More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5981 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5981  histidine kinase  100 
 
 		 619 aa  1211    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149513 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4361  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  49 
 
 		 625 aa  477  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3590  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.59 
 
 		 594 aa  332  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2881  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 		 632 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365727 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2743  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  37.25 
 
 		 611 aa  281  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2335  histidine kinase  35.12 
 
 		 610 aa  280  6e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249479  normal  0.165398 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.12 
 
 		 631 aa  280  7e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2456  composite two-component regulatory (sensor kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  38.24 
 
 		 638 aa  276  6e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0992  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 		 662 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2688  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.07 
 
 		 589 aa  184  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2571  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.82 
 
 		 634 aa  176  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0964097 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4096  histidine kinase  35.31 
 
 		 604 aa  175  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000005496 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1150  signal transduction histidine kinase-like protein  29.68 
 
 		 609 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3301  putative two-component sensor  35.31 
 
 		 577 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15238  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02398  sensor histidine kinase  35.4 
 
 		 881 aa  172  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4855  putative two-component hybrid histidine kinase, periplasmic sensor  31.68 
 
 		 591 aa  171  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268249  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1972  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.87 
 
 		 574 aa  171  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0539187 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2922  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.34 
 
 		 883 aa  171  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301068 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1575  histidine kinase  31.14 
 
 		 777 aa  170  7e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.179984 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 		 1172 aa  170  7e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38970  putative two-component sensor  34.76 
 
 		 881 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.687207  normal  0.985828 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0508  histidine kinase  35.78 
 
 		 663 aa  168  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.217821  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0340  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.8 
 
 		 816 aa  167  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.08 
 
 		 635 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3319  putative two-component sensor  33.98 
 
 		 868 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.12 
 
 		 621 aa  166  9e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481716  hitchhiker  0.00124548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 		 645 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.41 
 
 		 653 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3355  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.46 
 
 		 880 aa  164  6e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607488  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2683  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.49 
 
 		 567 aa  163  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.259535  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1882  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  28.97 
 
 		 854 aa  163  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2537  fused sensor protein/response regulator  30.92 
 
 		 842 aa  163  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2352  histidine kinase  33.64 
 
 		 441 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.91 
 
 		 1445 aa  162  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3079  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.49 
 
 		 556 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  30.12 
 
 		 1148 aa  160  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3756  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.76 
 
 		 672 aa  160  6e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.866154  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1814  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.18 
 
 		 662 aa  160  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2664  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.86 
 
 		 655 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7668  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 		 571 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0106  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.65 
 
 		 657 aa  157  5.0000000000000005e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.816197  normal  0.0449615 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0010  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 		 884 aa  157  7e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 		 884 aa  156  8e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.465168  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  34.21 
 
 		 1159 aa  156  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.09 
 
 		 1152 aa  156  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.68675 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4849  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.79 
 
 		 655 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0479308  normal  0.0448623 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3952  histidine kinase  31.47 
 
 		 747 aa  156  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  28.4 
 
 		 1177 aa  156  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1526  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.04 
 
 		 733 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0396333  normal  0.047905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  34.21 
 
 		 1159 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1300  histidine kinase  33.26 
 
 		 468 aa  155  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0380592 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2880  signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 733 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.01 
 
 		 1172 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  29.2 
 
 		 1055 aa  155  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38740  putative two-component sensor  34.47 
 
 		 594 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.924619  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0510  histidine kinase  34.45 
 
 		 629 aa  154  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4376  histidine kinase  29.7 
 
 		 593 aa  154  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904194  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2078  sensor histidine kinase/response regulator  31.19 
 
 		 1141 aa  154  5e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.45474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3120  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 		 554 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0189072  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  33.25 
 
 		 1157 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1570  Signal transduction histidine kinase-like  30.92 
 
 		 666 aa  153  8e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.733845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0554  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 675 aa  153  8.999999999999999e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2593  hybrid histidine kinase  33.42 
 
 		 477 aa  153  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 		 733 aa  153  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1251  histidine kinase  33.17 
 
 		 477 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0537245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  31.05 
 
 		 1147 aa  152  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6380  putative two-component sensor histidine kinase  26.57 
 
 		 596 aa  152  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  27.2 
 
 		 1168 aa  151  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0291  sensor histidine kinase  30.57 
 
 		 545 aa  151  3e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0262  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.68 
 
 		 545 aa  150  5e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.446369  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.62 
 
 		 1156 aa  150  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0472  histidine kinase  35.32 
 
 		 598 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1930  histidine kinase  32.67 
 
 		 476 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.592963  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 		 1159 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  30.51 
 
 		 582 aa  148  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.44 
 
 		 1138 aa  148  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.61 
 
 		 1323 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.41 
 
 		 1159 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2246  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.79 
 
 		 854 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00766594  normal  0.0928411 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  32.95 
 
 		 1158 aa  146  9e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 770 aa  146  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 		 1158 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  32.37 
 
 		 1161 aa  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.67 
 
 		 1171 aa  145  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2676  histidine kinase  30.7 
 
 		 676 aa  145  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00458174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6120  histidine kinase  32.13 
 
 		 606 aa  145  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.1 
 
 		 1159 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  32.6 
 
 		 1150 aa  145  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.36 
 
 		 1163 aa  145  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00719  Multidomain protein contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  28.82 
 
 		 1147 aa  144  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2340  histidine kinase  30.41 
 
 		 487 aa  144  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266723 
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  29.17 
 
 		 1174 aa  144  5e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.18 
 
 		 922 aa  144  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3951  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 		 540 aa  144  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252359  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.59 
 
 		 1146 aa  144  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46370  putative two-component sensor  31.33 
 
 		 540 aa  143  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304755  hitchhiker  0.00684988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.72 
 
 		 1177 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3460  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.67 
 
 		 1175 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.549126 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2939  histidine kinase  30.94 
 
 		 447 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.012617 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3284  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.92 
 
 		 1168 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.431447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>