More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2707 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0685  multi-sensor hybrid histidine kinase  62.19 
 
 
770 aa  962    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000495863 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2707  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
776 aa  1605    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0672  multi-sensor hybrid histidine kinase  61.26 
 
 
770 aa  948    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0842  sensory box histidine kinase/response regulator  45.64 
 
 
787 aa  634  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220519  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2401  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.78 
 
 
991 aa  499  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.98 
 
 
1509 aa  409  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2943  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.32 
 
 
981 aa  407  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1192  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.49 
 
 
912 aa  401  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3741  putative PAS/PAC sensor protein  44.08 
 
 
1268 aa  398  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.16 
 
 
721 aa  385  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.814379  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3740  putative PAS/PAC sensor protein  42.34 
 
 
1109 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2521  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.35 
 
 
571 aa  363  9e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0595753 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1701  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.59 
 
 
571 aa  352  2e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0239416  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.48 
 
 
1019 aa  343  8e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.38 
 
 
795 aa  337  5.999999999999999e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0114838  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1261  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  44.85 
 
 
654 aa  332  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.07 
 
 
814 aa  327  7e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.29 
 
 
817 aa  326  1e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 
1309 aa  325  1e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0700  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.57 
 
 
1419 aa  317  5e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.81616  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3233  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.24 
 
 
1151 aa  317  7e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.885558  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2731  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.46 
 
 
1007 aa  315  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0350  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.41 
 
 
1140 aa  306  7e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 
650 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1102  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  43.31 
 
 
823 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.813916  normal  0.354207 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5814  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.18 
 
 
583 aa  303  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.552615  normal  0.0161436 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1787  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.94 
 
 
931 aa  303  1e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0386  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.41 
 
 
1342 aa  300  5e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2764  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.81 
 
 
1275 aa  299  1e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0647988  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1796  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.1 
 
 
871 aa  298  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000183002  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2523  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.44 
 
 
1194 aa  296  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.24 
 
 
1338 aa  295  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.216357  normal  0.0407933 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1858  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.64 
 
 
1191 aa  295  2e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1041  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  42.72 
 
 
1121 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.700011  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 
859 aa  289  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 
714 aa  288  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.756709  normal  0.201817 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 
822 aa  288  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.02 
 
 
853 aa  287  5e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 
1260 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 
1260 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4753  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 
630 aa  284  5.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2766  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 
717 aa  284  5.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.947572  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2408  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.97 
 
 
647 aa  281  3e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385618  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3045  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.19 
 
 
954 aa  281  3e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00011876  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3560  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 
712 aa  280  8e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348943  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0423  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.39 
 
 
498 aa  279  1e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 
1428 aa  279  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1127  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.38 
 
 
989 aa  278  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.476664 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 
769 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.5 
 
 
749 aa  275  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.116264 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.14 
 
 
819 aa  274  6e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.26 
 
 
849 aa  273  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1934  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.53 
 
 
720 aa  273  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668168  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2537  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.74 
 
 
1222 aa  272  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1737  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.33 
 
 
720 aa  271  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166788  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.37 
 
 
1081 aa  269  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2234  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.02 
 
 
935 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2358  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.67 
 
 
916 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0320  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 
838 aa  267  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 
1122 aa  266  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.64 
 
 
654 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2693  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.76 
 
 
873 aa  265  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.21 
 
 
1418 aa  265  3e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2816  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.63 
 
 
682 aa  264  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0864703 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4481  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.47 
 
 
737 aa  264  4.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.913087  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 
661 aa  263  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.83 
 
 
1132 aa  262  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.99 
 
 
1432 aa  261  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.45 
 
 
557 aa  261  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1486  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 
886 aa  261  5.0000000000000005e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.34 
 
 
750 aa  260  8e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129426  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 
759 aa  259  9e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3256  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 
802 aa  260  9e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0674  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 
1021 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0930  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.16 
 
 
736 aa  258  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.165473  normal  0.215499 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2401  sensory box histidine kinase/response regulator  32.54 
 
 
1015 aa  258  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3071  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.92 
 
 
1222 aa  256  8e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0997499 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0463  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.19 
 
 
642 aa  256  8e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2659  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.89 
 
 
1070 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.337944  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  33.78 
 
 
844 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2816  sensory box histidine kinase/response regulator  33.27 
 
 
882 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.41 
 
 
773 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5991  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.65 
 
 
642 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.7 
 
 
886 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.07 
 
 
753 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3457  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 
1070 aa  254  6e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 
773 aa  253  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0435  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.52 
 
 
703 aa  252  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2151  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.08 
 
 
1184 aa  251  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0788  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.95 
 
 
634 aa  251  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2069  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.77 
 
 
1184 aa  251  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.3 
 
 
752 aa  250  7e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000882027 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  36.64 
 
 
527 aa  249  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 
1113 aa  249  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.79 
 
 
1108 aa  248  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3600  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.01 
 
 
766 aa  247  4.9999999999999997e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35244  normal  0.024803 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.14 
 
 
645 aa  247  6e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.99 
 
 
576 aa  246  8e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.413012  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 
1079 aa  246  9e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0936  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.33 
 
 
803 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0173561 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>