More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0563 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0563  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 591 aa  1207    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0992  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.79 
 
 		 662 aa  213  9e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4096  histidine kinase  30.34 
 
 		 604 aa  200  5e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000005496 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1150  signal transduction histidine kinase-like protein  30.77 
 
 		 609 aa  199  9e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.25 
 
 		 1169 aa  198  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2688  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.37 
 
 		 589 aa  195  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2571  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.87 
 
 		 634 aa  194  4e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0964097 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.15 
 
 		 1169 aa  193  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  33.42 
 
 		 1169 aa  192  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6120  histidine kinase  29.8 
 
 		 606 aa  189  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 		 1168 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.89 
 
 		 1169 aa  189  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4564  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.35 
 
 		 1169 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3717  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.06 
 
 		 663 aa  182  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143813 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0554  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.47 
 
 		 675 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4855  putative two-component hybrid histidine kinase, periplasmic sensor  26.8 
 
 		 591 aa  181  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268249  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.34 
 
 		 561 aa  178  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2880  signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 733 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1526  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.65 
 
 		 733 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0396333  normal  0.047905 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1814  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.07 
 
 		 662 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 		 1163 aa  173  5.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4194  histidine kinase  32.29 
 
 		 452 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100725  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0106  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.95 
 
 		 657 aa  173  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.816197  normal  0.0449615 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1575  histidine kinase  30.47 
 
 		 777 aa  173  7.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.179984 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0340  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.24 
 
 		 816 aa  172  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4376  histidine kinase  28.54 
 
 		 593 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904194  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.87 
 
 		 817 aa  172  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2352  histidine kinase  30.27 
 
 		 441 aa  172  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.19 
 
 		 1177 aa  171  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.73 
 
 		 1172 aa  170  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  30.25 
 
 		 1174 aa  170  8e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3756  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.31 
 
 		 672 aa  169  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.866154  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3356  histidine kinase  29.5 
 
 		 633 aa  169  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3605  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.6 
 
 		 610 aa  168  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4849  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 655 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0479308  normal  0.0448623 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.98 
 
 		 621 aa  167  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481716  hitchhiker  0.00124548 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5115  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.7 
 
 		 609 aa  167  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0345398 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3319  putative two-component sensor  31.79 
 
 		 868 aa  167  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.46 
 
 		 1174 aa  167  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.49 
 
 		 1167 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.53 
 
 		 733 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38970  putative two-component sensor  31.25 
 
 		 881 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.687207  normal  0.985828 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2939  histidine kinase  29.63 
 
 		 447 aa  165  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.012617 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  31.12 
 
 		 1169 aa  164  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.27 
 
 		 1170 aa  163  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 		 635 aa  163  9e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.77 
 
 		 1145 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2683  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.73 
 
 		 567 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.259535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.05 
 
 		 1171 aa  162  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0508  histidine kinase  26.91 
 
 		 663 aa  161  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.217821  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2327  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.25 
 
 		 591 aa  161  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693405 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.09 
 
 		 631 aa  161  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3253  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.05 
 
 		 545 aa  160  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5189  Signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 		 539 aa  160  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2335  histidine kinase  26.09 
 
 		 610 aa  160  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249479  normal  0.165398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.85 
 
 		 645 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2456  composite two-component regulatory (sensor kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  25.96 
 
 		 638 aa  160  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  32.82 
 
 		 968 aa  160  7e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1930  histidine kinase  28.68 
 
 		 476 aa  160  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.592963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2676  histidine kinase  30.39 
 
 		 676 aa  159  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00458174  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2664  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 		 655 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0265  sensor histidine kinase  37.5 
 
 		 697 aa  158  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1251  histidine kinase  28.12 
 
 		 477 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0537245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2593  hybrid histidine kinase  28.12 
 
 		 477 aa  159  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.33 
 
 		 1172 aa  158  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  29.55 
 
 		 1445 aa  158  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46370  putative two-component sensor  29.07 
 
 		 540 aa  158  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304755  hitchhiker  0.00684988 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  27.76 
 
 		 1159 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3079  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.87 
 
 		 556 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  27.27 
 
 		 1159 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.32 
 
 		 1316 aa  156  8e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3952  histidine kinase  31.11 
 
 		 747 aa  156  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3951  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.33 
 
 		 540 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252359  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0898  sensor histidine kinase/response regulator  29.78 
 
 		 537 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.535257  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7668  GAF sensor hybrid histidine kinase  25.35 
 
 		 571 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4027  histidine kinase  27.7 
 
 		 471 aa  155  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0361881  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2202  histidine kinase  29.68 
 
 		 447 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3301  putative two-component sensor  29.49 
 
 		 577 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15238  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1926  ATPase domain-containing protein  30.61 
 
 		 454 aa  154  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.82384 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6380  putative two-component sensor histidine kinase  30.11 
 
 		 596 aa  154  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1450  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.44 
 
 		 548 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000168793 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1972  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 574 aa  153  8e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0539187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3519  histidine kinase  29.75 
 
 		 448 aa  153  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0922492  normal  0.751112 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2060  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.98 
 
 		 1111 aa  152  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.749505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3120  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.73 
 
 		 554 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0189072  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2881  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.48 
 
 		 632 aa  152  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365727 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2627  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.55 
 
 		 1116 aa  151  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594612  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.92 
 
 		 1138 aa  151  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1300  histidine kinase  28.61 
 
 		 468 aa  150  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0380592 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.16 
 
 		 1168 aa  150  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0653  sensor histidine kinase  28.97 
 
 		 1124 aa  150  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.450749  normal  0.469118 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1570  Signal transduction histidine kinase-like  28.16 
 
 		 666 aa  150  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.733845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.22 
 
 		 653 aa  150  9e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00719  Multidomain protein contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  28.91 
 
 		 1147 aa  150  9e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  29.72 
 
 		 1157 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0699  signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 744 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.324444  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  31.91 
 
 		 853 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0510  histidine kinase  27.47 
 
 		 629 aa  149  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4203  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.73 
 
 		 520 aa  149  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.118856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.4 
 
 		 1156 aa  148  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>