More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2068 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 752 aa  1532    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000882027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  92.56 
 
 		 753 aa  1393    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.3 
 
 		 962 aa  443  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.62 
 
 		 1134 aa  434  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  54.45 
 
 		 1112 aa  426  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2401  sensory box histidine kinase/response regulator  44.85 
 
 		 1015 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.24 
 
 		 845 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.43 
 
 		 1180 aa  409  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.72 
 
 		 1079 aa  412  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.95 
 
 		 1106 aa  411  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.74 
 
 		 777 aa  403  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.99 
 
 		 845 aa  404  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.69 
 
 		 1102 aa  397  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.93 
 
 		 1124 aa  391  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.73 
 
 		 819 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1154  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.23 
 
 		 925 aa  374  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.51 
 
 		 849 aa  373  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.75 
 
 		 796 aa  375  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.88 
 
 		 823 aa  372  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.05 
 
 		 796 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.94 
 
 		 853 aa  369  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1910  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.8 
 
 		 994 aa  369  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 859 aa  369  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.23 
 
 		 557 aa  365  2e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1654  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.52 
 
 		 1115 aa  361  3e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3223  histidine kinase  47.12 
 
 		 594 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00047761  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.13 
 
 		 1148 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.21 
 
 		 1176 aa  356  6.999999999999999e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.5 
 
 		 1132 aa  356  1e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1202  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.16 
 
 		 1126 aa  355  2e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.766255  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.04 
 
 		 639 aa  350  6e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.97 
 
 		 1051 aa  349  9e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  47.67 
 
 		 527 aa  345  2e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0452  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.95 
 
 		 955 aa  335  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.47 
 
 		 650 aa  335  3e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.2 
 
 		 769 aa  333  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.65 
 
 		 643 aa  333  1e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535539  normal  0.0122943 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1296  sensory box histidine kinase/response regulator  36.42 
 
 		 726 aa  331  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00691779  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0429  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.37 
 
 		 955 aa  332  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1350  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.8 
 
 		 699 aa  332  2e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  45.23 
 
 		 824 aa  330  6e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0269  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 		 885 aa  325  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  47.29 
 
 		 733 aa  321  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 		 926 aa  319  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.32 
 
 		 740 aa  318  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38 
 
 		 522 aa  317  5e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2554  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.82 
 
 		 551 aa  314  2.9999999999999996e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 773 aa  312  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0517  histidine kinase  37.28 
 
 		 726 aa  313  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.978002  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  38.96 
 
 		 1561 aa  312  1e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2428  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.52 
 
 		 656 aa  312  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00399652  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3671  multi-sensor hybrid histidine kinase  42 
 
 		 1034 aa  311  2e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.03 
 
 		 741 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.25 
 
 		 983 aa  310  5e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 		 773 aa  310  8e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0848  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.44 
 
 		 698 aa  310  9e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.132769  normal  0.98666 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.75 
 
 		 817 aa  309  1.0000000000000001e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.194507 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 		 657 aa  309  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0157583  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4234  sensor histidine kinase  35.83 
 
 		 761 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.66 
 
 		 743 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0872  histidine kinase  41.71 
 
 		 585 aa  308  3e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4039  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.61 
 
 		 1039 aa  307  4.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.05 
 
 		 828 aa  307  4.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00791305  hitchhiker  0.0012729 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 		 1260 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1968  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.71 
 
 		 933 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.38 
 
 		 1322 aa  305  3.0000000000000004e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.38 
 
 		 1279 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0520  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  45.12 
 
 		 751 aa  304  5.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.43 
 
 		 1113 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  42.03 
 
 		 571 aa  303  9e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.55 
 
 		 1108 aa  303  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3600  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 766 aa  303  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35244  normal  0.024803 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 		 1260 aa  302  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 		 1076 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4235  sensor histidine kinase  37.1 
 
 		 754 aa  300  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507157  normal  0.848747 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  35.24 
 
 		 844 aa  300  6e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1039  sensory box histidine kinase/response regulator  39.16 
 
 		 945 aa  299  1e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0666  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.84 
 
 		 831 aa  299  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 		 774 aa  298  2e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0462938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6438  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.4 
 
 		 668 aa  299  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.160303  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.72 
 
 		 645 aa  298  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 		 661 aa  299  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0513  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.94 
 
 		 803 aa  297  5e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.883754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0284  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 1105 aa  297  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0846765 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2947  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.86 
 
 		 642 aa  297  5e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1243  histidine kinase  42.78 
 
 		 654 aa  297  6e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0706231 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4271  histidine kinase  36.82 
 
 		 525 aa  296  7e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2023  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.45 
 
 		 1021 aa  296  8e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0168563  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.83 
 
 		 548 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0545  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 		 1053 aa  296  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0920041 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1004  sensory box histidine kinase/response regulator  38.93 
 
 		 945 aa  296  1e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4372  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  45.39 
 
 		 641 aa  296  1e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.755089  normal  0.0153537 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2148  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.63 
 
 		 655 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.440522  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2885  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.46 
 
 		 818 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0237924  normal  0.0700462 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.45 
 
 		 953 aa  295  2e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2124  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.12 
 
 		 857 aa  294  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104313  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  41.94 
 
 		 573 aa  294  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  44.74 
 
 		 749 aa  294  4e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4405  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 		 880 aa  294  4e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0198095  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2358  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.29 
 
 		 916 aa  293  6e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>