More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1450 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1450  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 548 aa  1086    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000168793 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5108  two-component sensor  66.23 
 
 		 564 aa  691    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5189  Signal transduction histidine kinase  55.87 
 
 		 539 aa  570  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4041  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  50.09 
 
 		 543 aa  504  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3951  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  51.23 
 
 		 540 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252359  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46370  putative two-component sensor  48.43 
 
 		 540 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304755  hitchhiker  0.00684988 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0896  sensor histidine kinase/response regulator  45.44 
 
 		 551 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.406466  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3253  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  46.32 
 
 		 545 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.84 
 
 		 561 aa  434  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0898  sensor histidine kinase/response regulator  42.22 
 
 		 537 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.535257  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4203  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.92 
 
 		 520 aa  340  4e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.118856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3605  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  48.51 
 
 		 610 aa  309  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2327  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 591 aa  296  7e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693405 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.47 
 
 		 1172 aa  231  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 		 1169 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 1170 aa  220  6e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1150  signal transduction histidine kinase-like protein  36.41 
 
 		 609 aa  220  6e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0992  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 		 662 aa  219  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2571  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.91 
 
 		 634 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0964097 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7668  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.23 
 
 		 571 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.22 
 
 		 1169 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.42 
 
 		 1172 aa  212  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  36.26 
 
 		 1169 aa  212  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.72 
 
 		 1177 aa  212  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.47 
 
 		 1140 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178694  hitchhiker  0.00103188 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4855  putative two-component hybrid histidine kinase, periplasmic sensor  34.6 
 
 		 591 aa  210  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268249  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38970  putative two-component sensor  34.93 
 
 		 881 aa  210  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.687207  normal  0.985828 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0699  signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 744 aa  207  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.324444  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3319  putative two-component sensor  34.93 
 
 		 868 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4564  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 		 1169 aa  207  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 		 1168 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2688  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.61 
 
 		 589 aa  206  7e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  35.11 
 
 		 1159 aa  206  7e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.99 
 
 		 1146 aa  206  9e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  35.11 
 
 		 1159 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.16 
 
 		 1156 aa  205  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5115  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.97 
 
 		 609 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0345398 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  35.83 
 
 		 1161 aa  204  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  32.8 
 
 		 1145 aa  203  6e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.9 
 
 		 1146 aa  203  6e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  32.9 
 
 		 1146 aa  203  6e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2557  histidine kinase  32.47 
 
 		 1142 aa  202  9e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257497  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.99 
 
 		 1146 aa  202  9e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  34.7 
 
 		 1157 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.06 
 
 		 1169 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.99 
 
 		 1146 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2613  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.18 
 
 		 1166 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 		 1145 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  35.23 
 
 		 1169 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 		 1146 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3301  putative two-component sensor  33.51 
 
 		 577 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15238  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1792  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 		 1146 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.25 
 
 		 1159 aa  201  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 		 1159 aa  200  7e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2340  histidine kinase  34.76 
 
 		 487 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266723 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1158 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1972  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.28 
 
 		 574 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0539187 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.16 
 
 		 635 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1575  histidine kinase  37.83 
 
 		 777 aa  198  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.179984 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.52 
 
 		 1152 aa  197  6e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.68675 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.2 
 
 		 817 aa  197  6e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.97 
 
 		 1174 aa  197  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 		 1316 aa  196  9e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.42 
 
 		 1159 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1814  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 		 662 aa  196  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 		 1171 aa  196  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.35 
 
 		 645 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2078  sensor histidine kinase/response regulator  32.73 
 
 		 1141 aa  194  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.45474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0106  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 657 aa  194  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.816197  normal  0.0449615 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3356  histidine kinase  38.71 
 
 		 633 aa  194  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.7 
 
 		 1445 aa  193  7e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2352  histidine kinase  35.44 
 
 		 441 aa  193  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.16 
 
 		 1167 aa  193  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2537  fused sensor protein/response regulator  28.49 
 
 		 842 aa  193  8e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4849  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.73 
 
 		 655 aa  192  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0479308  normal  0.0448623 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3756  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 		 672 aa  191  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.866154  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 		 1152 aa  192  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2664  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.73 
 
 		 655 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  33.7 
 
 		 1158 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 		 1159 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3519  histidine kinase  37.4 
 
 		 448 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0922492  normal  0.751112 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  30.93 
 
 		 1177 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.67 
 
 		 1163 aa  190  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4194  histidine kinase  34.87 
 
 		 452 aa  190  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100725  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0510  histidine kinase  34.07 
 
 		 629 aa  190  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 		 1145 aa  189  8e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2939  histidine kinase  35.04 
 
 		 447 aa  189  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.012617 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0068  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  30.91 
 
 		 1156 aa  189  9e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  33.42 
 
 		 1174 aa  188  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1926  ATPase domain-containing protein  35.94 
 
 		 454 aa  188  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.82384 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2202  histidine kinase  35.94 
 
 		 447 aa  188  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1300  histidine kinase  37.18 
 
 		 468 aa  188  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0380592 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1871  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.8 
 
 		 856 aa  188  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1470  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.47 
 
 		 1140 aa  188  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  30.4 
 
 		 1055 aa  187  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 		 621 aa  187  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481716  hitchhiker  0.00124548 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1882  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  28.53 
 
 		 854 aa  186  7e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  30.73 
 
 		 1147 aa  186  7e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0554  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.3 
 
 		 675 aa  186  8e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3120  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.97 
 
 		 554 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0189072  normal  0.493238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>