More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0999 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0999  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 486 aa  984    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000325597 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4027  histidine kinase  44.16 
 
 		 471 aa  353  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0361881  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.1 
 
 		 631 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2688  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.13 
 
 		 589 aa  182  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2335  histidine kinase  34.1 
 
 		 610 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249479  normal  0.165398 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2456  composite two-component regulatory (sensor kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  35.63 
 
 		 638 aa  181  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4855  putative two-component hybrid histidine kinase, periplasmic sensor  31.21 
 
 		 591 aa  179  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268249  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0992  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 		 662 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1150  signal transduction histidine kinase-like protein  33.25 
 
 		 609 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4361  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 		 625 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1814  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 662 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3356  histidine kinase  42.15 
 
 		 633 aa  172  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0106  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 		 657 aa  170  6e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.816197  normal  0.0449615 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  39.2 
 
 		 1150 aa  169  9e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4376  histidine kinase  35.47 
 
 		 593 aa  169  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904194  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4849  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.89 
 
 		 655 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0479308  normal  0.0448623 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2571  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.11 
 
 		 634 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0964097 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.6 
 
 		 1152 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2743  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  33.15 
 
 		 611 aa  166  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5115  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.19 
 
 		 609 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0345398 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2881  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.67 
 
 		 632 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4705  sensor histidine kinase CorS  39.45 
 
 		 491 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226442  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1300  histidine kinase  37.09 
 
 		 468 aa  159  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0380592 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2352  histidine kinase  38.31 
 
 		 441 aa  159  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6120  histidine kinase  37.32 
 
 		 606 aa  158  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 		 733 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3519  histidine kinase  43.64 
 
 		 448 aa  157  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0922492  normal  0.751112 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.68 
 
 		 1156 aa  155  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.4 
 
 		 1138 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0340  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.6 
 
 		 816 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0010  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 884 aa  154  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 884 aa  154  5e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.465168  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2922  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 883 aa  153  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301068 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2537  fused sensor protein/response regulator  38.49 
 
 		 842 aa  154  5e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0510  histidine kinase  39.52 
 
 		 629 aa  153  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0265  sensor histidine kinase  38.34 
 
 		 697 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0554  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.78 
 
 		 675 aa  151  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.82 
 
 		 1316 aa  151  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.71 
 
 		 1167 aa  151  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4096  histidine kinase  36.43 
 
 		 604 aa  151  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000005496 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2880  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 733 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  41.28 
 
 		 1159 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  37.45 
 
 		 1055 aa  150  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1526  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 733 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0396333  normal  0.047905 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  41.28 
 
 		 1159 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  34.39 
 
 		 1148 aa  150  6e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.33 
 
 		 653 aa  149  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3952  histidine kinase  37.64 
 
 		 747 aa  149  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.99 
 
 		 1168 aa  149  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.86 
 
 		 1174 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  38.56 
 
 		 1158 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  36.32 
 
 		 1177 aa  148  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 		 1172 aa  147  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  35.77 
 
 		 1147 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.74 
 
 		 1445 aa  147  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.6 
 
 		 1168 aa  147  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 		 1152 aa  146  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.68675 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  38.14 
 
 		 1157 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2676  histidine kinase  39.44 
 
 		 676 aa  146  8.000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00458174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0467  sensor histidine kinase  39.53 
 
 		 758 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3590  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.52 
 
 		 594 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3319  putative two-component sensor  38.61 
 
 		 868 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.51 
 
 		 1169 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.35 
 
 		 1177 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.94 
 
 		 1146 aa  144  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2627  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.62 
 
 		 1116 aa  144  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594612  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  37.84 
 
 		 1174 aa  143  5e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.46 
 
 		 1146 aa  144  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  34.94 
 
 		 1145 aa  143  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 		 1169 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.46 
 
 		 1146 aa  143  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 		 645 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2664  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.82 
 
 		 655 aa  143  9e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4564  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.23 
 
 		 1169 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  35.57 
 
 		 1169 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 		 1145 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.09 
 
 		 817 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1570  Signal transduction histidine kinase-like  30.8 
 
 		 666 aa  142  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.733845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 		 635 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3605  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.27 
 
 		 610 aa  142  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  39.42 
 
 		 1161 aa  141  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1882  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  36.05 
 
 		 854 aa  140  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 1146 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  36.87 
 
 		 1146 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02398  sensor histidine kinase  37.97 
 
 		 881 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1575  histidine kinase  37.59 
 
 		 777 aa  140  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.179984 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  37.65 
 
 		 1169 aa  140  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1792  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 1146 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2939  histidine kinase  34.25 
 
 		 447 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.012617 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.87 
 
 		 1146 aa  140  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1251  histidine kinase  39.09 
 
 		 477 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0537245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00719  Multidomain protein contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  34.65 
 
 		 1147 aa  139  8.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.49 
 
 		 1159 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3717  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 		 663 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.49 
 
 		 1159 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.49 
 
 		 1159 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2593  hybrid histidine kinase  38.68 
 
 		 477 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3355  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 		 880 aa  138  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38970  putative two-component sensor  37.64 
 
 		 881 aa  139  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.687207  normal  0.985828 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.76 
 
 		 621 aa  138  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481716  hitchhiker  0.00124548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>