More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2656 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2724  multi-sensor hybrid histidine kinase  67.91 
 
 
827 aa  1038    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2656  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
759 aa  1540    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2816  sensory box histidine kinase/response regulator  35.3 
 
 
882 aa  357  5e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2908  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.91 
 
 
860 aa  352  2e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1486  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.84 
 
 
886 aa  335  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.98 
 
 
886 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.27 
 
 
997 aa  328  3e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0517  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.08 
 
 
997 aa  321  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.660732  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.77 
 
 
1023 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.100128 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1075  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 
829 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.46099e-33 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.39 
 
 
810 aa  310  6.999999999999999e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000530681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2469  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.2 
 
 
655 aa  303  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344805  normal  0.830162 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.53 
 
 
1023 aa  302  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2069  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 
1184 aa  296  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0741  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.1 
 
 
1193 aa  296  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131287 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2962  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 
869 aa  295  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2151  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 
1184 aa  295  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.63 
 
 
869 aa  291  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0793  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 
871 aa  289  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0716  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.75 
 
 
890 aa  284  5.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0856  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 
893 aa  282  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1906  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.48 
 
 
619 aa  281  3e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.343997  unclonable  0.0000148298 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3231  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.41 
 
 
914 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3567  putative PAS/PAC sensor protein  40.34 
 
 
738 aa  275  3e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339814  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.67 
 
 
1040 aa  273  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.81 
 
 
853 aa  270  8.999999999999999e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.33 
 
 
859 aa  266  8e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.29 
 
 
1079 aa  265  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.38 
 
 
1428 aa  263  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4547  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 
973 aa  263  8e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1175  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.94 
 
 
821 aa  263  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2844  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.54 
 
 
657 aa  262  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.389478  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  30.3 
 
 
749 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 
897 aa  260  8e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4629  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 
841 aa  255  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3883  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.88 
 
 
882 aa  250  5e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045721 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0463  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.66 
 
 
642 aa  247  6e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0536  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 
531 aa  247  8e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.35 
 
 
845 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0550  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.91 
 
 
540 aa  246  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0519596 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3293  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 
692 aa  244  3.9999999999999997e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1801  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 
522 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0233266 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.35 
 
 
846 aa  243  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118602  normal  0.0390699 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.05 
 
 
962 aa  242  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.14 
 
 
845 aa  238  4e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.02 
 
 
1418 aa  236  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2416  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.11 
 
 
522 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.550886  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.71 
 
 
1106 aa  234  5e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  33.46 
 
 
1112 aa  234  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2523  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.19 
 
 
1194 aa  233  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.58 
 
 
1148 aa  232  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.39 
 
 
1260 aa  229  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.09 
 
 
769 aa  229  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.21 
 
 
1134 aa  229  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.95 
 
 
1081 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0933  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.59 
 
 
760 aa  228  4e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3362  PAS sensor protein  29.8 
 
 
678 aa  227  6e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0700  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.7 
 
 
1419 aa  226  9e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.81616  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.04 
 
 
1051 aa  225  2e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.91 
 
 
1432 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.07 
 
 
1122 aa  224  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.66 
 
 
651 aa  225  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.57 
 
 
822 aa  224  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.12 
 
 
1260 aa  224  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  30.67 
 
 
1561 aa  224  6e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.75 
 
 
796 aa  223  9e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3245  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.68 
 
 
860 aa  223  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48627  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2401  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.4 
 
 
991 aa  221  3e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2089  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.32 
 
 
802 aa  221  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0236176  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.77 
 
 
639 aa  220  7.999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3741  putative PAS/PAC sensor protein  29.15 
 
 
1268 aa  220  7.999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.65 
 
 
673 aa  219  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0247  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 
870 aa  218  5e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136851  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.45 
 
 
654 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.39 
 
 
773 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.92 
 
 
983 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.96 
 
 
777 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0905  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.41 
 
 
709 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0082  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.2 
 
 
946 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.97 
 
 
773 aa  213  9e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.75 
 
 
759 aa  213  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.25 
 
 
557 aa  213  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.54 
 
 
795 aa  212  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0114838  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
641 aa  212  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0350  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.91 
 
 
1140 aa  211  4e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3256  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.96 
 
 
802 aa  211  5e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 
817 aa  210  6e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1192  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.26 
 
 
912 aa  210  8e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.67 
 
 
821 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 
753 aa  209  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.89 
 
 
660 aa  209  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.91 
 
 
1102 aa  209  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.15 
 
 
796 aa  210  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.99 
 
 
677 aa  210  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.51 
 
 
1004 aa  209  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.3 
 
 
743 aa  208  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.81 
 
 
752 aa  207  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000882027 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0685  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.68 
 
 
770 aa  207  7e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000495863 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0386  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.46 
 
 
1342 aa  207  8e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5814  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.46 
 
 
583 aa  206  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.552615  normal  0.0161436 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>