More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2602 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5149  multi-sensor hybrid histidine kinase  68.72 
 
 
869 aa  1087    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416194 
 
 
-
 
NC_004310  BR1039  sensory box histidine kinase/response regulator  47.58 
 
 
945 aa  772    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1983  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.84 
 
 
847 aa  790    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.138459 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2173  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.45 
 
 
867 aa  701    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00129243  normal  0.0294734 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2124  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.27 
 
 
857 aa  746    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104313  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  51.28 
 
 
888 aa  852    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1525  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.13 
 
 
872 aa  744    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40409  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4405  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.62 
 
 
880 aa  840    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0198095  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  68.83 
 
 
890 aa  1075    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2229  multi-sensor hybrid histidine kinase  71.88 
 
 
925 aa  1219    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.843602  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1004  sensory box histidine kinase/response regulator  47.46 
 
 
945 aa  769    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.78 
 
 
874 aa  848    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0139218  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2602  PAS sensor protein  100 
 
 
903 aa  1808    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1524  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.92 
 
 
853 aa  850    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.334346 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.82 
 
 
867 aa  711    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.126106 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2632  multi-sensor hybrid histidine kinase  93.5 
 
 
906 aa  1561    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2463  two component sensor kinase  45.46 
 
 
872 aa  695    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.899501  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1700  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.84 
 
 
850 aa  821    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.99866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5491  cell cycle control histidine kinase CckA  50.89 
 
 
892 aa  872    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606378  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  99.56 
 
 
903 aa  1801    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198382 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1398  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.57 
 
 
853 aa  845    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1740  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  47.81 
 
 
866 aa  773    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223971  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3527  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.06 
 
 
839 aa  775    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.064663 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2576  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.11 
 
 
840 aa  599  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0149194 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0853  sensor histidine kinase/reponse regulator  36.04 
 
 
845 aa  541  9.999999999999999e-153  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00134282  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.77 
 
 
857 aa  532  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1929  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.1 
 
 
853 aa  410  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0454  multisensor hybrid histidine kinase  50.78 
 
 
766 aa  395  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1727  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.13 
 
 
793 aa  394  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2107  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.78 
 
 
770 aa  395  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1446  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 
811 aa  380  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0319  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  42.92 
 
 
824 aa  375  1e-102  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.655044  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1984  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.1 
 
 
752 aa  375  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2375  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  50.23 
 
 
766 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.352057 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0755  sensor histidine kinase/response regulator  43.43 
 
 
828 aa  372  1e-101  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1228  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.88 
 
 
769 aa  369  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0595  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.53 
 
 
680 aa  365  3e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1385  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.31 
 
 
695 aa  360  7e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1216  sensor histidine kinase/response regulator  42.22 
 
 
417 aa  357  5e-97  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1644  histidine kinase  48.38 
 
 
779 aa  353  8.999999999999999e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000228151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0513  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.86 
 
 
803 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.883754  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2820  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  40.06 
 
 
829 aa  335  3e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  37.62 
 
 
733 aa  325  3e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.37 
 
 
1132 aa  322  3e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.78 
 
 
845 aa  320  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 
557 aa  317  8e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.86 
 
 
845 aa  313  7.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  37.39 
 
 
749 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 
657 aa  308  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0157583  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  38.78 
 
 
1112 aa  308  3e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.59 
 
 
639 aa  308  3e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.95 
 
 
962 aa  307  5.0000000000000004e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 
661 aa  307  6e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.67 
 
 
673 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.37 
 
 
548 aa  305  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2401  sensory box histidine kinase/response regulator  33.5 
 
 
1015 aa  303  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  40.37 
 
 
573 aa  303  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.38 
 
 
853 aa  303  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.01 
 
 
650 aa  301  4e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.99 
 
 
859 aa  300  6e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 
1079 aa  298  4e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.02 
 
 
823 aa  297  8e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 
769 aa  295  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 
753 aa  295  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.79 
 
 
796 aa  295  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  33.48 
 
 
1561 aa  293  8e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.53 
 
 
1176 aa  293  9e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  41.12 
 
 
824 aa  291  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.2 
 
 
1106 aa  291  3e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.93 
 
 
1134 aa  291  4e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 
1180 aa  290  6e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3600  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.68 
 
 
766 aa  290  8e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35244  normal  0.024803 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.87 
 
 
796 aa  289  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0284  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.82 
 
 
1105 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0846765 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.01 
 
 
522 aa  289  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6438  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.02 
 
 
668 aa  288  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.160303  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.84 
 
 
752 aa  288  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000882027 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2554  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.31 
 
 
551 aa  286  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344016  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0520  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.26 
 
 
751 aa  285  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3208  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.68 
 
 
622 aa  284  5.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0750823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4355  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.73 
 
 
600 aa  283  9e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0666  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.53 
 
 
831 aa  282  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.74 
 
 
1076 aa  282  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.99 
 
 
819 aa  282  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
849 aa  281  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.28 
 
 
740 aa  280  6e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1202  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.95 
 
 
1126 aa  280  1e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.766255  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 
773 aa  279  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
1148 aa  279  2e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0545  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.84 
 
 
1053 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0920041 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1654  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.28 
 
 
1115 aa  279  2e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  37.89 
 
 
571 aa  278  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.74 
 
 
953 aa  278  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.48 
 
 
864 aa  277  6e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
777 aa  277  7e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0388  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.43 
 
 
793 aa  277  7e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0366  sensor histidine kinase/response regulator  31.14 
 
 
742 aa  277  8e-73  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
741 aa  276  9e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.93 
 
 
817 aa  276  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  38.12 
 
 
527 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>