More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0269 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0269  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
885 aa  1821    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0793  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
871 aa  462  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2023  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.15 
 
 
1021 aa  399  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0168563  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.5 
 
 
962 aa  397  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.26 
 
 
1079 aa  391  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.94 
 
 
1102 aa  374  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.19 
 
 
1113 aa  372  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.36 
 
 
1106 aa  372  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.69 
 
 
1108 aa  368  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0052  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.68 
 
 
1054 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.44 
 
 
845 aa  366  1e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.04 
 
 
1134 aa  364  3e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.86 
 
 
845 aa  364  4e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.14 
 
 
859 aa  363  6e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2824  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.69 
 
 
1018 aa  363  7.0000000000000005e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0209449 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 
1180 aa  360  5e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.18 
 
 
853 aa  360  6e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.67 
 
 
650 aa  360  7e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3222  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.12 
 
 
798 aa  358  2.9999999999999997e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.150716 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1039  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.35 
 
 
798 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.88 
 
 
661 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.14 
 
 
864 aa  352  2e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  39.02 
 
 
844 aa  347  7e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 
769 aa  346  1e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.83 
 
 
1132 aa  345  2e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  38.13 
 
 
527 aa  344  5e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.92 
 
 
819 aa  343  8e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0429  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.31 
 
 
955 aa  343  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  38.49 
 
 
1112 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  46.04 
 
 
824 aa  340  9.999999999999999e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0930  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.68 
 
 
736 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.165473  normal  0.215499 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0452  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.73 
 
 
955 aa  337  7e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.65 
 
 
557 aa  332  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  49.48 
 
 
733 aa  333  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 
777 aa  333  1e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.52 
 
 
522 aa  330  6e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 
752 aa  329  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000882027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.44 
 
 
753 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.86 
 
 
773 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3596  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 
926 aa  326  9e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.61 
 
 
849 aa  326  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0082  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.16 
 
 
946 aa  326  1e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.49 
 
 
773 aa  325  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1910  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.59 
 
 
994 aa  323  9.999999999999999e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.36 
 
 
1260 aa  322  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1296  sensory box histidine kinase/response regulator  37.07 
 
 
726 aa  319  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00691779  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.08 
 
 
828 aa  318  3e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00791305  hitchhiker  0.0012729 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.45 
 
 
983 aa  318  3e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.82 
 
 
1176 aa  317  5e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.36 
 
 
1260 aa  317  5e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2401  sensory box histidine kinase/response regulator  38.07 
 
 
1015 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.46 
 
 
1631 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.43 
 
 
774 aa  314  4.999999999999999e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0462938  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.99 
 
 
796 aa  314  4.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1968  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.34 
 
 
933 aa  314  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.23 
 
 
643 aa  313  9e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535539  normal  0.0122943 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.71 
 
 
796 aa  310  6.999999999999999e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.7 
 
 
823 aa  310  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.55 
 
 
740 aa  309  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.34 
 
 
1148 aa  309  2.0000000000000002e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.42 
 
 
641 aa  308  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.25 
 
 
1124 aa  308  3e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.16 
 
 
1051 aa  308  4.0000000000000004e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1872  sensor histidine kinase  36.41 
 
 
936 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.291512  normal  0.670925 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.77 
 
 
637 aa  302  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2107  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.18 
 
 
770 aa  302  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0454  multisensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 
766 aa  301  3e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2967  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 
949 aa  301  5e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291071  normal  0.350737 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3600  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.12 
 
 
766 aa  301  5e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35244  normal  0.024803 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  41.67 
 
 
571 aa  300  6e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.67 
 
 
926 aa  300  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 
743 aa  300  7e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.33 
 
 
810 aa  300  8e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.38 
 
 
741 aa  300  9e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.47 
 
 
657 aa  300  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0157583  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.33 
 
 
1651 aa  299  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0444  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.53 
 
 
713 aa  299  1e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00394135  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.42 
 
 
1646 aa  298  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  42.19 
 
 
749 aa  299  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0542  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.77 
 
 
1050 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.757487  normal  0.763027 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  38.27 
 
 
1036 aa  298  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2450  PAS  39.64 
 
 
676 aa  298  4e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154072 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1306  PAS sensor Signal tranduction histidine kinase  35.12 
 
 
949 aa  298  4e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124542  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1075  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 
829 aa  298  4e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.46099e-33 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0517  histidine kinase  39.91 
 
 
726 aa  297  5e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.978002  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.96 
 
 
1076 aa  297  5e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3223  histidine kinase  41.99 
 
 
594 aa  297  7e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00047761  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.45 
 
 
943 aa  297  7e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 
673 aa  297  7e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1985  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.6 
 
 
650 aa  296  8e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.07 
 
 
902 aa  295  2e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2375  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 
766 aa  295  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.352057 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.93 
 
 
874 aa  294  4e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0139218  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 
822 aa  294  4e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.41 
 
 
639 aa  294  5e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2816  sensory box histidine kinase/response regulator  36.57 
 
 
882 aa  294  6e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1202  multi-sensor hybrid histidine kinase  42 
 
 
1126 aa  293  7e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.766255  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0716  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.26 
 
 
890 aa  293  8e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4372  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.81 
 
 
641 aa  292  1e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.755089  normal  0.0153537 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.83 
 
 
645 aa  292  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>