More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3590 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3590  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 594 aa  1219    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4361  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.06 
 
 		 625 aa  381  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2881  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.26 
 
 		 632 aa  313  4.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365727 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2335  histidine kinase  34.06 
 
 		 610 aa  307  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249479  normal  0.165398 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.06 
 
 		 631 aa  307  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2456  composite two-component regulatory (sensor kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  34.13 
 
 		 638 aa  302  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5981  histidine kinase  36.93 
 
 		 619 aa  292  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149513 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2743  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  34.95 
 
 		 611 aa  291  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0992  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.03 
 
 		 662 aa  231  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0508  histidine kinase  34.91 
 
 		 663 aa  193  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.217821  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5115  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.31 
 
 		 609 aa  192  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0345398 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4849  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.01 
 
 		 655 aa  190  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0479308  normal  0.0448623 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1814  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.94 
 
 		 662 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 653 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4855  putative two-component hybrid histidine kinase, periplasmic sensor  32.3 
 
 		 591 aa  183  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268249  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0340  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.85 
 
 		 816 aa  179  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0554  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.08 
 
 		 675 aa  179  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1150  signal transduction histidine kinase-like protein  32.89 
 
 		 609 aa  178  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3605  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.4 
 
 		 610 aa  174  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.3 
 
 		 1169 aa  172  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.18 
 
 		 1445 aa  169  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.26 
 
 		 1169 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2571  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.65 
 
 		 634 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0964097 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.59 
 
 		 1156 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0510  histidine kinase  31.89 
 
 		 629 aa  165  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.51 
 
 		 1168 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.67 
 
 		 1169 aa  165  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  31.03 
 
 		 1161 aa  164  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  30.85 
 
 		 1169 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2537  fused sensor protein/response regulator  29.58 
 
 		 842 aa  164  5.0000000000000005e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.89 
 
 		 1172 aa  164  6e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4376  histidine kinase  26.97 
 
 		 593 aa  163  9e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904194  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  29.9 
 
 		 1157 aa  163  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0467  sensor histidine kinase  30.83 
 
 		 758 aa  162  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0106  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.43 
 
 		 657 aa  161  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.816197  normal  0.0449615 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.02 
 
 		 1152 aa  161  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4564  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.64 
 
 		 1169 aa  161  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3319  putative two-component sensor  31.2 
 
 		 868 aa  160  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  31.49 
 
 		 1159 aa  160  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  31.97 
 
 		 1159 aa  160  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7668  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.75 
 
 		 571 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.57 
 
 		 621 aa  159  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481716  hitchhiker  0.00124548 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  30.1 
 
 		 1158 aa  158  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4096  histidine kinase  28.89 
 
 		 604 aa  157  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000005496 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38970  putative two-component sensor  30.36 
 
 		 881 aa  156  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.687207  normal  0.985828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.72 
 
 		 1172 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6120  histidine kinase  28.71 
 
 		 606 aa  155  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3717  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.43 
 
 		 663 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143813 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3756  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 		 672 aa  154  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.866154  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.05 
 
 		 1152 aa  154  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.68675 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2688  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.05 
 
 		 589 aa  154  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.47 
 
 		 1158 aa  153  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2327  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.91 
 
 		 591 aa  152  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693405 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0262  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.19 
 
 		 545 aa  152  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.446369  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.47 
 
 		 1145 aa  152  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.11 
 
 		 1138 aa  152  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.65 
 
 		 1159 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.11 
 
 		 1159 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2922  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 		 883 aa  150  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301068 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  28.75 
 
 		 1150 aa  150  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 		 817 aa  150  8e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2352  histidine kinase  31.05 
 
 		 441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1575  histidine kinase  30.6 
 
 		 777 aa  149  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.179984 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1351  histidine kinase  29.93 
 
 		 596 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57626  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4194  histidine kinase  29.22 
 
 		 452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100725  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0291  sensor histidine kinase  28.71 
 
 		 545 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1882  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  28.13 
 
 		 854 aa  149  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3355  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.4 
 
 		 880 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.4 
 
 		 1159 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2060  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.49 
 
 		 1111 aa  148  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.749505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5108  two-component sensor  28.65 
 
 		 564 aa  147  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02398  sensor histidine kinase  29.9 
 
 		 881 aa  147  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 645 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2340  histidine kinase  29.98 
 
 		 487 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266723 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3301  putative two-component sensor  28.35 
 
 		 577 aa  146  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15238  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.3 
 
 		 1177 aa  146  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2627  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.64 
 
 		 1116 aa  146  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594612  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1871  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.5 
 
 		 856 aa  146  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1930  histidine kinase  29.19 
 
 		 476 aa  146  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.592963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.63 
 
 		 1407 aa  145  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1526  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.14 
 
 		 733 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0396333  normal  0.047905 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2880  signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 733 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4041  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.71 
 
 		 543 aa  145  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.89 
 
 		 1159 aa  144  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4705  sensor histidine kinase CorS  33.33 
 
 		 491 aa  144  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226442  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.82 
 
 		 1140 aa  144  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178694  hitchhiker  0.00103188 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2593  hybrid histidine kinase  29.47 
 
 		 477 aa  144  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.65 
 
 		 1174 aa  143  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3366  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.17 
 
 		 762 aa  143  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38740  putative two-component sensor  29.7 
 
 		 594 aa  143  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.924619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1450  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.9 
 
 		 548 aa  143  8e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000168793 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  27.27 
 
 		 1169 aa  143  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.64 
 
 		 1316 aa  143  9e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.99 
 
 		 635 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1300  histidine kinase  28.99 
 
 		 468 aa  142  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0380592 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3951  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.65 
 
 		 540 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252359  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  28.69 
 
 		 1174 aa  142  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2939  histidine kinase  27.7 
 
 		 447 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.012617 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  29.5 
 
 		 582 aa  142  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6380  putative two-component sensor histidine kinase  28.08 
 
 		 596 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>