More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1727 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1446  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.67 
 
 
811 aa  796    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1727  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
793 aa  1587    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0513  multi-sensor hybrid histidine kinase  56.75 
 
 
803 aa  800    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.883754  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.87 
 
 
874 aa  436  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0139218  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2576  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.57 
 
 
840 aa  433  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0149194 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 
888 aa  430  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.21 
 
 
857 aa  429  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1398  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.56 
 
 
853 aa  421  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4405  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.63 
 
 
880 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0198095  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1740  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  44.33 
 
 
866 aa  419  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223971  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1983  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.36 
 
 
847 aa  417  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.138459 
 
 
-
 
NC_004310  BR1039  sensory box histidine kinase/response regulator  52.84 
 
 
945 aa  416  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1004  sensory box histidine kinase/response regulator  52.59 
 
 
945 aa  413  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3527  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.8 
 
 
839 aa  414  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.064663 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2124  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.09 
 
 
857 aa  413  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104313  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5491  cell cycle control histidine kinase CckA  36.81 
 
 
892 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606378  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1524  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.53 
 
 
853 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.334346 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1700  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.31 
 
 
850 aa  412  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.99866 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2107  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.61 
 
 
770 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2375  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  52.67 
 
 
766 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.352057 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0454  multisensor hybrid histidine kinase  48.43 
 
 
766 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1228  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.92 
 
 
769 aa  392  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.68 
 
 
903 aa  388  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198382 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2632  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.81 
 
 
906 aa  385  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2602  PAS sensor protein  42.33 
 
 
903 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1525  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.05 
 
 
872 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40409  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2820  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  39.63 
 
 
829 aa  376  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1984  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50 
 
 
752 aa  379  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2229  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.03 
 
 
925 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.843602  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2463  two component sensor kinase  48.69 
 
 
872 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.899501  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0755  sensor histidine kinase/response regulator  38.33 
 
 
828 aa  373  1e-102  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0595  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.31 
 
 
680 aa  374  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1216  sensor histidine kinase/response regulator  45.12 
 
 
417 aa  370  1e-101  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0319  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  37.96 
 
 
824 aa  372  1e-101  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.655044  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1644  histidine kinase  52.58 
 
 
779 aa  372  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000228151 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1929  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  50.25 
 
 
853 aa  370  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.08 
 
 
867 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.126106 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2173  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.62 
 
 
867 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00129243  normal  0.0294734 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5149  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.44 
 
 
869 aa  364  4e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416194 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0853  sensor histidine kinase/reponse regulator  32.55 
 
 
845 aa  358  9.999999999999999e-98  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00134282  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1385  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.56 
 
 
695 aa  335  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.92 
 
 
639 aa  323  5e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.61 
 
 
962 aa  323  8e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.53 
 
 
557 aa  320  5e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.56 
 
 
1132 aa  320  6e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  38.57 
 
 
1112 aa  314  3.9999999999999997e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  41.7 
 
 
733 aa  312  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  38.32 
 
 
1561 aa  310  5.9999999999999995e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3600  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  44.36 
 
 
766 aa  310  6.999999999999999e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35244  normal  0.024803 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.09 
 
 
1134 aa  310  1.0000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 
845 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.39 
 
 
845 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41 
 
 
663 aa  309  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 
661 aa  307  6e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0520  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  44.96 
 
 
751 aa  305  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.09 
 
 
859 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.87 
 
 
953 aa  304  5.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.75 
 
 
853 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.27 
 
 
1079 aa  301  4e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.36 
 
 
1180 aa  300  8e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.87 
 
 
819 aa  299  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.27 
 
 
828 aa  299  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00791305  hitchhiker  0.0012729 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.46 
 
 
1051 aa  299  1e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  43.88 
 
 
824 aa  299  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.06 
 
 
926 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.73 
 
 
864 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 
677 aa  297  4e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  44.79 
 
 
749 aa  298  4e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.26 
 
 
1260 aa  297  4e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 
849 aa  296  7e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.77 
 
 
650 aa  296  7e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.26 
 
 
1106 aa  296  1e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.39 
 
 
645 aa  296  1e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.82 
 
 
1176 aa  295  2e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.04 
 
 
796 aa  295  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.81 
 
 
643 aa  294  4e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535539  normal  0.0122943 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1154  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.86 
 
 
925 aa  294  4e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0366  sensor histidine kinase/response regulator  36.81 
 
 
742 aa  293  6e-78  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1654  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.16 
 
 
1115 aa  293  9e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.86 
 
 
753 aa  293  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.29 
 
 
1260 aa  292  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.8 
 
 
752 aa  291  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000882027 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 
769 aa  291  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  41.75 
 
 
527 aa  292  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.49 
 
 
823 aa  292  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.08 
 
 
673 aa  291  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 
777 aa  291  3e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1723  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.97 
 
 
664 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.26 
 
 
522 aa  290  5.0000000000000004e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.36 
 
 
796 aa  289  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.48 
 
 
1279 aa  290  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.09 
 
 
1076 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.76 
 
 
1322 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3671  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.61 
 
 
1034 aa  287  5e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2554  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42 
 
 
551 aa  287  5e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344016  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2401  sensory box histidine kinase/response regulator  33.45 
 
 
1015 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2685  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.35 
 
 
660 aa  285  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41147  normal  0.190122 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.31 
 
 
822 aa  285  3.0000000000000004e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.37 
 
 
983 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3596  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.94 
 
 
926 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>