More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2820 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2820  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  100 
 
 
829 aa  1633    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2576  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.9 
 
 
840 aa  515  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0149194 
 
 
-
 
NC_004310  BR1039  sensory box histidine kinase/response regulator  39.9 
 
 
945 aa  486  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1004  sensory box histidine kinase/response regulator  39.78 
 
 
945 aa  483  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1740  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  38.99 
 
 
866 aa  479  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223971  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2124  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.83 
 
 
857 aa  477  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104313  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5491  cell cycle control histidine kinase CckA  39.73 
 
 
892 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606378  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1524  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.95 
 
 
853 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.334346 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1398  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.43 
 
 
853 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2229  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.39 
 
 
925 aa  458  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.843602  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2632  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.6 
 
 
906 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  38.59 
 
 
888 aa  449  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.72 
 
 
903 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198382 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3527  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.74 
 
 
839 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.064663 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.27 
 
 
874 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0139218  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2602  PAS sensor protein  39.72 
 
 
903 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4405  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.29 
 
 
880 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0198095  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1983  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.03 
 
 
847 aa  437  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.138459 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1700  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.12 
 
 
850 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.99866 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2463  two component sensor kinase  36.8 
 
 
872 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.899501  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.88 
 
 
890 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.1 
 
 
857 aa  418  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5149  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.81 
 
 
869 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416194 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.24 
 
 
867 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.126106 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0513  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.2 
 
 
803 aa  409  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.883754  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2173  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.97 
 
 
867 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00129243  normal  0.0294734 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1525  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.87 
 
 
872 aa  401  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40409  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0454  multisensor hybrid histidine kinase  45.27 
 
 
766 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1984  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.87 
 
 
752 aa  397  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2107  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.27 
 
 
770 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1727  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.72 
 
 
793 aa  396  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2375  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  49.33 
 
 
766 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.352057 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0319  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  36.47 
 
 
824 aa  384  1e-105  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.655044  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1228  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.57 
 
 
769 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0755  sensor histidine kinase/response regulator  36.49 
 
 
828 aa  379  1e-103  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1216  sensor histidine kinase/response regulator  45.28 
 
 
417 aa  376  1e-102  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1446  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.79 
 
 
811 aa  373  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1929  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.71 
 
 
853 aa  373  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0595  multi-sensor hybrid histidine kinase  45 
 
 
680 aa  374  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0853  sensor histidine kinase/reponse regulator  41.31 
 
 
845 aa  373  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00134282  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1644  histidine kinase  44.03 
 
 
779 aa  362  2e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000228151 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  41.71 
 
 
733 aa  336  1e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 
639 aa  330  9e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.01 
 
 
1132 aa  327  6e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  38.27 
 
 
1112 aa  323  7e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1385  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  47.49 
 
 
695 aa  323  9.999999999999999e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 
1260 aa  320  7e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.7 
 
 
962 aa  318  3e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.5 
 
 
557 aa  317  7e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.17 
 
 
1176 aa  315  2.9999999999999996e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.91 
 
 
853 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.15 
 
 
1260 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.83 
 
 
769 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0429  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.02 
 
 
955 aa  308  4.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0452  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.02 
 
 
955 aa  306  8.000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  36.66 
 
 
749 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 
859 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  32.49 
 
 
1065 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3600  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.93 
 
 
766 aa  301  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35244  normal  0.024803 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 
1106 aa  301  3e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.18 
 
 
650 aa  301  3e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.91 
 
 
1079 aa  301  3e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.49 
 
 
823 aa  300  5e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3223  histidine kinase  42.75 
 
 
594 aa  300  7e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00047761  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 
1065 aa  299  1e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115718  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.26 
 
 
522 aa  299  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  42.76 
 
 
527 aa  299  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.98 
 
 
819 aa  299  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.35 
 
 
661 aa  298  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.76 
 
 
796 aa  297  6e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33 
 
 
777 aa  295  3e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.44 
 
 
673 aa  295  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4039  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.9 
 
 
1039 aa  294  4e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 
983 aa  294  6e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.47 
 
 
773 aa  293  8e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 
828 aa  293  8e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00791305  hitchhiker  0.0012729 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  41.18 
 
 
824 aa  293  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1654  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.44 
 
 
1115 aa  292  1e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1154  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.91 
 
 
925 aa  293  1e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.95 
 
 
1102 aa  293  1e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.43 
 
 
796 aa  292  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.24 
 
 
849 aa  291  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.89 
 
 
953 aa  291  4e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2148  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 
655 aa  290  7e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.440522  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0366  sensor histidine kinase/response regulator  33.97 
 
 
742 aa  289  1e-76  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  43.84 
 
 
573 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.3 
 
 
677 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3671  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.31 
 
 
1034 aa  288  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.44 
 
 
773 aa  287  5e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  33.58 
 
 
1561 aa  287  5.999999999999999e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.27 
 
 
774 aa  287  7e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0462938  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4905  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.3 
 
 
822 aa  286  7e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0444  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.46 
 
 
713 aa  286  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00394135  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.6 
 
 
1134 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 
1215 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  42.48 
 
 
571 aa  285  3.0000000000000004e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.27 
 
 
1076 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1243  histidine kinase  40.69 
 
 
654 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0706231 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.42 
 
 
845 aa  284  5.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 
845 aa  284  5.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>