More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0793 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0793  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 871 aa  1783    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.16 
 
 		 810 aa  533  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000530681 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2816  sensory box histidine kinase/response regulator  55.28 
 
 		 882 aa  510  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.85 
 
 		 886 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0716  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  55.11 
 
 		 890 aa  503  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1486  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.28 
 
 		 886 aa  502  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1075  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.58 
 
 		 829 aa  487  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.46099e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2069  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.11 
 
 		 1184 aa  474  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  59.48 
 
 		 1040 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0269  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 885 aa  464  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2151  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.46 
 
 		 1184 aa  464  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0517  multi-sensor hybrid histidine kinase  58.46 
 
 		 997 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.660732  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3231  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  58.96 
 
 		 914 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  58.4 
 
 		 997 aa  457  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.87 
 
 		 869 aa  451  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.25 
 
 		 1023 aa  449  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.100128 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.43 
 
 		 1023 aa  451  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2908  multi-sensor hybrid histidine kinase  56.03 
 
 		 860 aa  451  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2962  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.05 
 
 		 869 aa  438  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0741  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.86 
 
 		 1193 aa  434  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131287 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1906  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  47.63 
 
 		 619 aa  361  3e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.343997  unclonable  0.0000148298 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0856  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.73 
 
 		 893 aa  355  2e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3567  putative PAS/PAC sensor protein  47.76 
 
 		 738 aa  355  2e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4629  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.47 
 
 		 841 aa  351  4e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.09 
 
 		 846 aa  348  2e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118602  normal  0.0390699 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1801  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.21 
 
 		 522 aa  342  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0233266 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2416  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.18 
 
 		 522 aa  332  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.550886  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3883  multi-sensor hybrid histidine kinase  41 
 
 		 882 aa  327  4.0000000000000003e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045721 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0550  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.26 
 
 		 540 aa  327  6e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0519596 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2469  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.36 
 
 		 655 aa  322  9.999999999999999e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344805  normal  0.830162 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0536  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.45 
 
 		 531 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2844  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.93 
 
 		 657 aa  313  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.389478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2656  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.09 
 
 		 759 aa  301  4e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2724  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.05 
 
 		 827 aa  291  3e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4547  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 		 973 aa  286  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0247  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.88 
 
 		 870 aa  285  3.0000000000000004e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.38 
 
 		 881 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1175  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 		 821 aa  282  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 		 822 aa  282  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 		 1113 aa  282  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.36 
 
 		 864 aa  281  3e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 1106 aa  280  8e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 		 661 aa  271  4e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2523  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 		 1194 aa  270  7e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 		 817 aa  270  7e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.67 
 
 		 1079 aa  270  1e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.67 
 
 		 853 aa  269  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 		 1108 aa  269  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2358  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.59 
 
 		 916 aa  269  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.61 
 
 		 859 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 		 559 aa  268  4e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.500087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.78 
 
 		 962 aa  268  5e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.63 
 
 		 641 aa  266  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 637 aa  265  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0540  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.1 
 
 		 1089 aa  265  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0936  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.23 
 
 		 803 aa  264  6e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.92 
 
 		 941 aa  263  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.84 
 
 		 819 aa  261  6e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 		 1022 aa  259  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 		 845 aa  259  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 557 aa  258  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3293  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.4 
 
 		 692 aa  256  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.65 
 
 		 943 aa  255  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.12 
 
 		 758 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.19 
 
 		 650 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1300  PAS  32.19 
 
 		 695 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.233563 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.79 
 
 		 1646 aa  254  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0685  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.98 
 
 		 770 aa  254  6e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000495863 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  31.61 
 
 		 1065 aa  254  6e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 		 1134 aa  253  9.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0672  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.75 
 
 		 770 aa  253  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.79 
 
 		 1651 aa  253  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  38.08 
 
 		 1112 aa  252  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0114  Signal transduction histidine kinase  33.53 
 
 		 939 aa  253  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.153209 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 		 1631 aa  252  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3256  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 		 802 aa  251  5e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 		 753 aa  251  6e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2401  sensory box histidine kinase/response regulator  32.45 
 
 		 1015 aa  249  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4293  sensory box histidine kinase/response regulator  33.6 
 
 		 793 aa  249  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.07 
 
 		 796 aa  249  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.79 
 
 		 845 aa  249  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 		 1065 aa  249  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.74 
 
 		 643 aa  249  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535539  normal  0.0122943 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 		 957 aa  248  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3996  PAS  33.53 
 
 		 796 aa  248  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447634  normal  0.187563 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.34 
 
 		 849 aa  248  4.9999999999999997e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 1102 aa  247  4.9999999999999997e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.91 
 
 		 814 aa  247  6e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 		 721 aa  247  6e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.814379  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1529  sensory box histidine kinase/response regulator  32.16 
 
 		 803 aa  247  8e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1952  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.89 
 
 		 692 aa  247  9e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2264  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.07 
 
 		 692 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.93 
 
 		 522 aa  246  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0595  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.29 
 
 		 680 aa  246  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3039  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.02 
 
 		 1067 aa  246  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.635771  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4134  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.9 
 
 		 711 aa  245  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.734876  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.47 
 
 		 983 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.13 
 
 		 796 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.33 
 
 		 1180 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3298  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 		 922 aa  244  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.25103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>