More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2685 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2685  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
660 aa  1333    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41147  normal  0.190122 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.04 
 
 
983 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.94 
 
 
1132 aa  323  5e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  43.84 
 
 
733 aa  323  7e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.09 
 
 
1260 aa  320  6e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 
962 aa  318  1e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.83 
 
 
673 aa  318  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.63 
 
 
650 aa  318  3e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.25 
 
 
1260 aa  317  4e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.62 
 
 
1106 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.54 
 
 
773 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.23 
 
 
557 aa  314  2.9999999999999996e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.73 
 
 
677 aa  314  3.9999999999999997e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 
1180 aa  313  7.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 
773 aa  310  5e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0444  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.01 
 
 
713 aa  308  3e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00394135  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  42.96 
 
 
749 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.14 
 
 
769 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.13 
 
 
637 aa  303  5.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.96 
 
 
639 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3600  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  44.19 
 
 
766 aa  303  6.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35244  normal  0.024803 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2401  sensory box histidine kinase/response regulator  36.38 
 
 
1015 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.9 
 
 
849 aa  302  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  42.46 
 
 
824 aa  301  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3233  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.48 
 
 
1151 aa  301  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.885558  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.12 
 
 
864 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2947  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.07 
 
 
642 aa  301  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 
819 aa  301  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  43.29 
 
 
1112 aa  298  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0082  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.71 
 
 
946 aa  298  2e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.38 
 
 
1176 aa  297  4e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.08 
 
 
641 aa  297  5e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.93 
 
 
1079 aa  295  2e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.05 
 
 
645 aa  295  2e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.77 
 
 
522 aa  294  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 
1134 aa  294  4e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.02 
 
 
853 aa  293  7e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1039  sensory box histidine kinase/response regulator  43.07 
 
 
945 aa  292  1e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1276  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.57 
 
 
642 aa  292  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  41.83 
 
 
527 aa  291  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0666  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.97 
 
 
831 aa  291  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.73 
 
 
845 aa  291  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3671  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.74 
 
 
1034 aa  290  4e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.94 
 
 
663 aa  290  6e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.49 
 
 
1102 aa  289  9e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.38 
 
 
753 aa  289  9e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4271  histidine kinase  40.89 
 
 
525 aa  289  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.5 
 
 
859 aa  289  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1004  sensory box histidine kinase/response regulator  42.82 
 
 
945 aa  289  1e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1858  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.31 
 
 
1191 aa  288  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  43.65 
 
 
1561 aa  288  2e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0513  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.52 
 
 
803 aa  288  2.9999999999999996e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.883754  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.28 
 
 
1322 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.57 
 
 
1051 aa  287  5e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1041  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.26 
 
 
1121 aa  287  5e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.700011  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1952  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.65 
 
 
692 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 
828 aa  286  7e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00791305  hitchhiker  0.0012729 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.18 
 
 
822 aa  286  7e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1723  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.41 
 
 
664 aa  286  8e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2124  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.57 
 
 
857 aa  286  9e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104313  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.37 
 
 
661 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.48 
 
 
1076 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1727  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.3 
 
 
793 aa  284  4.0000000000000003e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.64 
 
 
845 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.13 
 
 
874 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0139218  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2264  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.54 
 
 
692 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0350  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 
1140 aa  283  7.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5491  cell cycle control histidine kinase CckA  40.93 
 
 
892 aa  283  8.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606378  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.25 
 
 
670 aa  281  2e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.381885  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 
796 aa  281  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1910  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.94 
 
 
994 aa  282  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.37 
 
 
1148 aa  282  2e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2554  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 
551 aa  281  3e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344016  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.7 
 
 
752 aa  281  4e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000882027 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1524  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.34 
 
 
853 aa  281  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.334346 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 
777 aa  280  5e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1216  sensor histidine kinase/response regulator  40.15 
 
 
417 aa  280  6e-74  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.22 
 
 
926 aa  280  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.73 
 
 
943 aa  279  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0284  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.63 
 
 
1105 aa  279  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0846765 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.72 
 
 
953 aa  279  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.35 
 
 
1509 aa  279  1e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6438  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.34 
 
 
668 aa  278  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.160303  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 
888 aa  278  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.26 
 
 
796 aa  278  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1398  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.43 
 
 
853 aa  278  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4039  multi-sensor hybrid histidine kinase  37 
 
 
1039 aa  278  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2967  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 
949 aa  277  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291071  normal  0.350737 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0452  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.71 
 
 
955 aa  277  5e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.76 
 
 
1428 aa  276  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.69 
 
 
1215 aa  276  7e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2428  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39 
 
 
656 aa  276  8e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00399652  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1830  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.69 
 
 
1165 aa  276  9e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  41.5 
 
 
573 aa  276  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.6 
 
 
740 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.67 
 
 
817 aa  276  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0454  multisensor hybrid histidine kinase  41.15 
 
 
766 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1154  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.32 
 
 
925 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1243  histidine kinase  42.06 
 
 
654 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0706231 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2107  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.15 
 
 
770 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>