More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0444 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0444  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
713 aa  1456    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00394135  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  49.1 
 
 
733 aa  353  7e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.48 
 
 
1132 aa  352  1e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.59 
 
 
637 aa  343  8e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3600  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  45.34 
 
 
766 aa  337  5e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35244  normal  0.024803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.93 
 
 
641 aa  335  1e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.11 
 
 
677 aa  332  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.62 
 
 
853 aa  331  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6438  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.69 
 
 
668 aa  327  7e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.160303  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.87 
 
 
557 aa  326  1e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.25 
 
 
740 aa  325  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  46.29 
 
 
573 aa  325  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  45.92 
 
 
749 aa  324  4e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.67 
 
 
817 aa  323  6e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.39 
 
 
845 aa  323  7e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.32 
 
 
789 aa  323  7e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163342  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4534  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.32 
 
 
789 aa  323  7e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178045  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.55 
 
 
859 aa  323  7e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.27 
 
 
845 aa  323  8e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6778  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.13 
 
 
905 aa  323  9.000000000000001e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433337  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.22 
 
 
673 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2685  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.01 
 
 
660 aa  323  9.999999999999999e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41147  normal  0.190122 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.16 
 
 
1176 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.23 
 
 
962 aa  321  3e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  43.64 
 
 
527 aa  321  3e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1872  sensor histidine kinase  44.75 
 
 
936 aa  320  5e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.291512  normal  0.670925 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0517  histidine kinase  40.95 
 
 
726 aa  320  6e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.978002  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.28 
 
 
741 aa  320  7.999999999999999e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.39 
 
 
769 aa  320  7.999999999999999e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.88 
 
 
548 aa  320  7.999999999999999e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.67 
 
 
1106 aa  319  1e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1835  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.48 
 
 
782 aa  319  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.448152 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.02 
 
 
828 aa  318  3e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00791305  hitchhiker  0.0012729 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.29 
 
 
673 aa  317  4e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0666  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 
831 aa  317  4e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1277  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.57 
 
 
807 aa  317  6e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912371  normal  0.18237 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.99 
 
 
789 aa  316  9e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.54 
 
 
1180 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1968  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  46.27 
 
 
933 aa  316  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.93 
 
 
639 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4749  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.82 
 
 
781 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.872225  normal  0.641352 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.18 
 
 
1076 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.76 
 
 
650 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.84 
 
 
743 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.01 
 
 
966 aa  311  2.9999999999999997e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.691252 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.28 
 
 
926 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.92 
 
 
522 aa  310  5e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.8 
 
 
1646 aa  310  8e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.73 
 
 
1113 aa  309  9e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2401  sensory box histidine kinase/response regulator  36.5 
 
 
1015 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2576  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.9 
 
 
840 aa  309  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0149194 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.23 
 
 
810 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0269  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.53 
 
 
885 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 
1108 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.67 
 
 
1079 aa  306  6e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2967  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.88 
 
 
949 aa  306  6e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291071  normal  0.350737 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  42.31 
 
 
1036 aa  306  7e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  44.87 
 
 
1112 aa  306  8.000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.67 
 
 
943 aa  306  9.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4235  sensor histidine kinase  42.03 
 
 
754 aa  306  9.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507157  normal  0.848747 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.46 
 
 
1631 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  43.46 
 
 
824 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1306  PAS sensor Signal tranduction histidine kinase  41.88 
 
 
949 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124542  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2947  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.76 
 
 
642 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.74 
 
 
1651 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  42.49 
 
 
571 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3596  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.65 
 
 
926 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.07 
 
 
777 aa  305  3.0000000000000004e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6265  sensor histidine kinase  43.46 
 
 
490 aa  305  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0824359  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4076  histidine kinase  45.36 
 
 
416 aa  304  4.0000000000000003e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  42.89 
 
 
1065 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7844  sensor histidine kinase  42.67 
 
 
529 aa  304  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.89 
 
 
936 aa  303  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0542  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.62 
 
 
1050 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.757487  normal  0.763027 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0284  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.85 
 
 
1105 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0846765 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.08 
 
 
1260 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0545  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.93 
 
 
1053 aa  303  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0920041 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5728  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.72 
 
 
727 aa  303  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.83 
 
 
1260 aa  301  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4726  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.78 
 
 
625 aa  301  3e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140851  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.75 
 
 
1036 aa  301  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.05 
 
 
773 aa  301  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3671  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.21 
 
 
1034 aa  300  7e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.65 
 
 
773 aa  300  8e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.07 
 
 
657 aa  300  8e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0157583  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_004310  BR1039  sensory box histidine kinase/response regulator  41.01 
 
 
945 aa  298  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.99 
 
 
796 aa  298  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4234  sensor histidine kinase  40.88 
 
 
761 aa  299  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0520  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.8 
 
 
751 aa  298  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.64 
 
 
1065 aa  297  5e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115718  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 
732 aa  297  5e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3087  ATP-binding region, ATPase-like  42.64 
 
 
847 aa  297  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373882  normal  0.0754896 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1952  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.13 
 
 
692 aa  296  6e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 
645 aa  296  8e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6212  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.14 
 
 
999 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2045  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.2 
 
 
812 aa  295  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000148537 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2124  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.86 
 
 
857 aa  295  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104313  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1004  sensory box histidine kinase/response regulator  40.76 
 
 
945 aa  295  3e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1276  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.22 
 
 
642 aa  294  4e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.41 
 
 
632 aa  294  5e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.177294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>