 
 
733 aa  194  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0396333  normal  0.047905 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.99 
 
 
653 aa  189  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1814  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.99 
 
 
662 aa  189  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2571  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 
634 aa  189  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0964097 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4849  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.92 
 
 
655 aa  188  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0479308  normal  0.0448623 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.46 
 
 
1445 aa  187  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1930  histidine kinase  36.43 
 
 
476 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.592963  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7668  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.78 
 
 
571 aa  182  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  34.08 
 
 
1150 aa  182  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.28 
 
 
1172 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.37 
 
 
733 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  34.51 
 
 
1169 aa  180  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0510  histidine kinase  33.98 
 
 
629 aa  179  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4096  histidine kinase  34.76 
 
 
604 aa  179  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000005496 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.92 
 
 
1152 aa  178  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1251  histidine kinase  36.02 
 
 
477 aa  178  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0537245  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2939  histidine kinase  33.5 
 
 
447 aa  177  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.012617 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2922  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.63 
 
 
883 aa  177  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.301068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6380  putative two-component sensor histidine kinase  28.16 
 
 
596 aa  176  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3756  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.93 
 
 
672 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.866154  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  31.46 
 
 
1055 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2627  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.75 
 
 
1116 aa  174  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594612  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.92 
 
 
621 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481716  hitchhiker  0.00124548 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  30.43 
 
 
1177 aa  173  6.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2593  hybrid histidine kinase  35.44 
 
 
477 aa  173  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1575  histidine kinase  34.94 
 
 
777 aa  172  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.179984 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5115  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 
609 aa  172  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0345398 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02398  sensor histidine kinase  35.34 
 
 
881 aa  171  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3319  putative two-component sensor  32.25 
 
 
868 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5108  two-component sensor  32.29 
 
 
564 aa  171  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4194  histidine kinase  33.42 
 
 
452 aa  171  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100725  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3605  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 
610 aa  170  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796778  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0554  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.41 
 
 
675 aa  170  7e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71067  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0508  histidine kinase  34.96 
 
 
663 aa  170  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.217821  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  29.54 
 
 
1148 aa  170  8e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3952  histidine kinase  37.58 
 
 
747 aa  170  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.84 
 
 
1172 aa  168  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  31.23 
 
 
1159 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6120  histidine kinase  34.13 
 
 
606 aa  168  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  33.08 
 
 
1169 aa  167  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3301  putative two-component sensor  33.25 
 
 
577 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15238  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.87 
 
 
1169 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.2 
 
 
1152 aa  167  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.68675 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  30.99 
 
 
1159 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1450  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 
548 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000168793 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.79 
 
 
1169 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  29.78 
 
 
1147 aa  164  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3717  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.86 
 
 
663 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.143813 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38970  putative two-component sensor  31.5 
 
 
881 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.687207  normal  0.985828 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2676  histidine kinase  33.33 
 
 
676 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00458174  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4376  histidine kinase  31.12 
 
 
593 aa  164  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904194  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0467  sensor histidine kinase  32.96 
 
 
758 aa  163  7e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0999  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 
486 aa  163  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000325597 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3355  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.12 
 
 
880 aa  162  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607488  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  32 
 
 
1161 aa  162  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0010  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 
884 aa  162  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 
884 aa  162  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.465168  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1300  histidine kinase  34.16 
 
 
468 aa  161  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0380592 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4564  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.61 
 
 
1169 aa  161  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519353  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.56 
 
 
1138 aa  160  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0106  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.1 
 
 
657 aa  160  6e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.816197  normal  0.0449615 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38740  putative two-component sensor  34.35 
 
 
594 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.924619  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  30.46 
 
 
1157 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 
1156 aa  159  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1972  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.46 
 
 
574 aa  159  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0539187 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 
1169 aa  159  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2537  fused sensor protein/response regulator  28.26 
 
 
842 aa  159  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.23 
 
 
1168 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 
1170 aa  157  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0291  sensor histidine kinase  32.12 
 
 
545 aa  157  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.31 
 
 
1171 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3356  histidine kinase  36.86 
 
 
633 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2340  histidine kinase  32.76 
 
 
487 aa  157  6e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266723 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3519  histidine kinase  34.65 
 
 
448 aa  156  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0922492  normal  0.751112 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.44 
 
 
1163 aa  156  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1882  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  28.25 
 
 
854 aa  155  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  29.16 
 
 
1145 aa  155  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1351  histidine kinase  31.76 
 
 
596 aa  155  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57626  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1570  Signal transduction histidine kinase-like  28.68 
 
 
666 aa  155  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.733845  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.87 
 
 
645 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  31.11 
 
 
1158 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  30 
 
 
882 aa  154  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1817  histidine kinase  34.92 
 
 
454 aa  154  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1470  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.19 
 
 
1140 aa  153  8.999999999999999e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1926  ATPase domain-containing protein  34.36 
 
 
454 aa  153  8.999999999999999e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.82384 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0262  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.87 
 
 
545 aa  153  8.999999999999999e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.446369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>