More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1655 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  100 
 
 
824 aa  1685    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.28 
 
 
769 aa  633  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.12 
 
 
773 aa  593  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.89 
 
 
773 aa  590  1e-167  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  66.32 
 
 
650 aa  519  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.09 
 
 
1108 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3600  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  53.75 
 
 
766 aa  402  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35244  normal  0.024803 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 
1113 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.06 
 
 
1132 aa  391  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  50.13 
 
 
749 aa  376  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.6 
 
 
1176 aa  371  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.74 
 
 
557 aa  368  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  52.21 
 
 
733 aa  368  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.79 
 
 
1260 aa  364  4e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.03 
 
 
1079 aa  363  9e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.43 
 
 
522 aa  362  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
639 aa  361  3e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.44 
 
 
962 aa  350  7e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  46.72 
 
 
527 aa  347  5e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.49 
 
 
1180 aa  345  1e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.47 
 
 
828 aa  345  1e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00791305  hitchhiker  0.0012729 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.12 
 
 
1124 aa  340  5e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.41 
 
 
796 aa  340  5.9999999999999996e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 
859 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.36 
 
 
983 aa  339  9.999999999999999e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.91 
 
 
845 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.33 
 
 
637 aa  338  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  47 
 
 
796 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0452  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.01 
 
 
955 aa  336  9e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.39 
 
 
845 aa  336  9e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.55 
 
 
817 aa  336  1e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0269  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.04 
 
 
885 aa  335  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.67 
 
 
1260 aa  335  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1910  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.61 
 
 
994 aa  335  2e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.13 
 
 
1106 aa  334  5e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.67 
 
 
641 aa  333  6e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.17 
 
 
661 aa  333  7.000000000000001e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0429  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.75 
 
 
955 aa  333  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.77 
 
 
1279 aa  332  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2023  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.84 
 
 
1021 aa  331  3e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0168563  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1154  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 
925 aa  332  3e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.25 
 
 
953 aa  331  4e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.6 
 
 
673 aa  330  4e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.23 
 
 
752 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000882027 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.51 
 
 
1322 aa  330  7e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0520  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.87 
 
 
751 aa  330  8e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.76 
 
 
823 aa  329  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1952  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.26 
 
 
692 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.96 
 
 
677 aa  328  4.0000000000000003e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0388  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 
793 aa  327  6e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.91 
 
 
1102 aa  327  7e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6438  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.75 
 
 
668 aa  326  1e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.160303  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  45.85 
 
 
1112 aa  324  3e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0082  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.16 
 
 
946 aa  325  3e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.65 
 
 
853 aa  324  5e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.12 
 
 
753 aa  324  5e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6212  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.38 
 
 
999 aa  323  6e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6778  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.49 
 
 
905 aa  323  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433337  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2264  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.57 
 
 
692 aa  323  8e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.7 
 
 
777 aa  323  9.000000000000001e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4405  multi-sensor hybrid histidine kinase  44 
 
 
880 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0198095  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2824  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
1018 aa  320  5e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0209449 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.39 
 
 
874 aa  320  5e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0139218  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2669  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.67 
 
 
1047 aa  320  6e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.69 
 
 
1134 aa  318  3e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5205  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.94 
 
 
727 aa  318  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1243  histidine kinase  44.65 
 
 
654 aa  317  5e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0706231 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3596  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.41 
 
 
926 aa  317  5e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.27 
 
 
819 aa  317  7e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0052  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.68 
 
 
1054 aa  317  7e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  43.81 
 
 
1036 aa  316  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4271  histidine kinase  43.96 
 
 
525 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  43.46 
 
 
571 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5728  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.06 
 
 
727 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2967  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.83 
 
 
949 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291071  normal  0.350737 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.03 
 
 
1646 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  45.05 
 
 
1651 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.42 
 
 
966 aa  315  2.9999999999999996e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.691252 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2428  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.03 
 
 
656 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00399652  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1443  sensor histidine kinase/response regulator  43.39 
 
 
654 aa  313  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.676986  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2401  sensory box histidine kinase/response regulator  43.56 
 
 
1015 aa  313  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4372  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  46.74 
 
 
641 aa  312  1e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.755089  normal  0.0153537 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1700  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.61 
 
 
850 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.99866 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.24 
 
 
1631 aa  312  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.94 
 
 
1065 aa  312  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115718  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1566  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.91 
 
 
1047 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1306  PAS sensor Signal tranduction histidine kinase  43.58 
 
 
949 aa  311  4e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124542  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.75 
 
 
849 aa  311  4e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.65 
 
 
645 aa  310  5e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 
789 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.72 
 
 
663 aa  310  9e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1202  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 
1126 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.766255  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1723  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.27 
 
 
664 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 
810 aa  309  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 
888 aa  308  3e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  43.65 
 
 
844 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.57 
 
 
657 aa  308  4.0000000000000004e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0157583  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1872  sensor histidine kinase  44.01 
 
 
936 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.291512  normal  0.670925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2576  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.48 
 
 
840 aa  307  5.0000000000000004e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0149194 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4076  histidine kinase  47.14 
 
 
416 aa  307  6e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>