More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4028 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
846 aa  1706    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118602  normal  0.0390699 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 
869 aa  387  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2962  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 
869 aa  385  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.01 
 
 
810 aa  371  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000530681 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1075  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 
829 aa  365  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.46099e-33 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.34 
 
 
886 aa  365  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1486  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
886 aa  365  2e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2816  sensory box histidine kinase/response regulator  40.78 
 
 
882 aa  359  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2151  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.51 
 
 
1184 aa  358  2.9999999999999997e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2908  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.35 
 
 
860 aa  357  5.999999999999999e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2069  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.68 
 
 
1184 aa  355  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3231  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.4 
 
 
914 aa  355  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4629  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.13 
 
 
841 aa  353  5.9999999999999994e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0716  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  44.92 
 
 
890 aa  351  3e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.61 
 
 
1040 aa  350  9e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3883  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.5 
 
 
882 aa  347  4e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045721 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0856  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.2 
 
 
893 aa  347  8e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0793  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.04 
 
 
871 aa  346  1e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0741  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.45 
 
 
1193 aa  343  8e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131287 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.37 
 
 
1023 aa  343  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.100128 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.79 
 
 
997 aa  340  5e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.86 
 
 
1023 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0517  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.42 
 
 
997 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.660732  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3567  putative PAS/PAC sensor protein  46.55 
 
 
738 aa  312  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339814  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2844  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.05 
 
 
657 aa  311  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.389478  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2469  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.12 
 
 
655 aa  309  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344805  normal  0.830162 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0082  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.21 
 
 
946 aa  303  8.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0536  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.83 
 
 
531 aa  300  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0550  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.94 
 
 
540 aa  298  4e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0519596 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.34 
 
 
817 aa  288  4e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1801  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.68 
 
 
522 aa  283  8.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0233266 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2709  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.86 
 
 
812 aa  280  9e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.601691  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2416  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.95 
 
 
522 aa  278  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.550886  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1906  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.6 
 
 
619 aa  278  3e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.343997  unclonable  0.0000148298 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0700  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.13 
 
 
1419 aa  277  5e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.81616  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4547  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.14 
 
 
973 aa  274  6e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0247  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.24 
 
 
870 aa  272  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136851  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1787  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.66 
 
 
931 aa  266  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.92 
 
 
721 aa  266  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.814379  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 
822 aa  259  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1175  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 
821 aa  258  4e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.47 
 
 
643 aa  258  4e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535539  normal  0.0122943 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3293  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.54 
 
 
692 aa  256  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3256  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.22 
 
 
802 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.94 
 
 
1106 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2764  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.78 
 
 
1275 aa  254  7e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0647988  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2724  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.53 
 
 
827 aa  253  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
639 aa  249  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.28 
 
 
962 aa  247  8e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2523  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 
1194 aa  246  9e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3245  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.92 
 
 
860 aa  246  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48627  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 
814 aa  246  9.999999999999999e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.86 
 
 
557 aa  246  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.68 
 
 
661 aa  246  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 
953 aa  245  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
1509 aa  244  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.82 
 
 
663 aa  243  9e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0435  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.11 
 
 
703 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2554  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.59 
 
 
551 aa  242  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344016  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1910  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.45 
 
 
994 aa  242  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2656  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.35 
 
 
759 aa  243  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1723  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.99 
 
 
664 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2521  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.31 
 
 
571 aa  239  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0595753 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 
1309 aa  239  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0066  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 
748 aa  239  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2611  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.38 
 
 
1134 aa  239  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.413442  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1701  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 
571 aa  238  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0239416  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4039  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.75 
 
 
1039 aa  238  4e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0936  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 
803 aa  237  6e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.3 
 
 
785 aa  237  7e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.21 
 
 
953 aa  237  7e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0386  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 
1342 aa  235  3e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  32.45 
 
 
749 aa  235  3e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.75 
 
 
874 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0139218  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3671  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 
1034 aa  234  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 
983 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.14 
 
 
1113 aa  234  5e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 
1122 aa  234  7.000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.85 
 
 
759 aa  233  8.000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 
752 aa  233  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000882027 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 
758 aa  233  1e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.55 
 
 
645 aa  233  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4271  histidine kinase  35.25 
 
 
525 aa  232  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  35.36 
 
 
527 aa  233  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.8 
 
 
1013 aa  232  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  31.67 
 
 
1112 aa  231  4e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1840  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.39 
 
 
482 aa  231  5e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.366501 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.94 
 
 
654 aa  231  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.25 
 
 
777 aa  231  6e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 
741 aa  230  7e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2471  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 
1677 aa  230  7e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.785659  normal  0.992917 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2693  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 
873 aa  230  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 
1079 aa  230  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2358  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.95 
 
 
916 aa  230  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4405  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 
880 aa  229  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0198095  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.94 
 
 
559 aa  229  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.500087  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3519  putative PAS/PAC sensor protein  32.22 
 
 
757 aa  229  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.324252  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 
1108 aa  228  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  37.79 
 
 
1561 aa  228  3e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1039  sensory box histidine kinase/response regulator  36.3 
 
 
945 aa  228  5.0000000000000005e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>