More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0700 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0700  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1419 aa  2937    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.81616  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.48 
 
 
814 aa  859    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2764  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.46 
 
 
1275 aa  1199    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0647988  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1787  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.59 
 
 
931 aa  751    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2943  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 
981 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.95 
 
 
1509 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2401  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.03 
 
 
991 aa  353  1e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2010  putative PAS/PAC sensor protein  48.03 
 
 
462 aa  327  9e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 
1309 aa  327  1e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3741  putative PAS/PAC sensor protein  32.79 
 
 
1268 aa  324  9.000000000000001e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1192  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.96 
 
 
912 aa  320  1e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2523  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.3 
 
 
1194 aa  318  4e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2707  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.57 
 
 
776 aa  317  9e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.42 
 
 
721 aa  315  4.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.814379  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1701  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 
571 aa  309  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0239416  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0386  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 
1342 aa  308  5.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.35 
 
 
1019 aa  307  8.000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1102  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.66 
 
 
823 aa  305  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.813916  normal  0.354207 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2521  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 
571 aa  304  9e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0595753 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0685  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.11 
 
 
770 aa  303  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000495863 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0842  sensory box histidine kinase/response regulator  35.34 
 
 
787 aa  303  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220519  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3740  putative PAS/PAC sensor protein  30.04 
 
 
1109 aa  303  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0672  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.88 
 
 
770 aa  302  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0350  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.37 
 
 
1140 aa  299  3e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2731  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 
1007 aa  297  8e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5814  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.56 
 
 
583 aa  294  7e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.552615  normal  0.0161436 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.05 
 
 
983 aa  293  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.38 
 
 
769 aa  294  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1858  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.25 
 
 
1191 aa  290  1e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.11 
 
 
795 aa  290  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0114838  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3233  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 
1151 aa  288  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.885558  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1796  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 
871 aa  287  1.0000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000183002  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.86 
 
 
1260 aa  282  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.59 
 
 
1106 aa  281  6e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.04 
 
 
962 aa  279  3e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 
1148 aa  278  7e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1261  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.3 
 
 
654 aa  277  8e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0082  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.04 
 
 
946 aa  278  8e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.13 
 
 
846 aa  277  9e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118602  normal  0.0390699 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.63 
 
 
1260 aa  276  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 
822 aa  274  8.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 
1079 aa  271  8.999999999999999e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.91 
 
 
845 aa  271  8.999999999999999e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 
1051 aa  269  2.9999999999999995e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.23 
 
 
845 aa  268  7e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.21 
 
 
1108 aa  266  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1041  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.59 
 
 
1121 aa  266  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.700011  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.77 
 
 
1113 aa  266  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.4 
 
 
1102 aa  265  4e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3560  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.36 
 
 
712 aa  264  8.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348943  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.9 
 
 
1338 aa  263  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.216357  normal  0.0407933 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.92 
 
 
1432 aa  263  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1486  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.44 
 
 
886 aa  261  7e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.9 
 
 
1059 aa  260  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.64 
 
 
953 aa  259  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.97 
 
 
774 aa  259  2e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0462938  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.72 
 
 
752 aa  258  4e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000882027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.15 
 
 
853 aa  258  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.61 
 
 
1081 aa  258  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 
819 aa  258  7e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3256  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.61 
 
 
802 aa  258  8e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.75 
 
 
750 aa  257  9e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129426  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  37.16 
 
 
1112 aa  257  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.11 
 
 
817 aa  257  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.4 
 
 
1124 aa  257  1.0000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.45 
 
 
670 aa  256  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.381885  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.37 
 
 
753 aa  256  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.75 
 
 
643 aa  256  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535539  normal  0.0122943 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.12 
 
 
743 aa  256  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 
1134 aa  255  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.99 
 
 
557 aa  256  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1737  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.73 
 
 
720 aa  256  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166788  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1934  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.73 
 
 
720 aa  256  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668168  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  31 
 
 
1428 aa  255  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.79 
 
 
1011 aa  254  6e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4481  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.76 
 
 
737 aa  254  6e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.913087  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
714 aa  254  9.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.756709  normal  0.201817 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.7 
 
 
777 aa  254  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.08 
 
 
1132 aa  253  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.73 
 
 
796 aa  253  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.15 
 
 
749 aa  252  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.116264 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 
849 aa  251  6e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.53 
 
 
886 aa  251  6e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1154  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 
925 aa  251  1e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0388  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.26 
 
 
793 aa  250  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2824  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.43 
 
 
1018 aa  249  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0209449 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.07 
 
 
773 aa  250  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.38 
 
 
796 aa  249  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3591  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 
650 aa  249  3e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2766  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.13 
 
 
717 aa  249  3e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.947572  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  36.84 
 
 
824 aa  248  4.9999999999999997e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.4 
 
 
654 aa  248  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.15 
 
 
650 aa  248  6e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.51 
 
 
859 aa  248  6.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  30.24 
 
 
733 aa  248  6.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0930  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.68 
 
 
736 aa  247  9.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.165473  normal  0.215499 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.14 
 
 
1180 aa  247  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1910  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.03 
 
 
994 aa  247  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.49 
 
 
1057 aa  247  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1131  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.34 
 
 
826 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120114  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>