More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0106 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0106  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 657 aa  1324    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.816197  normal  0.0449615 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4855  putative two-component hybrid histidine kinase, periplasmic sensor  41.67 
 
 		 591 aa  342  9e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268249  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.78 
 
 		 621 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481716  hitchhiker  0.00124548 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2688  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.89 
 
 		 589 aa  311  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0992  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.61 
 
 		 662 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1150  signal transduction histidine kinase-like protein  35.06 
 
 		 609 aa  248  4e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6120  histidine kinase  37.74 
 
 		 606 aa  245  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4376  histidine kinase  34.71 
 
 		 593 aa  235  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904194  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3756  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.73 
 
 		 672 aa  228  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.866154  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4849  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 		 655 aa  226  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0479308  normal  0.0448623 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4705  sensor histidine kinase CorS  49.58 
 
 		 491 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226442  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2571  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.06 
 
 		 634 aa  220  7e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0964097 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1814  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 		 662 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.59 
 
 		 653 aa  217  5e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5115  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.05 
 
 		 609 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0345398 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.86 
 
 		 817 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.81 
 
 		 1172 aa  210  6e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.81 
 
 		 635 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0554  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 		 675 aa  207  6e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.24 
 
 		 645 aa  207  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1450  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 548 aa  206  9e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000168793 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3356  histidine kinase  39.9 
 
 		 633 aa  206  9e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4096  histidine kinase  36.13 
 
 		 604 aa  206  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000005496 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1575  histidine kinase  37.7 
 
 		 777 aa  206  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.179984 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.01 
 
 		 1316 aa  206  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0340  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.38 
 
 		 816 aa  206  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1300  histidine kinase  38.89 
 
 		 468 aa  204  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0380592 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  34.39 
 
 		 1147 aa  204  4e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3301  putative two-component sensor  36.23 
 
 		 577 aa  204  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15238  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2664  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.24 
 
 		 655 aa  204  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1972  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 		 574 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0539187 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2340  histidine kinase  36.87 
 
 		 487 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266723 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3319  putative two-component sensor  37.17 
 
 		 868 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0510  histidine kinase  34.24 
 
 		 629 aa  201  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.26 
 
 		 1167 aa  200  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4194  histidine kinase  36.55 
 
 		 452 aa  200  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100725  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2939  histidine kinase  36.69 
 
 		 447 aa  200  7.999999999999999e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.012617 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2683  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.13 
 
 		 567 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.259535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.52 
 
 		 1152 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.5 
 
 		 1145 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38970  putative two-component sensor  37.08 
 
 		 881 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.687207  normal  0.985828 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3605  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.04 
 
 		 610 aa  197  6e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.81 
 
 		 1146 aa  197  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 		 1168 aa  196  8.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2352  histidine kinase  34.78 
 
 		 441 aa  196  8.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.75 
 
 		 1145 aa  196  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.66 
 
 		 1146 aa  196  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0508  histidine kinase  36.3 
 
 		 663 aa  195  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.217821  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5189  Signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 539 aa  195  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.42 
 
 		 1146 aa  194  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.51 
 
 		 1177 aa  194  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  33.25 
 
 		 1145 aa  193  8e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1570  Signal transduction histidine kinase-like  32.81 
 
 		 666 aa  192  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.733845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3120  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.27 
 
 		 554 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0189072  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 		 1172 aa  192  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3079  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 		 556 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38740  putative two-component sensor  36.52 
 
 		 594 aa  191  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.924619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  33 
 
 		 1146 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33 
 
 		 1146 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  34.11 
 
 		 1169 aa  190  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.16 
 
 		 1174 aa  189  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1792  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.75 
 
 		 1146 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.75 
 
 		 1146 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.16 
 
 		 1163 aa  188  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  33.75 
 
 		 1159 aa  188  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  33.5 
 
 		 1159 aa  187  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.9 
 
 		 1169 aa  186  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  32.41 
 
 		 1177 aa  186  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.26 
 
 		 1170 aa  186  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2456  composite two-component regulatory (sensor kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  30.21 
 
 		 638 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.84 
 
 		 1140 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178694  hitchhiker  0.00103188 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  33.25 
 
 		 1161 aa  186  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.98 
 
 		 631 aa  186  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2537  fused sensor protein/response regulator  32.38 
 
 		 842 aa  186  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1871  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 		 856 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2335  histidine kinase  30.98 
 
 		 610 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249479  normal  0.165398 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  33.91 
 
 		 1150 aa  184  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  33.25 
 
 		 1169 aa  184  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0699  signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 		 744 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.324444  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.16 
 
 		 1159 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.76 
 
 		 1156 aa  184  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.81 
 
 		 1445 aa  183  8.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5108  two-component sensor  32.73 
 
 		 564 aa  183  9.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0265  sensor histidine kinase  40 
 
 		 697 aa  182  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7668  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.66 
 
 		 571 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.15 
 
 		 1169 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.84 
 
 		 1152 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.68675 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1251  histidine kinase  34.74 
 
 		 477 aa  181  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0537245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2327  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.62 
 
 		 591 aa  181  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693405 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.75 
 
 		 561 aa  181  5.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2676  histidine kinase  32.32 
 
 		 676 aa  180  7e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00458174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2593  hybrid histidine kinase  34.49 
 
 		 477 aa  180  8e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2078  sensor histidine kinase/response regulator  33.33 
 
 		 1141 aa  180  8e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.45474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2060  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.19 
 
 		 1111 aa  179  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.749505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2881  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.76 
 
 		 632 aa  179  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365727 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  32.3 
 
 		 1055 aa  179  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  33.68 
 
 		 1174 aa  179  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  33.5 
 
 		 1157 aa  179  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  32.66 
 
 		 1148 aa  179  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0563  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.34 
 
 		 591 aa  177  5e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>