More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3263 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
639 aa  1316    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.74 
 
 
1079 aa  393  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.05 
 
 
1132 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.24 
 
 
962 aa  379  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.66 
 
 
845 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  37.95 
 
 
749 aa  375  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.15 
 
 
845 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.43 
 
 
557 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  35.71 
 
 
824 aa  361  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.93 
 
 
1176 aa  360  6e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 
1102 aa  360  6e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  41.89 
 
 
733 aa  359  9.999999999999999e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.27 
 
 
753 aa  355  1e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.27 
 
 
777 aa  353  5e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.22 
 
 
1113 aa  352  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.04 
 
 
752 aa  350  3e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000882027 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.06 
 
 
769 aa  346  6e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 
1106 aa  345  1e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3600  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  47.69 
 
 
766 aa  345  1e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35244  normal  0.024803 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.98 
 
 
1260 aa  344  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.96 
 
 
828 aa  344  2e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00791305  hitchhiker  0.0012729 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.97 
 
 
953 aa  342  9e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.73 
 
 
1260 aa  341  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.63 
 
 
859 aa  342  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.34 
 
 
1108 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  38.6 
 
 
1112 aa  339  9e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 
773 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.09 
 
 
1134 aa  337  5e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 
796 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1524  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.07 
 
 
853 aa  337  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.334346 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.69 
 
 
1180 aa  336  5.999999999999999e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.27 
 
 
874 aa  334  3e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0139218  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 
796 aa  333  7.000000000000001e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  44.53 
 
 
527 aa  333  7.000000000000001e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 
853 aa  332  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.03 
 
 
657 aa  332  2e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0157583  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.24 
 
 
645 aa  332  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.39 
 
 
773 aa  331  3e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4405  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.89 
 
 
880 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0198095  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2576  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 
840 aa  330  5.0000000000000004e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0149194 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.89 
 
 
650 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.31 
 
 
822 aa  330  5.0000000000000004e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5491  cell cycle control histidine kinase CckA  38.66 
 
 
892 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606378  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.75 
 
 
823 aa  328  3e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0513  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.16 
 
 
803 aa  326  8.000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.883754  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2401  sensory box histidine kinase/response regulator  38.7 
 
 
1015 aa  325  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1910  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.98 
 
 
994 aa  326  1e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 
677 aa  323  8e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4039  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.97 
 
 
1039 aa  322  9.999999999999999e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.79 
 
 
774 aa  322  9.999999999999999e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0462938  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0452  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 
955 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1740  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  35.4 
 
 
866 aa  322  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223971  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.69 
 
 
1076 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.04 
 
 
673 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 
983 aa  322  9.999999999999999e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.55 
 
 
1322 aa  321  3e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1398  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.47 
 
 
853 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  34.7 
 
 
1561 aa  320  6e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 
926 aa  319  9e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1727  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.72 
 
 
793 aa  319  1e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7844  sensor histidine kinase  45.05 
 
 
529 aa  318  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.73 
 
 
661 aa  318  3e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1985  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 
650 aa  317  4e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.54 
 
 
641 aa  317  5e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  44.88 
 
 
888 aa  317  6e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3671  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.27 
 
 
1034 aa  317  6e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.81 
 
 
936 aa  316  7e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.33 
 
 
743 aa  316  8e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.44 
 
 
819 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1700  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.04 
 
 
850 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.99866 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.03 
 
 
522 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2264  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 
692 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.54 
 
 
857 aa  315  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0542  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 
1050 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.757487  normal  0.763027 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1243  histidine kinase  45.87 
 
 
654 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0706231 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  32.68 
 
 
1065 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0531  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.46 
 
 
1193 aa  313  4.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0388  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.93 
 
 
793 aa  313  4.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0853  sensor histidine kinase/reponse regulator  37.23 
 
 
845 aa  313  5.999999999999999e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00134282  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1039  sensory box histidine kinase/response regulator  43.28 
 
 
945 aa  313  7.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1952  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 
692 aa  312  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2947  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.72 
 
 
642 aa  312  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.66 
 
 
1148 aa  311  2e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 
1051 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.57 
 
 
740 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1983  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.62 
 
 
847 aa  311  2.9999999999999997e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.138459 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43 
 
 
849 aa  310  4e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0520  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  44.96 
 
 
751 aa  310  4e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.75 
 
 
1279 aa  310  5e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1004  sensory box histidine kinase/response regulator  43.03 
 
 
945 aa  309  8e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 
1065 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115718  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  35.03 
 
 
812 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.18 
 
 
637 aa  308  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6265  sensor histidine kinase  44.85 
 
 
490 aa  308  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0824359  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6438  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 
668 aa  307  3e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.160303  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2124  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 
857 aa  307  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104313  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4271  histidine kinase  42.71 
 
 
525 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0429  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 
955 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2820  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  35.04 
 
 
829 aa  306  6e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0284  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.43 
 
 
1105 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0846765 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>