More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2358 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2358  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  100 
 
 		 916 aa  1868    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.26 
 
 		 953 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2089  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 		 802 aa  340  5e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0236176  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.74 
 
 		 929 aa  323  7e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00773709  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.42 
 
 		 822 aa  309  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.49 
 
 		 898 aa  300  6e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 		 752 aa  293  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000882027 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1518  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 		 769 aa  291  3e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.36 
 
 		 753 aa  288  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 		 819 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.49 
 
 		 1509 aa  286  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1089  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 868 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.371238 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2401  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.4 
 
 		 991 aa  284  6.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1306  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.42 
 
 		 763 aa  281  3e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.147703  normal  0.027228 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2471  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.45 
 
 		 1677 aa  280  7e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.785659  normal  0.992917 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1149  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 833 aa  280  9e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355741  normal  0.205094 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2069  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 		 1184 aa  279  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.06 
 
 		 859 aa  277  6e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.54 
 
 		 1113 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2151  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.16 
 
 		 1184 aa  274  5.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0741  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 1193 aa  273  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131287 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.3 
 
 		 849 aa  273  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0716  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.92 
 
 		 890 aa  272  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1075  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.16 
 
 		 829 aa  271  5e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.46099e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.92 
 
 		 853 aa  270  8e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0788  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.61 
 
 		 634 aa  270  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.83 
 
 		 654 aa  270  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.48 
 
 		 673 aa  269  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.5 
 
 		 557 aa  269  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.64 
 
 		 1108 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2707  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.67 
 
 		 776 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.8 
 
 		 743 aa  267  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 		 677 aa  266  8.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0517  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.01 
 
 		 997 aa  266  8.999999999999999e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.660732  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.01 
 
 		 997 aa  266  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 		 759 aa  265  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.05 
 
 		 1081 aa  266  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3457  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 		 1070 aa  266  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 1260 aa  266  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0793  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 		 871 aa  265  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 		 983 aa  264  4.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 		 1134 aa  264  6e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2659  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 		 1070 aa  263  8e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.337944  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0435  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.1 
 
 		 703 aa  263  8e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 		 645 aa  263  8e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4753  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 		 630 aa  263  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.08 
 
 		 845 aa  263  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.28 
 
 		 1023 aa  263  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.100128 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.29 
 
 		 926 aa  262  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3256  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 		 802 aa  262  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  34.8 
 
 		 812 aa  262  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 		 796 aa  261  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.95 
 
 		 1023 aa  261  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3560  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 		 712 aa  260  7e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1870  histidine kinase  26.54 
 
 		 779 aa  260  8e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 		 1418 aa  259  1e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3741  putative PAS/PAC sensor protein  34.02 
 
 		 1268 aa  260  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  26.37 
 
 		 882 aa  260  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.47 
 
 		 1432 aa  259  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0297  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.68 
 
 		 711 aa  259  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.219152  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3596  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.53 
 
 		 926 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0284  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 		 1105 aa  259  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0846765 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.17 
 
 		 810 aa  259  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000530681 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2408  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.24 
 
 		 647 aa  258  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 		 796 aa  258  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 		 802 aa  258  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.43493  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.19 
 
 		 559 aa  258  4e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.500087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.35 
 
 		 740 aa  257  5e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2962  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 		 869 aa  257  7e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2816  sensory box histidine kinase/response regulator  36.41 
 
 		 882 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.81 
 
 		 714 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.756709  normal  0.201817 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.08 
 
 		 758 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.99 
 
 		 1260 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  33.2 
 
 		 1328 aa  256  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282055  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2148  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 		 655 aa  256  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.440522  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 		 817 aa  256  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  32.66 
 
 		 775 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2189  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.7 
 
 		 628 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0671838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 		 1076 aa  255  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2693  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.3 
 
 		 873 aa  255  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 		 1132 aa  255  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.84 
 
 		 845 aa  255  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 		 576 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.413012  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0936  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.66 
 
 		 803 aa  254  5.000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1723  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 		 664 aa  254  5.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.33 
 
 		 660 aa  253  9.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4271  histidine kinase  32.79 
 
 		 525 aa  253  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.27 
 
 		 1309 aa  253  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.13 
 
 		 639 aa  252  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.31 
 
 		 741 aa  252  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 		 953 aa  252  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0350  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.4 
 
 		 1140 aa  252  2e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.92 
 
 		 869 aa  252  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 		 650 aa  251  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 653 aa  251  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0873112  normal  0.0648404 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 		 663 aa  251  4e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2234  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.53 
 
 		 935 aa  251  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2264  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 692 aa  251  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 		 769 aa  251  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1192  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.88 
 
 		 912 aa  251  5e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>