More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3883 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3883  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
882 aa  1800    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045721 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0856  multi-sensor hybrid histidine kinase  67.61 
 
 
893 aa  1230    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3567  putative PAS/PAC sensor protein  47.04 
 
 
738 aa  362  2e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339814  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1906  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  47.49 
 
 
619 aa  357  6.999999999999999e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.343997  unclonable  0.0000148298 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0716  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.95 
 
 
890 aa  349  1e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.5 
 
 
846 aa  347  4e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118602  normal  0.0390699 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 
997 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0517  multi-sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 
997 aa  338  2.9999999999999997e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.660732  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2151  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.95 
 
 
1184 aa  337  7.999999999999999e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2069  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 
1184 aa  335  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.21 
 
 
810 aa  330  8e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000530681 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2816  sensory box histidine kinase/response regulator  38.16 
 
 
882 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.04 
 
 
1023 aa  325  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.100128 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1486  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.97 
 
 
886 aa  325  3e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.9 
 
 
886 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0793  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.49 
 
 
871 aa  319  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.05 
 
 
1023 aa  317  5e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1075  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.97 
 
 
829 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.46099e-33 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2908  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.42 
 
 
860 aa  316  9.999999999999999e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.67 
 
 
1040 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2962  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.24 
 
 
869 aa  314  5.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3231  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.93 
 
 
914 aa  313  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.06 
 
 
869 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2709  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.7 
 
 
812 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.601691  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4629  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.91 
 
 
841 aa  303  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0536  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.24 
 
 
531 aa  301  4e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2844  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 
657 aa  299  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.389478  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0550  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.34 
 
 
540 aa  295  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0519596 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3245  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.15 
 
 
860 aa  292  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48627  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2469  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.7 
 
 
655 aa  289  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344805  normal  0.830162 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0741  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 
1193 aa  279  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131287 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2416  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.63 
 
 
522 aa  276  8e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.550886  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 
962 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4547  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.46 
 
 
973 aa  275  3e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1801  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.49 
 
 
522 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0233266 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 
643 aa  273  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535539  normal  0.0122943 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1175  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.04 
 
 
821 aa  272  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3256  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 
802 aa  271  5e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 
1106 aa  271  5e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.96 
 
 
817 aa  269  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 
1102 aa  265  3e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.4 
 
 
654 aa  264  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2523  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.68 
 
 
1194 aa  262  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2724  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.78 
 
 
827 aa  259  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.37 
 
 
1079 aa  260  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 
845 aa  258  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.83 
 
 
845 aa  258  5e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.61 
 
 
758 aa  256  9e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0463  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.79 
 
 
642 aa  255  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2943  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.29 
 
 
981 aa  256  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0247  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.35 
 
 
870 aa  255  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136851  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.94 
 
 
670 aa  254  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.381885  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 
1013 aa  254  4.0000000000000004e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 
822 aa  254  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.83 
 
 
721 aa  253  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.814379  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.22 
 
 
1113 aa  252  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.61 
 
 
660 aa  252  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 
557 aa  251  6e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 
673 aa  250  7e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2656  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.88 
 
 
759 aa  250  7e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5841  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.18 
 
 
887 aa  250  8e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.111175 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.79 
 
 
853 aa  248  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 
559 aa  247  6.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.500087  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.29 
 
 
1108 aa  246  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0700  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.55 
 
 
1419 aa  245  3e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.81616  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.48 
 
 
677 aa  244  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.11 
 
 
983 aa  244  5e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.63 
 
 
859 aa  244  6e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.16 
 
 
651 aa  244  7e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 
663 aa  243  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0936  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.39 
 
 
803 aa  242  2e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.94 
 
 
1134 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2554  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.18 
 
 
551 aa  241  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344016  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.06 
 
 
1132 aa  241  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 
637 aa  241  5e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3293  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 
692 aa  240  8e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1787  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.17 
 
 
931 aa  240  8e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0082  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.42 
 
 
946 aa  239  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0386  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.8 
 
 
1342 aa  239  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1723  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.22 
 
 
664 aa  239  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3560  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.22 
 
 
712 aa  237  7e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348943  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.19 
 
 
814 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2358  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.1 
 
 
916 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.84 
 
 
766 aa  235  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6445  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.99 
 
 
830 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0224728  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.12 
 
 
777 aa  234  4.0000000000000004e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  35.96 
 
 
1112 aa  234  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1300  PAS  34.94 
 
 
695 aa  232  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.233563 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1809  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.78 
 
 
927 aa  233  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0540  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.06 
 
 
1089 aa  232  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.26 
 
 
1646 aa  232  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.89 
 
 
1651 aa  232  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 
641 aa  233  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1910  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.55 
 
 
994 aa  231  4e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.06 
 
 
966 aa  231  6e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.691252 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3362  PAS sensor protein  30.19 
 
 
678 aa  230  7e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.47 
 
 
1260 aa  230  7e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2026  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.3 
 
 
964 aa  229  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.92 
 
 
1260 aa  230  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1985  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.94 
 
 
650 aa  229  1e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>