More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1276 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_2947  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  91.43 
 
 
642 aa  1198    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1276  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
642 aa  1314    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.98 
 
 
1279 aa  412  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.71 
 
 
1322 aa  410  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.19 
 
 
1260 aa  359  8e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4271  histidine kinase  39.88 
 
 
525 aa  355  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.81 
 
 
1260 aa  350  4e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.16 
 
 
953 aa  348  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.42 
 
 
661 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2428  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.15 
 
 
656 aa  343  5.999999999999999e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00399652  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.96 
 
 
983 aa  331  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1723  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.53 
 
 
664 aa  330  6e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.65 
 
 
677 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1443  sensor histidine kinase/response regulator  44.62 
 
 
654 aa  327  3e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.676986  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.15 
 
 
845 aa  327  5e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1243  histidine kinase  44.92 
 
 
654 aa  326  7e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0706231 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.04 
 
 
897 aa  325  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.9 
 
 
663 aa  325  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.46 
 
 
673 aa  324  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.33 
 
 
845 aa  325  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45 
 
 
828 aa  324  3e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00791305  hitchhiker  0.0012729 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1566  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.1 
 
 
1047 aa  323  6e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2264  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.96 
 
 
692 aa  323  7e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  35.41 
 
 
844 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2669  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.02 
 
 
1047 aa  320  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1952  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.64 
 
 
692 aa  321  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.44 
 
 
1113 aa  320  7e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.73 
 
 
645 aa  319  1e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 
796 aa  318  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.22 
 
 
1108 aa  314  3.9999999999999997e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.7 
 
 
1132 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  38.12 
 
 
1561 aa  312  1e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.76 
 
 
637 aa  311  2e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.17 
 
 
796 aa  307  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.39 
 
 
819 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.08 
 
 
557 aa  303  6.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 
639 aa  303  7.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 
849 aa  303  9e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3600  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  45.64 
 
 
766 aa  300  6e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35244  normal  0.024803 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.94 
 
 
1079 aa  297  5e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  39.5 
 
 
733 aa  296  8e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2401  sensory box histidine kinase/response regulator  38.74 
 
 
1015 aa  295  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.75 
 
 
641 aa  293  8e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  36.54 
 
 
812 aa  293  8e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.15 
 
 
773 aa  293  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.12 
 
 
962 aa  291  3e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.14 
 
 
1176 aa  291  3e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.54 
 
 
743 aa  291  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 
773 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.06 
 
 
853 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0452  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 
955 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4134  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.54 
 
 
711 aa  290  8e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.734876  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0429  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.15 
 
 
955 aa  290  8e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  36.84 
 
 
527 aa  289  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 
859 aa  287  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2685  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
660 aa  286  5.999999999999999e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41147  normal  0.190122 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0666  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.3 
 
 
831 aa  286  9e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1296  sensory box histidine kinase/response regulator  39.22 
 
 
726 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00691779  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.26 
 
 
864 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.49 
 
 
817 aa  285  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3671  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 
1034 aa  285  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  41.45 
 
 
749 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.9 
 
 
769 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.27 
 
 
1215 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.45 
 
 
559 aa  285  3.0000000000000004e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.500087  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2824  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.61 
 
 
1018 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0209449 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.28 
 
 
752 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000882027 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.01 
 
 
777 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2554  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.61 
 
 
551 aa  283  6.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344016  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.79 
 
 
1051 aa  283  1e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 
753 aa  282  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.13 
 
 
1180 aa  281  2e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2023  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 
1021 aa  282  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0168563  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0444  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.07 
 
 
713 aa  280  5e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00394135  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0520  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.47 
 
 
751 aa  279  9e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.54 
 
 
774 aa  279  1e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0462938  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3083  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 
845 aa  278  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 
522 aa  277  5e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0082  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.95 
 
 
946 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1031  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 
689 aa  276  1.0000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0486  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.19 
 
 
837 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000590544 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.24 
 
 
823 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  42.04 
 
 
824 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4039  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.65 
 
 
1039 aa  275  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0284  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 
1105 aa  274  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0846765 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6438  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.21 
 
 
668 aa  274  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.160303  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1910  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.44 
 
 
994 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  36.15 
 
 
1112 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.04 
 
 
650 aa  272  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.56 
 
 
1106 aa  271  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0388  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.34 
 
 
793 aa  271  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.51 
 
 
817 aa  271  2.9999999999999997e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 
936 aa  271  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.51 
 
 
1102 aa  271  4e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.84 
 
 
1148 aa  270  5e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 
657 aa  270  5.9999999999999995e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0157583  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0545  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.61 
 
 
1053 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0920041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1847  histidine kinase  42.55 
 
 
785 aa  270  5.9999999999999995e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1830  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1165 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2045  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.2 
 
 
812 aa  267  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000148537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>