More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1939 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  100 
 
 		 1328 aa  2742    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282055  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1620  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  44.81 
 
 		 927 aa  452  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.44 
 
 		 673 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.64 
 
 		 743 aa  377  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  36.03 
 
 		 812 aa  348  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0284  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.22 
 
 		 1105 aa  339  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0846765 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2024  fused PAS sensor histidine kinase protein and response regulator  36.53 
 
 		 1005 aa  337  5.999999999999999e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00627468  normal  0.216163 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0545  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 		 1053 aa  334  6e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0920041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1076 aa  324  7e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.19 
 
 		 632 aa  321  6e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.177294  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0542  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 		 1050 aa  310  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.757487  normal  0.763027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 936 aa  307  7e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.03 
 
 		 777 aa  307  1.0000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 		 926 aa  305  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.07 
 
 		 1260 aa  303  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2148  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.39 
 
 		 655 aa  302  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.440522  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.9 
 
 		 1260 aa  295  5e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.28 
 
 		 1079 aa  290  2e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.98 
 
 		 657 aa  286  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0157583  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6438  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 		 668 aa  286  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.160303  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0531  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 		 1193 aa  283  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1872  sensor histidine kinase  34.48 
 
 		 936 aa  282  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.291512  normal  0.670925 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3795  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.14 
 
 		 807 aa  281  6e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.750808 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.25 
 
 		 1122 aa  278  5e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.97 
 
 		 845 aa  278  6e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3596  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.05 
 
 		 926 aa  278  6e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6265  sensor histidine kinase  40.55 
 
 		 490 aa  277  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0824359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.49 
 
 		 1086 aa  276  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  37.2 
 
 		 571 aa  275  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.07 
 
 		 1132 aa  275  3e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.2 
 
 		 1092 aa  274  8.000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.34 
 
 		 941 aa  274  8.000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.49 
 
 		 853 aa  273  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  26.27 
 
 		 1086 aa  274  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 		 548 aa  273  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4234  sensor histidine kinase  34.6 
 
 		 761 aa  272  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0114  Signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 939 aa  272  4e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.153209 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.89 
 
 		 859 aa  271  4e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.89 
 
 		 1113 aa  272  4e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.37 
 
 		 1065 aa  271  5e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.74 
 
 		 650 aa  271  5.9999999999999995e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.49 
 
 		 983 aa  271  8e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.01 
 
 		 769 aa  270  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.23 
 
 		 845 aa  269  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  36.01 
 
 		 539 aa  270  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1968  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.46 
 
 		 933 aa  268  4e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0880  histidine kinase  37.19 
 
 		 534 aa  268  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  29.06 
 
 		 1065 aa  268  4e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  37.91 
 
 		 573 aa  268  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.58 
 
 		 1108 aa  268  7e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7844  sensor histidine kinase  39 
 
 		 529 aa  266  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.91 
 
 		 810 aa  265  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  28.61 
 
 		 844 aa  265  4.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.93 
 
 		 1106 aa  265  4.999999999999999e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1581  histidine kinase  35.6 
 
 		 541 aa  265  6e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0540  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.72 
 
 		 1089 aa  265  6e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4874  histidine kinase  36.02 
 
 		 544 aa  263  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300744  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 		 753 aa  262  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3298  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.31 
 
 		 922 aa  262  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 		 677 aa  261  4e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.89 
 
 		 673 aa  261  6e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4076  histidine kinase  39.47 
 
 		 416 aa  261  8e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.61 
 
 		 957 aa  261  9e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2943  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.35 
 
 		 981 aa  261  9e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2885  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 		 818 aa  259  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0237924  normal  0.0700462 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1490  sensory box histidine kinase/response regulator  30.96 
 
 		 695 aa  259  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.135352  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2357  histidine kinase  34.74 
 
 		 533 aa  258  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0826278 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 		 962 aa  257  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.43 
 
 		 1418 aa  257  1.0000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0930  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 		 736 aa  257  1.0000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.165473  normal  0.215499 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 		 822 aa  257  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.64 
 
 		 1176 aa  256  2.0000000000000002e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.77 
 
 		 752 aa  256  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000882027 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1649  histidine kinase  35.35 
 
 		 541 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.784453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1931  histidine kinase  35.35 
 
 		 541 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.06 
 
 		 740 aa  255  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.01 
 
 		 741 aa  255  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2358  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.2 
 
 		 916 aa  255  4.0000000000000004e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4749  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31 
 
 		 781 aa  254  7e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.872225  normal  0.641352 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.21 
 
 		 1432 aa  254  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.89 
 
 		 557 aa  253  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.25 
 
 		 1081 aa  253  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.25 
 
 		 1509 aa  252  3e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 		 773 aa  252  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.63 
 
 		 1279 aa  251  4e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01426  histidine kinase  34.9 
 
 		 507 aa  251  6e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.643455  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.65 
 
 		 1344 aa  251  7e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.04 
 
 		 660 aa  251  7e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0098  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.81 
 
 		 1050 aa  250  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1300  PAS  30.82 
 
 		 695 aa  250  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.233563 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.91 
 
 		 966 aa  250  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691252 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.31 
 
 		 789 aa  249  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.45 
 
 		 1428 aa  249  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0517  histidine kinase  36.27 
 
 		 726 aa  249  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.978002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3208  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.62 
 
 		 622 aa  249  3e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0750823 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  30.86 
 
 		 749 aa  248  4e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3461  histidine kinase  33.95 
 
 		 533 aa  248  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 		 828 aa  248  4.9999999999999997e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00791305  hitchhiker  0.0012729 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.45 
 
 		 943 aa  248  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1455  PAS sensor protein  25.75 
 
 		 1092 aa  248  8e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534076  normal  0.193101 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>