More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1798 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1023 aa  2079    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.100128 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.68 
 
 
997 aa  654    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0517  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.95 
 
 
997 aa  667    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.660732  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  92.38 
 
 
1023 aa  1889    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2908  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.48 
 
 
860 aa  619  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2816  sensory box histidine kinase/response regulator  47.49 
 
 
882 aa  501  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1075  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  58.85 
 
 
829 aa  487  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.46099e-33 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0716  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  51.46 
 
 
890 aa  483  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2151  multi-sensor hybrid histidine kinase  57.07 
 
 
1184 aa  472  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.18 
 
 
810 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000530681 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2069  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.2 
 
 
1184 aa  465  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.17 
 
 
886 aa  462  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1486  multi-sensor hybrid histidine kinase  54.68 
 
 
886 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0793  multi-sensor hybrid histidine kinase  54.8 
 
 
871 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3231  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.21 
 
 
914 aa  426  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.21 
 
 
1040 aa  422  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.15 
 
 
777 aa  421  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0741  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.9 
 
 
1193 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131287 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.4 
 
 
869 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2962  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.99 
 
 
869 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4629  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.36 
 
 
841 aa  360  7e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 
1004 aa  360  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3567  putative PAS/PAC sensor protein  46.27 
 
 
738 aa  357  6.999999999999999e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339814  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1801  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.33 
 
 
522 aa  355  2e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0233266 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0856  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 
893 aa  347  8.999999999999999e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.94 
 
 
1004 aa  346  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1906  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45 
 
 
619 aa  345  2.9999999999999997e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.343997  unclonable  0.0000148298 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.37 
 
 
846 aa  343  1e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118602  normal  0.0390699 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2416  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.55 
 
 
522 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.550886  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3883  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.04 
 
 
882 aa  324  4e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045721 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0536  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.84 
 
 
531 aa  320  7e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 
859 aa  318  4e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2469  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.64 
 
 
655 aa  316  9.999999999999999e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344805  normal  0.830162 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0550  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.71 
 
 
540 aa  315  3.9999999999999997e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0519596 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2656  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.77 
 
 
759 aa  311  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4547  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.55 
 
 
973 aa  308  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 
853 aa  307  6e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2844  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.78 
 
 
657 aa  299  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.389478  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.26 
 
 
845 aa  291  4e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0247  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.51 
 
 
870 aa  289  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136851  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 
845 aa  287  7e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2724  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.36 
 
 
827 aa  286  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2824  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.07 
 
 
1018 aa  285  3.0000000000000004e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0209449 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 
962 aa  285  3.0000000000000004e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 
1079 aa  281  5e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.4 
 
 
661 aa  273  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  32.38 
 
 
1112 aa  272  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.74 
 
 
759 aa  273  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2611  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.65 
 
 
1134 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.413442  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1175  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.76 
 
 
821 aa  271  4e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.24 
 
 
1180 aa  271  7e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3740  putative PAS/PAC sensor protein  30.81 
 
 
1109 aa  270  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3293  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 
692 aa  269  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.88 
 
 
559 aa  269  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.500087  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0269  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.47 
 
 
885 aa  269  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2089  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.32 
 
 
802 aa  267  7e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0236176  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.76 
 
 
1509 aa  266  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2523  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.06 
 
 
1194 aa  265  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.79 
 
 
1428 aa  265  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.35 
 
 
1019 aa  264  4.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.7 
 
 
822 aa  264  6e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.23 
 
 
983 aa  264  6.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.54 
 
 
1113 aa  263  8.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.18 
 
 
758 aa  263  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2358  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.47 
 
 
916 aa  263  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.32 
 
 
953 aa  260  8e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3256  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.03 
 
 
802 aa  260  9e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2023  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 
1021 aa  258  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0168563  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0936  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 
803 aa  258  4e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 
1106 aa  258  5e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.74 
 
 
1102 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2401  sensory box histidine kinase/response regulator  36.84 
 
 
1015 aa  255  3e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.02 
 
 
1108 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1934  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.89 
 
 
1015 aa  254  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.452261  normal  0.114848 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.56 
 
 
1122 aa  254  5.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.56 
 
 
721 aa  254  6e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.814379  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 
673 aa  253  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  32.39 
 
 
844 aa  253  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 
1344 aa  253  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.95 
 
 
817 aa  253  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0463  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.03 
 
 
642 aa  253  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.84 
 
 
1418 aa  251  6e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.46 
 
 
1432 aa  250  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  36.86 
 
 
527 aa  250  8e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.41 
 
 
677 aa  248  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
857 aa  248  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.84 
 
 
817 aa  248  4e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.15 
 
 
753 aa  248  6e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1847  histidine kinase  36.65 
 
 
785 aa  246  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.85 
 
 
1260 aa  245  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0231  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.02 
 
 
836 aa  245  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0172365  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2471  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 
1677 aa  244  6e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.785659  normal  0.992917 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1154  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.47 
 
 
925 aa  244  6e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.73 
 
 
929 aa  244  7e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00773709  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.41 
 
 
752 aa  244  9e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000882027 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 
654 aa  243  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 
1309 aa  243  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.39 
 
 
1260 aa  242  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  29.47 
 
 
1561 aa  241  4e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.81 
 
 
1279 aa  241  5e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>