More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6022 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6022  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  100 
 
 
596 aa  1205    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.277911  normal  0.668143 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  38.55 
 
 
1445 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1500  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  42.83 
 
 
1483 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0992  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.95 
 
 
662 aa  208  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2571  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.37 
 
 
634 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0964097 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 
817 aa  187  7e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1882  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35.21 
 
 
854 aa  186  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.85 
 
 
1172 aa  186  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.92 
 
 
1168 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.26 
 
 
733 aa  183  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02398  sensor histidine kinase  42.74 
 
 
881 aa  183  9.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2880  signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 
733 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  29.91 
 
 
1169 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1871  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.75 
 
 
856 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1526  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.42 
 
 
733 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0396333  normal  0.047905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.83 
 
 
1174 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3319  putative two-component sensor  42.26 
 
 
868 aa  180  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 
635 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0340  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.69 
 
 
816 aa  177  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.22 
 
 
1316 aa  177  5e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.92 
 
 
1169 aa  177  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46370  putative two-component sensor  31.34 
 
 
540 aa  177  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304755  hitchhiker  0.00684988 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2683  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.62 
 
 
567 aa  177  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.259535  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0262  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.96 
 
 
545 aa  176  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.446369  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3951  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 
540 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252359  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.02 
 
 
645 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2664  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.76 
 
 
655 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215528  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4705  sensor histidine kinase CorS  40.73 
 
 
491 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226442  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  32.46 
 
 
1159 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  32.35 
 
 
1158 aa  174  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.01 
 
 
1167 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0291  sensor histidine kinase  38.96 
 
 
545 aa  173  6.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  38.43 
 
 
1169 aa  173  7.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 
621 aa  173  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481716  hitchhiker  0.00124548 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3355  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.34 
 
 
880 aa  172  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607488  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.63 
 
 
1169 aa  172  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3079  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42 
 
 
556 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3717  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.62 
 
 
663 aa  172  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.143813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3301  putative two-component sensor  34.68 
 
 
577 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15238  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 
1168 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  31.94 
 
 
1159 aa  171  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.32 
 
 
1169 aa  170  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.84 
 
 
1156 aa  170  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.33 
 
 
1138 aa  170  8e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 
1163 aa  170  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38970  putative two-component sensor  38.24 
 
 
881 aa  170  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.687207  normal  0.985828 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2537  fused sensor protein/response regulator  35.27 
 
 
842 aa  169  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2340  histidine kinase  37.7 
 
 
487 aa  169  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266723 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  34.59 
 
 
1150 aa  169  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.1 
 
 
1170 aa  168  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5189  Signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 
539 aa  168  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.3 
 
 
1171 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2246  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 
854 aa  167  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00766594  normal  0.0928411 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.94 
 
 
1177 aa  167  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3120  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.53 
 
 
554 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0189072  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4564  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.8 
 
 
1169 aa  167  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519353  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 
1172 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2058  histidine kinase  40 
 
 
499 aa  166  9e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1575  histidine kinase  33.15 
 
 
777 aa  166  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.179984 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4855  putative two-component hybrid histidine kinase, periplasmic sensor  31.46 
 
 
591 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268249  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4376  histidine kinase  40.35 
 
 
593 aa  166  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904194  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  30.73 
 
 
1157 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3356  histidine kinase  39.31 
 
 
633 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2676  histidine kinase  32.37 
 
 
676 aa  164  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00458174  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.05 
 
 
1146 aa  164  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7668  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.36 
 
 
571 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38740  putative two-component sensor  33.58 
 
 
594 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.924619  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3253  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.27 
 
 
545 aa  164  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4180  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.28 
 
 
1126 aa  163  9e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0796198 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3605  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.26 
 
 
610 aa  162  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796778  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0554  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.47 
 
 
675 aa  162  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71067  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 
1152 aa  162  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2922  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.43 
 
 
883 aa  162  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.301068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 
975 aa  162  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3952  histidine kinase  36.36 
 
 
747 aa  161  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  36.65 
 
 
1145 aa  161  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  26.04 
 
 
1222 aa  160  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 
884 aa  161  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.465168  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0010  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 
884 aa  160  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2688  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.27 
 
 
589 aa  160  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4041  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.9 
 
 
543 aa  160  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168889  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2060  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.82 
 
 
1111 aa  160  7e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.749505  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.65 
 
 
1146 aa  160  7e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.65 
 
 
1146 aa  160  7e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.25 
 
 
1146 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.65 
 
 
1145 aa  159  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6120  histidine kinase  36.97 
 
 
606 aa  159  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  31.72 
 
 
1161 aa  159  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  36.25 
 
 
1146 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1300  histidine kinase  32.45 
 
 
468 aa  158  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0380592 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1792  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.25 
 
 
1146 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103598  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.25 
 
 
1146 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  29.95 
 
 
1193 aa  158  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0467  sensor histidine kinase  39.92 
 
 
758 aa  157  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1814  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.21 
 
 
662 aa  157  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  34.41 
 
 
1177 aa  157  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  31.75 
 
 
1174 aa  157  6e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02256  Multidomain protein, contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  37.24 
 
 
1006 aa  157  6e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.371064  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  31.27 
 
 
970 aa  157  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5108  two-component sensor  29.93 
 
 
564 aa  157  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>