More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0452 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0452  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
955 aa  1981    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0429  multi-sensor hybrid histidine kinase  90.37 
 
 
955 aa  1766    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2401  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.31 
 
 
991 aa  527  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  65.9 
 
 
819 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  64.52 
 
 
849 aa  499  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.05 
 
 
796 aa  476  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.53 
 
 
796 aa  473  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.88 
 
 
853 aa  472  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.6 
 
 
962 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.31 
 
 
859 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.02 
 
 
1106 aa  452  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.81 
 
 
1079 aa  426  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.06 
 
 
777 aa  421  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.62 
 
 
1102 aa  414  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.26 
 
 
1134 aa  412  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 
845 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.29 
 
 
1180 aa  405  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 
845 aa  405  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.22 
 
 
1176 aa  403  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  38.98 
 
 
844 aa  399  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.17 
 
 
769 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.91 
 
 
673 aa  389  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.62 
 
 
677 aa  389  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 
661 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1910  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.29 
 
 
994 aa  385  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2401  sensory box histidine kinase/response regulator  42.83 
 
 
1015 aa  378  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  42.25 
 
 
1112 aa  375  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.77 
 
 
1108 aa  375  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.48 
 
 
1113 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.25 
 
 
557 aa  376  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.48 
 
 
753 aa  366  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  36.79 
 
 
733 aa  365  1e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.36 
 
 
823 aa  365  3e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.58 
 
 
650 aa  364  5.0000000000000005e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.68 
 
 
773 aa  363  9e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.81 
 
 
1260 aa  363  1e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3600  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  45.1 
 
 
766 aa  362  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35244  normal  0.024803 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.98 
 
 
1260 aa  359  9.999999999999999e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.65 
 
 
1132 aa  358  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  47.01 
 
 
824 aa  357  6.999999999999999e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0269  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.73 
 
 
885 aa  357  7.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.26 
 
 
773 aa  357  7.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.04 
 
 
645 aa  356  1e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.72 
 
 
752 aa  354  5e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000882027 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2264  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.75 
 
 
692 aa  353  8.999999999999999e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2428  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  47.66 
 
 
656 aa  353  1e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00399652  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.97 
 
 
828 aa  352  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00791305  hitchhiker  0.0012729 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1296  sensory box histidine kinase/response regulator  42.66 
 
 
726 aa  348  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00691779  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1952  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.68 
 
 
692 aa  348  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  46.46 
 
 
527 aa  348  4e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 
1279 aa  347  5e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.22 
 
 
740 aa  346  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.56 
 
 
1322 aa  342  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3208  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.28 
 
 
622 aa  341  4e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0750823 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  44.13 
 
 
571 aa  340  7e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 
639 aa  340  9.999999999999999e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1243  histidine kinase  45.72 
 
 
654 aa  338  2.9999999999999997e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0706231 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 
743 aa  337  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.74 
 
 
1051 aa  337  7e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3223  histidine kinase  45.45 
 
 
594 aa  335  3e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00047761  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0114  Signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 
939 aa  334  5e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.153209 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 
522 aa  334  5e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1835  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 
782 aa  333  6e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.448152 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.46 
 
 
657 aa  333  9e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0157583  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.01 
 
 
741 aa  333  9e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  35.11 
 
 
1065 aa  332  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 
1148 aa  332  2e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.6 
 
 
789 aa  331  4e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2024  fused PAS sensor histidine kinase protein and response regulator  30.06 
 
 
1005 aa  330  5.0000000000000004e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00627468  normal  0.216163 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 
774 aa  330  6e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0462938  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.18 
 
 
983 aa  330  6e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.85 
 
 
637 aa  329  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0517  histidine kinase  41.84 
 
 
726 aa  330  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.978002  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6438  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.26 
 
 
668 aa  329  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.160303  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2967  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.12 
 
 
949 aa  330  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291071  normal  0.350737 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1306  PAS sensor Signal tranduction histidine kinase  43.12 
 
 
949 aa  327  6e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124542  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 
1076 aa  327  7e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.98 
 
 
1124 aa  327  7e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1443  sensor histidine kinase/response regulator  45.65 
 
 
654 aa  327  8.000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.676986  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 
789 aa  327  9e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163342  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4534  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 
789 aa  327  9e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178045  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4076  histidine kinase  43.33 
 
 
416 aa  326  2e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 
559 aa  325  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.500087  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0666  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.69 
 
 
831 aa  325  3e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 
822 aa  325  3e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.21 
 
 
1065 aa  325  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115718  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  42.09 
 
 
573 aa  325  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.09 
 
 
926 aa  324  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6183  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.97 
 
 
916 aa  324  6e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.24256 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 
1215 aa  323  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0520  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  45.01 
 
 
751 aa  323  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1654  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.52 
 
 
1115 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 
977 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.416631 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1202  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.81 
 
 
1126 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.766255  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0531  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.28 
 
 
1193 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2669  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.22 
 
 
1047 aa  321  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2023  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1021 aa  321  3.9999999999999996e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0168563  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1277  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 
807 aa  321  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912371  normal  0.18237 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 
632 aa  321  3.9999999999999996e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.177294  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.85 
 
 
1631 aa  321  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>