More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1139 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
643 aa  1303    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535539  normal  0.0122943 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1723  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.76 
 
 
664 aa  372  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.3 
 
 
962 aa  364  2e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.57 
 
 
663 aa  360  6e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.87 
 
 
557 aa  354  2e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.47 
 
 
1132 aa  340  5.9999999999999996e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.26 
 
 
753 aa  339  8e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.45 
 
 
1134 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1910  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.11 
 
 
994 aa  337  5.999999999999999e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.22 
 
 
1106 aa  334  4e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.42 
 
 
769 aa  333  7.000000000000001e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.65 
 
 
752 aa  332  1e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000882027 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.54 
 
 
845 aa  323  4e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  38.95 
 
 
1112 aa  323  6e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1654  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.12 
 
 
1115 aa  323  6e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.18 
 
 
650 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.6 
 
 
1079 aa  321  3e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
637 aa  321  3e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.05 
 
 
845 aa  321  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2554  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.97 
 
 
551 aa  319  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344016  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.66 
 
 
773 aa  317  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 
773 aa  316  7e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2816  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 
682 aa  316  8e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0864703 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2717  sensory box histidine kinase/response regulator  36.23 
 
 
676 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.230475  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 
966 aa  313  4.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.691252 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.07 
 
 
859 aa  313  7.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0269  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.31 
 
 
885 aa  312  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.65 
 
 
774 aa  312  1e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0462938  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.65 
 
 
853 aa  310  5e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.99 
 
 
641 aa  310  8e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.93 
 
 
1148 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.6 
 
 
1180 aa  308  3e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.48 
 
 
1051 aa  306  8.000000000000001e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1985  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.48 
 
 
650 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.24 
 
 
1176 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.71 
 
 
721 aa  305  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.814379  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0712  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 
827 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0849  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.55 
 
 
518 aa  303  8.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2450  PAS  35.41 
 
 
676 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154072 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.76 
 
 
796 aa  301  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3600  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 
766 aa  301  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35244  normal  0.024803 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.62 
 
 
823 aa  302  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0388  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.37 
 
 
793 aa  301  3e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.12 
 
 
828 aa  301  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00791305  hitchhiker  0.0012729 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 
777 aa  300  5e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.53 
 
 
953 aa  300  7e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  43.3 
 
 
824 aa  299  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3795  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.96 
 
 
807 aa  298  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.750808 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1154  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.62 
 
 
925 aa  296  6e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
657 aa  296  7e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0157583  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  39.06 
 
 
1065 aa  296  8e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 
639 aa  296  9e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0114  Signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 
939 aa  295  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.153209 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.33 
 
 
941 aa  296  1e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.77 
 
 
796 aa  295  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.43 
 
 
1065 aa  295  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115718  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6445  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.54 
 
 
830 aa  295  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0224728  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2401  sensory box histidine kinase/response regulator  38.04 
 
 
1015 aa  294  4e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0595  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.4 
 
 
680 aa  293  7e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  41.18 
 
 
1561 aa  293  1e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  39.75 
 
 
527 aa  292  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.02 
 
 
1102 aa  291  2e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2824  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.14 
 
 
1018 aa  291  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0209449 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2810  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.06 
 
 
998 aa  291  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2375  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.16 
 
 
766 aa  290  7e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.352057 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
1631 aa  290  8e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2023  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.62 
 
 
1021 aa  289  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0168563  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 
858 aa  288  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.03 
 
 
943 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4134  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.92 
 
 
711 aa  287  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.734876  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0540  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.93 
 
 
1089 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.77 
 
 
810 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  41.01 
 
 
733 aa  286  7e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.99 
 
 
1651 aa  286  8e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.04 
 
 
1646 aa  286  9e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1727  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.81 
 
 
793 aa  286  9e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6438  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 
668 aa  286  9e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.160303  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.31 
 
 
686 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3298  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.33 
 
 
922 aa  285  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.94 
 
 
943 aa  285  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.35 
 
 
703 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.28 
 
 
1113 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3335  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 
942 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3791  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 
492 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.107728 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5841  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 
887 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.111175 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2107  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 
770 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.12 
 
 
957 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0454  multisensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 
766 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 
661 aa  283  6.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 
1260 aa  283  7.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  40.6 
 
 
888 aa  283  7.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.62 
 
 
673 aa  283  7.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.62 
 
 
677 aa  283  8.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.2 
 
 
1108 aa  283  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.63 
 
 
1260 aa  282  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3549  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.23 
 
 
702 aa  282  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0146  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.1 
 
 
1381 aa  282  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0755  sensor histidine kinase/response regulator  38.94 
 
 
828 aa  281  2e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0520  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.32 
 
 
751 aa  281  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.05 
 
 
1013 aa  281  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>