More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0119 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  100 
 
 
1561 aa  3190    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.5 
 
 
1148 aa  437  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.01 
 
 
661 aa  399  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  35.38 
 
 
844 aa  390  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4271  histidine kinase  40.62 
 
 
525 aa  386  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.28 
 
 
1051 aa  383  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.18 
 
 
1134 aa  372  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.35 
 
 
953 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.95 
 
 
1132 aa  360  9.999999999999999e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.96 
 
 
1106 aa  356  2e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.11 
 
 
557 aa  353  1e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  35.2 
 
 
749 aa  347  8.999999999999999e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.03 
 
 
1418 aa  347  1e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6438  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.09 
 
 
668 aa  347  1e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.160303  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.98 
 
 
673 aa  345  4e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.94 
 
 
1428 aa  344  9e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 
677 aa  343  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.66 
 
 
853 aa  342  4e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 
962 aa  338  7e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.02 
 
 
769 aa  336  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.64 
 
 
657 aa  335  3e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0157583  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.86 
 
 
1260 aa  333  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.44 
 
 
859 aa  332  4e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.79 
 
 
1260 aa  331  6e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 
1079 aa  330  1.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  39.96 
 
 
1112 aa  328  4.0000000000000003e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.53 
 
 
753 aa  327  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.86 
 
 
796 aa  326  3e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  40.61 
 
 
733 aa  325  6e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.7 
 
 
639 aa  320  2e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1039  sensory box histidine kinase/response regulator  32.69 
 
 
945 aa  318  6e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.32 
 
 
796 aa  317  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 
3706 aa  316  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1654  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.15 
 
 
1115 aa  317  1.9999999999999998e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  43.83 
 
 
527 aa  316  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.59 
 
 
849 aa  316  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1004  sensory box histidine kinase/response regulator  32.69 
 
 
945 aa  314  6.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.05 
 
 
983 aa  314  9e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1983  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.56 
 
 
847 aa  313  1e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.138459 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2947  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 
642 aa  313  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.96 
 
 
752 aa  313  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000882027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.03 
 
 
845 aa  313  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 
743 aa  313  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0098  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 
1050 aa  312  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.42 
 
 
845 aa  312  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1276  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.12 
 
 
642 aa  312  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 
852 aa  312  2.9999999999999997e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_566  sensor histidine kinase  30.19 
 
 
852 aa  312  4e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1524  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.84 
 
 
853 aa  312  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.334346 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 
888 aa  311  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.45 
 
 
773 aa  310  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.36 
 
 
874 aa  310  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0139218  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  32.16 
 
 
812 aa  310  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1740  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  32.42 
 
 
866 aa  310  1.0000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223971  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.96 
 
 
822 aa  310  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  25.22 
 
 
1258 aa  309  3e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 
819 aa  309  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.62 
 
 
864 aa  309  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2124  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 
857 aa  308  4.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104313  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3600  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  45.71 
 
 
766 aa  308  5.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35244  normal  0.024803 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2148  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 
655 aa  306  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.440522  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.13 
 
 
522 aa  306  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  43.95 
 
 
824 aa  306  3.0000000000000004e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.98 
 
 
774 aa  306  3.0000000000000004e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0462938  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 
773 aa  305  5.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2576  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.69 
 
 
840 aa  305  6.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0149194 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
1002 aa  304  8.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 
1001 aa  304  8.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2824  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 
1018 aa  304  9e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0209449 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1700  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.13 
 
 
850 aa  304  9e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.99866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1727  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.95 
 
 
793 aa  303  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0386  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.02 
 
 
1342 aa  303  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.48 
 
 
1113 aa  302  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.89 
 
 
1262 aa  302  3e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0520  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  44.47 
 
 
751 aa  302  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.31 
 
 
823 aa  301  4e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 
777 aa  301  6e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1866  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 
649 aa  301  6e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.56 
 
 
1180 aa  300  1e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.89 
 
 
1108 aa  300  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0429  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 
955 aa  299  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5491  cell cycle control histidine kinase CckA  32.92 
 
 
892 aa  299  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606378  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.04 
 
 
1176 aa  299  3e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1398  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.51 
 
 
853 aa  299  3e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.78 
 
 
650 aa  298  4e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0513  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.28 
 
 
803 aa  298  4e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.883754  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0452  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 
955 aa  299  4e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.2 
 
 
1509 aa  298  5e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4405  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.78 
 
 
880 aa  298  6e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0198095  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.1 
 
 
1322 aa  298  6e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.6 
 
 
867 aa  298  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.126106 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0284  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.52 
 
 
1105 aa  298  8e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0846765 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  33.39 
 
 
1041 aa  297  9e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.21 
 
 
857 aa  297  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0853  sensor histidine kinase/reponse regulator  31.63 
 
 
845 aa  295  3e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00134282  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.96 
 
 
1344 aa  295  4e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3527  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.14 
 
 
839 aa  295  5e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.064663 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.78 
 
 
817 aa  295  5e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0666  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.79 
 
 
831 aa  295  6e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.25 
 
 
645 aa  294  7e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>