More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2743 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2456  composite two-component regulatory (sensor kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  60.03 
 
 
638 aa  712    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  59.83 
 
 
631 aa  707    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2743  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  100 
 
 
611 aa  1229    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2881  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  82.95 
 
 
632 aa  1019    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.365727 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2335  histidine kinase  59.67 
 
 
610 aa  708    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249479  normal  0.165398 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4361  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 
625 aa  294  3e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3590  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.11 
 
 
594 aa  294  3e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5981  histidine kinase  37.06 
 
 
619 aa  248  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.149513 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0992  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 
662 aa  245  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2571  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 
634 aa  229  9e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0964097 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4096  histidine kinase  39.31 
 
 
604 aa  214  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000005496 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0554  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 
675 aa  209  9e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71067  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7668  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.44 
 
 
571 aa  207  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4849  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 
655 aa  207  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0479308  normal  0.0448623 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4855  putative two-component hybrid histidine kinase, periplasmic sensor  32.8 
 
 
591 aa  206  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268249  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6120  histidine kinase  31.94 
 
 
606 aa  201  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1814  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 
662 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.55 
 
 
621 aa  196  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481716  hitchhiker  0.00124548 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5115  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.59 
 
 
609 aa  196  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0345398 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3717  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.55 
 
 
663 aa  196  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.143813 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1150  signal transduction histidine kinase-like protein  31.11 
 
 
609 aa  195  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.83 
 
 
653 aa  187  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2688  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.5 
 
 
589 aa  186  8e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4376  histidine kinase  32.3 
 
 
593 aa  186  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904194  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0508  histidine kinase  35.75 
 
 
663 aa  186  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.217821  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 
1172 aa  185  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0340  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.4 
 
 
816 aa  182  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 
1152 aa  182  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.94 
 
 
1445 aa  182  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  34.73 
 
 
1150 aa  180  5.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3301  putative two-component sensor  34.13 
 
 
577 aa  180  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15238  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.16 
 
 
1163 aa  180  9e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  35.49 
 
 
1157 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 
1158 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6380  putative two-component sensor histidine kinase  33.77 
 
 
596 aa  179  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  34.23 
 
 
1158 aa  179  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.92 
 
 
1156 aa  178  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  30.1 
 
 
1177 aa  178  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.61 
 
 
1159 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0510  histidine kinase  35.15 
 
 
629 aa  176  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3951  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 
540 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252359  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  33.42 
 
 
1161 aa  172  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.1 
 
 
1159 aa  173  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.63 
 
 
1159 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.18 
 
 
1172 aa  172  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 
561 aa  171  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0467  sensor histidine kinase  33.77 
 
 
758 aa  170  5e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2627  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.4 
 
 
1116 aa  171  5e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594612  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1972  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.06 
 
 
574 aa  169  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0539187 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1575  histidine kinase  38.52 
 
 
777 aa  169  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.179984 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  29.92 
 
 
1055 aa  169  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3756  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.42 
 
 
672 aa  167  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.866154  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  34.37 
 
 
1159 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  31.91 
 
 
1147 aa  166  8e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.34 
 
 
733 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4041  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.87 
 
 
543 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168889  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3605  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.94 
 
 
610 aa  166  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796778  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2683  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.42 
 
 
567 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.259535  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  33.84 
 
 
1159 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1526  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 
733 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0396333  normal  0.047905 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2880  signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
733 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46370  putative two-component sensor  32.22 
 
 
540 aa  165  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304755  hitchhiker  0.00684988 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3079  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.16 
 
 
556 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3253  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.89 
 
 
545 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0472  histidine kinase  33.25 
 
 
598 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38970  putative two-component sensor  32.28 
 
 
881 aa  163  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.687207  normal  0.985828 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4027  histidine kinase  29.94 
 
 
471 aa  162  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0361881  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  29.11 
 
 
1148 aa  162  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3356  histidine kinase  33.33 
 
 
633 aa  162  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.6 
 
 
645 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38740  putative two-component sensor  34.83 
 
 
594 aa  160  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.924619  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 
817 aa  159  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.99 
 
 
635 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2676  histidine kinase  33.25 
 
 
676 aa  159  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00458174  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6022  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  31.73 
 
 
596 aa  159  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.277911  normal  0.668143 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.67 
 
 
1171 aa  158  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2060  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 
1111 aa  157  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.749505  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  28.47 
 
 
968 aa  157  5.0000000000000005e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.69 
 
 
1145 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3120  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
554 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0189072  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  31.52 
 
 
1174 aa  157  6e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0898  sensor histidine kinase/response regulator  30.34 
 
 
537 aa  157  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.535257  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 
1177 aa  157  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.98 
 
 
884 aa  156  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.465168  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0010  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.98 
 
 
884 aa  156  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.89 
 
 
1363 aa  155  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2664  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.63 
 
 
655 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215528  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  31.11 
 
 
1145 aa  154  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  32.56 
 
 
1169 aa  154  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2557  histidine kinase  30.51 
 
 
1142 aa  154  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257497  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  30.34 
 
 
582 aa  154  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00719  Multidomain protein contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  29.28 
 
 
1147 aa  154  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02398  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
881 aa  154  5.9999999999999996e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0106  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.17 
 
 
657 aa  154  7e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.816197  normal  0.0449615 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3319  putative two-component sensor  31.85 
 
 
868 aa  153  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.85 
 
 
1146 aa  153  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  29.73 
 
 
1014 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0999  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 
486 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000325597 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.98 
 
 
1152 aa  153  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.68675 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1450  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.5 
 
 
548 aa  152  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000168793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>