More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0011 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0010  sensory box histidine kinase/response regulator  62.17 
 
 
727 aa  862    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0011  multi-sensor signal transduction histidine kinase  62.62 
 
 
715 aa  907    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  61.51 
 
 
715 aa  900    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.99155  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0011  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
726 aa  1494    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  63.1 
 
 
561 aa  371  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.237401  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0144  sensory box histidine kinase  33.6 
 
 
709 aa  268  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 
710 aa  249  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.283964 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0218  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 
695 aa  234  5e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3629  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
665 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3734  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 
665 aa  210  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  40.43 
 
 
642 aa  177  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  39.71 
 
 
642 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4005  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.66 
 
 
438 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000169909  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  44.24 
 
 
649 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1656  sensory box/response regulator  37.29 
 
 
420 aa  171  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1917  response regulator receiver /GGDEF/PAS/PAC domain-containing protein  38.74 
 
 
419 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0589316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.2 
 
 
769 aa  161  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 
654 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  51.52 
 
 
637 aa  160  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1114  putative diguanylate phosphodiesterase  56.2 
 
 
568 aa  159  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  26.81 
 
 
824 aa  158  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.56 
 
 
1431 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2551  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  36.5 
 
 
765 aa  156  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.274696 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1758  PAS sensor diguanylate cyclase/phophodiesterase  46.11 
 
 
700 aa  155  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.250633  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0493  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.07 
 
 
431 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431095 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  54.74 
 
 
773 aa  153  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.07 
 
 
670 aa  151  5e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.381885  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0476  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.44 
 
 
431 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4365  response regulator receiver protein  52.45 
 
 
340 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.28 
 
 
773 aa  148  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5218  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  54.29 
 
 
580 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0126538 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  37.88 
 
 
751 aa  147  6e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2565  two component signal transduction response regulator  58.12 
 
 
703 aa  147  8.000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1825  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.17 
 
 
879 aa  146  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2062  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 
697 aa  145  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  35.82 
 
 
637 aa  144  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1945  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
690 aa  144  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000961188  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1885  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
694 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2335  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 
694 aa  142  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
556 aa  141  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.12815  normal  0.758765 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1630  sensory box histidine kinase  30.38 
 
 
710 aa  139  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00580838  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1144  signal transduction protein  45.34 
 
 
571 aa  139  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  56.64 
 
 
484 aa  137  8e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0729257  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 
556 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.936608  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3138  sensor histidine kinase/response regulator  51.48 
 
 
484 aa  135  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.312332  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.52 
 
 
482 aa  135  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000480808 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 
509 aa  132  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.923259 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.64 
 
 
650 aa  128  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  31.9 
 
 
461 aa  127  6e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0093  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.03 
 
 
856 aa  127  7e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  31.9 
 
 
461 aa  127  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 
511 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  31.29 
 
 
461 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0485  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 
726 aa  124  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0662755 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 
508 aa  124  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.91 
 
 
1977 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 
1711 aa  123  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 
641 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0820  multisensor signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 
519 aa  120  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4240  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.69 
 
 
1064 aa  120  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.61 
 
 
1370 aa  119  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0008  sensory box histidine kinase/response regulator  30.91 
 
 
516 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 
880 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 
639 aa  117  5e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0010  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 
508 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0502065  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1645  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
906 aa  115  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.884619  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1596  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.94 
 
 
385 aa  115  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430448 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 
546 aa  115  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4668  histidine kinase  31.01 
 
 
376 aa  114  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.158807  normal  0.364184 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
639 aa  114  5e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.84 
 
 
1274 aa  114  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 
488 aa  114  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
582 aa  114  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 
458 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 
2783 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0582  signal transduction histidine kinase-like protein  52.63 
 
 
394 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4412  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.6 
 
 
726 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3285  putative PAS/PAC sensor protein  36.93 
 
 
516 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1814  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.11 
 
 
381 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0975  putative PAS/PAC sensor protein  36.93 
 
 
516 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  26.62 
 
 
1172 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 
620 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 
421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00283134  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0996  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 
396 aa  112  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.778544  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0665  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  22.64 
 
 
907 aa  112  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.952242 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1495  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 
579 aa  112  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 
3470 aa  111  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.79 
 
 
1406 aa  111  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 
701 aa  111  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4350  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.03 
 
 
726 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.46 
 
 
456 aa  111  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0694  external sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
592 aa  111  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.52754  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0838  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.26 
 
 
461 aa  111  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2823  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  24.72 
 
 
901 aa  111  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2497  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.56 
 
 
1168 aa  111  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.436801 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2926  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  25.94 
 
 
887 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1268  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  25.94 
 
 
887 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1168  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  25.43 
 
 
676 aa  110  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.08 
 
 
1965 aa  110  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.39 
 
 
639 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>