More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0520 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0520  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
751 aa  1511    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3600  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  44.82 
 
 
766 aa  349  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35244  normal  0.024803 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2428  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.74 
 
 
656 aa  335  1e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00399652  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  43.87 
 
 
824 aa  330  7e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.04 
 
 
1132 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.22 
 
 
650 aa  327  7e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  45.89 
 
 
749 aa  320  6e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  49.34 
 
 
733 aa  319  1e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.25 
 
 
828 aa  318  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00791305  hitchhiker  0.0012729 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.79 
 
 
849 aa  318  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.09 
 
 
819 aa  317  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.69 
 
 
1260 aa  317  5e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1443  sensor histidine kinase/response regulator  40.94 
 
 
654 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.676986  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.77 
 
 
769 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1039  sensory box histidine kinase/response regulator  41.74 
 
 
945 aa  312  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.38 
 
 
753 aa  311  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2554  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.13 
 
 
551 aa  311  4e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344016  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.96 
 
 
639 aa  310  5e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.51 
 
 
557 aa  310  5.9999999999999995e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 
661 aa  310  6.999999999999999e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1243  histidine kinase  39.78 
 
 
654 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0706231 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.73 
 
 
1176 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1004  sensory box histidine kinase/response regulator  41.51 
 
 
945 aa  308  2.0000000000000002e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.18 
 
 
1260 aa  308  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2124  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.24 
 
 
857 aa  307  4.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104313  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2669  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.19 
 
 
1047 aa  307  5.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.41 
 
 
522 aa  307  5.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  42.86 
 
 
573 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.96 
 
 
1079 aa  304  4.0000000000000003e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  42.96 
 
 
571 aa  304  5.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.65 
 
 
752 aa  304  5.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000882027 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0454  multisensor hybrid histidine kinase  43.99 
 
 
766 aa  302  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  44.47 
 
 
1561 aa  302  1e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.97 
 
 
1106 aa  303  1e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.38 
 
 
548 aa  302  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2107  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.99 
 
 
770 aa  302  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.53 
 
 
773 aa  302  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.15 
 
 
962 aa  301  2e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.39 
 
 
796 aa  301  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.09 
 
 
641 aa  301  3e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0452  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.13 
 
 
955 aa  301  4e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1740  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  42.52 
 
 
866 aa  301  4e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223971  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.8 
 
 
1279 aa  300  5e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.65 
 
 
796 aa  300  5e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1727  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  44.19 
 
 
793 aa  300  6e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.91 
 
 
874 aa  300  7e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0139218  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.98 
 
 
823 aa  300  8e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0930  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.82 
 
 
736 aa  300  9e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.165473  normal  0.215499 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.45 
 
 
853 aa  298  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  41.12 
 
 
527 aa  298  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1983  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.99 
 
 
847 aa  298  3e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.138459 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.2 
 
 
1180 aa  298  3e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.67 
 
 
1322 aa  297  4e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1398  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.56 
 
 
853 aa  297  4e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3671  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.42 
 
 
1034 aa  297  6e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.85 
 
 
637 aa  296  9e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.73 
 
 
983 aa  296  9e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.8 
 
 
1134 aa  296  1e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.41 
 
 
777 aa  295  1e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 
859 aa  296  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4039  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.35 
 
 
1039 aa  296  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5491  cell cycle control histidine kinase CckA  42.68 
 
 
892 aa  296  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606378  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  42.32 
 
 
888 aa  295  2e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1847  histidine kinase  44.42 
 
 
785 aa  295  3e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1566  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.64 
 
 
1047 aa  295  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1929  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.16 
 
 
853 aa  295  3e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1952  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.69 
 
 
692 aa  294  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.78 
 
 
1102 aa  293  7e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.04 
 
 
845 aa  292  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.61 
 
 
773 aa  292  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.26 
 
 
953 aa  291  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2375  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43 
 
 
766 aa  291  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.352057 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.49 
 
 
1051 aa  291  4e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0513  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.82 
 
 
803 aa  290  5.0000000000000004e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.883754  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4405  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.89 
 
 
880 aa  290  6e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0198095  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1654  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.45 
 
 
1115 aa  290  7e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  43.38 
 
 
1112 aa  290  9e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2576  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.73 
 
 
840 aa  290  9e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0149194 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0517  histidine kinase  44.21 
 
 
726 aa  289  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.978002  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1700  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.33 
 
 
850 aa  289  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.99866 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2264  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.17 
 
 
692 aa  289  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1228  multi-sensor hybrid histidine kinase  43 
 
 
769 aa  289  1e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.98 
 
 
740 aa  289  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0429  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.53 
 
 
955 aa  288  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.34 
 
 
1113 aa  289  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1524  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.85 
 
 
853 aa  289  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.334346 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0666  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.71 
 
 
831 aa  288  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.67 
 
 
645 aa  287  5.999999999999999e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.15 
 
 
845 aa  286  7e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.43 
 
 
1148 aa  286  7e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0388  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.66 
 
 
793 aa  286  9e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0319  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  37.74 
 
 
824 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.655044  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0486  GAF sensor hybrid histidine kinase  44.03 
 
 
837 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000590544 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.51 
 
 
1124 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.3 
 
 
741 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1723  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.19 
 
 
664 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.97 
 
 
663 aa  285  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1216  sensor histidine kinase/response regulator  39.29 
 
 
417 aa  285  3.0000000000000004e-75  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.48 
 
 
673 aa  285  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4055  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.28 
 
 
586 aa  285  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.174789 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>