More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2542 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  58.4 
 
 		 642 aa  718    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  52.13 
 
 		 637 aa  659    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  58.27 
 
 		 642 aa  720    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 637 aa  1329    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  57.64 
 
 		 649 aa  737    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  39.38 
 
 		 853 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  60.78 
 
 		 1079 aa  323  6e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  55.76 
 
 		 410 aa  319  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  59.51 
 
 		 1100 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  55.78 
 
 		 1087 aa  290  6e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  55.38 
 
 		 1087 aa  289  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  38.26 
 
 		 684 aa  287  4e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  39.85 
 
 		 775 aa  286  5.999999999999999e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  37.85 
 
 		 536 aa  281  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  54.3 
 
 		 1083 aa  281  4e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  51.95 
 
 		 1082 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  37.15 
 
 		 754 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.65 
 
 		 769 aa  262  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  48.02 
 
 		 366 aa  258  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 		 773 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.63 
 
 		 773 aa  232  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  41.67 
 
 		 396 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3536  putative PAS/PAC sensor protein  31.83 
 
 		 967 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2570  putative PAS/PAC sensor protein  31.83 
 
 		 967 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0370  putative PAS/PAC sensor protein  29.45 
 
 		 509 aa  196  9e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  40.62 
 
 		 706 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0278  Serine phosphatase  33.73 
 
 		 463 aa  180  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  38.67 
 
 		 708 aa  179  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  38.19 
 
 		 469 aa  178  3e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  38.81 
 
 		 455 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0823  putative PAS/PAC sensor protein  28.43 
 
 		 817 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0795  putative PAS/PAC sensor protein  28.43 
 
 		 817 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1587  protein serine/threonine phosphatase  36.05 
 
 		 460 aa  173  6.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0011  serine phosphatase  35.97 
 
 		 447 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.893308  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.74 
 
 		 447 aa  172  2e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.5 
 
 		 423 aa  172  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.43645  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3662  protein serine/threonine phosphatase  36.82 
 
 		 474 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3716  protein serine/threonine phosphatase  36.82 
 
 		 474 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.412464  normal  0.388868 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1343  EAL and GGDEF domain-containing protein  37.45 
 
 		 1274 aa  171  6e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2891  protein serine/threonine phosphatase  36.43 
 
 		 477 aa  170  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.772324 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.64 
 
 		 467 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.57 
 
 		 447 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0928709  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  35.66 
 
 		 631 aa  169  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.85 
 
 		 572 aa  169  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  37.4 
 
 		 470 aa  168  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1246  putative PAS/PAC sensor protein  26.75 
 
 		 508 aa  168  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1005  putative PAS/PAC sensor protein  28.39 
 
 		 667 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0739  serine phosphatase  33.97 
 
 		 474 aa  166  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1034  putative PAS/PAC sensor protein  28.39 
 
 		 670 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188592 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 		 859 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  36.47 
 
 		 465 aa  165  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 		 853 aa  164  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.52 
 
 		 563 aa  163  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.08 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1825  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.73 
 
 		 879 aa  161  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4764  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.46 
 
 		 482 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0579698  hitchhiker  0.0000553449 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1524  putative PAS/PAC sensor protein  31.36 
 
 		 409 aa  158  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.26 
 
 		 654 aa  158  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2473  serine phosphatase  31.38 
 
 		 462 aa  157  8e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000579544 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  34.34 
 
 		 687 aa  152  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.42 
 
 		 961 aa  152  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3094  putative PAS/PAC sensor protein  25.5 
 
 		 519 aa  152  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  35.51 
 
 		 612 aa  150  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6719  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  37.85 
 
 		 1037 aa  150  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.556524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  33.71 
 
 		 443 aa  149  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  28.42 
 
 		 751 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.29 
 
 		 995 aa  147  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4309  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.46 
 
 		 766 aa  147  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.33 
 
 		 957 aa  146  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0975  putative PAS/PAC sensor protein  29.89 
 
 		 516 aa  146  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3285  putative PAS/PAC sensor protein  30.17 
 
 		 516 aa  146  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  33.87 
 
 		 381 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.64 
 
 		 507 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.98 
 
 		 748 aa  145  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2187  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.09 
 
 		 497 aa  145  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0011  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 726 aa  144  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2637  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.73 
 
 		 678 aa  144  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.5465  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1021  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.72 
 
 		 1051 aa  144  7e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126981  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0836  putative PAS/PAC sensor protein  49.67 
 
 		 487 aa  144  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  34.84 
 
 		 467 aa  144  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.3 
 
 		 1332 aa  143  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 		 587 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  30.62 
 
 		 846 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0721  serine phosphatase  32.93 
 
 		 885 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  30.16 
 
 		 413 aa  142  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1417  protein serine/threonine phosphatase  31.52 
 
 		 400 aa  141  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.291528  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.01 
 
 		 670 aa  141  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.381885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3250  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  31.21 
 
 		 1036 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2166  putative PAS/PAC sensor protein  33.1 
 
 		 378 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2915  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 		 521 aa  140  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4433  putative PAS/PAC sensor protein  30.56 
 
 		 370 aa  140  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  32.66 
 
 		 445 aa  140  8.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.61 
 
 		 590 aa  139  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1859  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  42.77 
 
 		 917 aa  139  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4615  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  31.35 
 
 		 758 aa  139  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0613125 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2055  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.12 
 
 		 1034 aa  138  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  34.8 
 
 		 705 aa  138  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  38.79 
 
 		 962 aa  138  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  31.8 
 
 		 451 aa  137  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1928  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 487 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.793322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>