More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3223 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_3223  histidine kinase  100 
 
 
594 aa  1207    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00047761  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.62 
 
 
1102 aa  398  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.02 
 
 
1079 aa  395  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.12 
 
 
962 aa  392  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.63 
 
 
1180 aa  390  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1910  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.55 
 
 
994 aa  383  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2401  sensory box histidine kinase/response regulator  48.61 
 
 
1015 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.61 
 
 
845 aa  382  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.39 
 
 
777 aa  380  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.87 
 
 
845 aa  382  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  50.39 
 
 
1112 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.62 
 
 
1106 aa  379  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.72 
 
 
753 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.21 
 
 
752 aa  364  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000882027 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.77 
 
 
1134 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.96 
 
 
823 aa  355  1e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.58 
 
 
1176 aa  349  8e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.76 
 
 
1124 aa  349  8e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1154  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.04 
 
 
925 aa  341  2e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  45.45 
 
 
527 aa  341  2e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.71 
 
 
859 aa  340  5.9999999999999996e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.45 
 
 
853 aa  339  9e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.36 
 
 
1051 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.07 
 
 
650 aa  334  3e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1654  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.62 
 
 
1115 aa  332  8e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.89 
 
 
1148 aa  332  1e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.82 
 
 
819 aa  329  8e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.29 
 
 
849 aa  326  8.000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.82 
 
 
796 aa  323  5e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.01 
 
 
796 aa  319  7.999999999999999e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1202  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.73 
 
 
1126 aa  317  4e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.766255  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.53 
 
 
769 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.56 
 
 
1132 aa  311  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0452  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.59 
 
 
955 aa  311  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3671  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.93 
 
 
1034 aa  308  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0429  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.33 
 
 
955 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.3 
 
 
1260 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3600  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.08 
 
 
766 aa  306  7e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35244  normal  0.024803 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1350  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 
699 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.4 
 
 
661 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.2 
 
 
966 aa  304  4.0000000000000003e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.691252 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0269  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.58 
 
 
885 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.16 
 
 
740 aa  302  9e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.01 
 
 
741 aa  301  3e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  44.39 
 
 
733 aa  301  3e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4039  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.71 
 
 
1039 aa  300  6e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  41.29 
 
 
571 aa  300  7e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.86 
 
 
1322 aa  299  9e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.76 
 
 
1113 aa  299  9e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.78 
 
 
1260 aa  298  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  41.9 
 
 
824 aa  298  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0517  histidine kinase  42.53 
 
 
726 aa  298  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.978002  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0388  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.05 
 
 
793 aa  298  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6778  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.45 
 
 
905 aa  298  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433337  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  43.99 
 
 
1036 aa  296  5e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1296  sensory box histidine kinase/response regulator  43.6 
 
 
726 aa  296  6e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00691779  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.49 
 
 
657 aa  296  8e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0157583  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0872  histidine kinase  39.85 
 
 
585 aa  296  8e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.91 
 
 
557 aa  296  9e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.6 
 
 
677 aa  294  4e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.82 
 
 
828 aa  294  4e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00791305  hitchhiker  0.0012729 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.79 
 
 
1279 aa  293  5e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.09 
 
 
673 aa  293  6e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.45 
 
 
639 aa  292  9e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.51 
 
 
1108 aa  292  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.3 
 
 
817 aa  292  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.68 
 
 
789 aa  292  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163342  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4534  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.68 
 
 
789 aa  292  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178045  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.14 
 
 
983 aa  291  3e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  40.3 
 
 
573 aa  290  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2669  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.62 
 
 
1047 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0666  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.19 
 
 
831 aa  290  5.0000000000000004e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2023  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.16 
 
 
1021 aa  290  7e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0168563  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.24 
 
 
773 aa  288  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.62 
 
 
926 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1835  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.07 
 
 
782 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.448152 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.66 
 
 
789 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.6 
 
 
810 aa  286  5e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.95 
 
 
773 aa  286  8e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3596  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.97 
 
 
926 aa  286  9e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.55 
 
 
548 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.73 
 
 
1036 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.6 
 
 
637 aa  284  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1277  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.73 
 
 
807 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912371  normal  0.18237 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.56 
 
 
817 aa  283  8.000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.194507 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3208  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.95 
 
 
622 aa  283  8.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0750823 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0082  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 
946 aa  283  9e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1306  PAS sensor Signal tranduction histidine kinase  39.13 
 
 
949 aa  283  9e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124542  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  43.08 
 
 
749 aa  283  9e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.5 
 
 
643 aa  282  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535539  normal  0.0122943 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.99 
 
 
1651 aa  282  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7844  sensor histidine kinase  37.61 
 
 
529 aa  282  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0930  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.69 
 
 
736 aa  281  2e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.165473  normal  0.215499 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.27 
 
 
1646 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0936  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.75 
 
 
803 aa  281  2e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2967  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 
949 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291071  normal  0.350737 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.41 
 
 
645 aa  281  3e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0848  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.25 
 
 
698 aa  280  7e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.132769  normal  0.98666 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1968  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  43.37 
 
 
933 aa  280  7e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  42.89 
 
 
1561 aa  280  7e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>