More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0536 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0536  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 531 aa  1093    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0550  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  91.51 
 
 		 540 aa  1002    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0519596 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2816  sensory box histidine kinase/response regulator  40.43 
 
 		 882 aa  359  5e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 		 886 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1486  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 		 886 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1075  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.51 
 
 		 829 aa  351  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.46099e-33 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.19 
 
 		 810 aa  348  1e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000530681 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2151  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.77 
 
 		 1184 aa  341  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2908  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.53 
 
 		 860 aa  339  7e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2962  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.88 
 
 		 869 aa  336  7.999999999999999e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.6 
 
 		 869 aa  335  1e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0716  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.12 
 
 		 890 aa  335  1e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0517  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.92 
 
 		 997 aa  332  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.660732  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.46 
 
 		 997 aa  332  1e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0793  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.31 
 
 		 871 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.65 
 
 		 1023 aa  326  8.000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.100128 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.65 
 
 		 1023 aa  324  3e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2069  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 1184 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0741  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.44 
 
 		 1193 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131287 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3567  putative PAS/PAC sensor protein  37.18 
 
 		 738 aa  320  6e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4629  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.51 
 
 		 841 aa  318  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0856  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.52 
 
 		 893 aa  317  3e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.29 
 
 		 1040 aa  316  7e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3231  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.37 
 
 		 914 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3883  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.33 
 
 		 882 aa  309  9e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045721 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.59 
 
 		 846 aa  304  3.0000000000000004e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118602  normal  0.0390699 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1906  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.4 
 
 		 619 aa  304  3.0000000000000004e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.343997  unclonable  0.0000148298 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0247  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.75 
 
 		 870 aa  283  8.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2469  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.87 
 
 		 655 aa  282  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344805  normal  0.830162 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 		 983 aa  281  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1175  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 		 821 aa  277  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4547  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 973 aa  273  8.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2731  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1007 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 		 795 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0114838  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2416  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.12 
 
 		 522 aa  259  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.550886  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1801  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.74 
 
 		 522 aa  257  4e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0233266 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.06 
 
 		 763 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0337162  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1102  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.89 
 
 		 823 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.813916  normal  0.354207 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0269  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.83 
 
 		 885 aa  254  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0463  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.46 
 
 		 642 aa  253  4.0000000000000004e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 1260 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2724  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.5 
 
 		 827 aa  253  6e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.7 
 
 		 1260 aa  252  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  34.21 
 
 		 527 aa  250  5e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2844  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 		 657 aa  249  9e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.389478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 888 aa  248  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2656  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.72 
 
 		 759 aa  248  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.27 
 
 		 845 aa  249  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 		 962 aa  248  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4405  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.47 
 
 		 880 aa  247  4e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0198095  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2523  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.03 
 
 		 1194 aa  247  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.01 
 
 		 1124 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.53 
 
 		 1108 aa  246  8e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 		 845 aa  246  9e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 		 777 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.03 
 
 		 874 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0139218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 		 859 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.31 
 
 		 1113 aa  244  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.02 
 
 		 1509 aa  244  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2947  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 		 642 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 650 aa  243  5e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 		 897 aa  243  5e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1398  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.56 
 
 		 853 aa  243  6e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.12 
 
 		 1079 aa  243  7.999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.88 
 
 		 817 aa  242  9e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.35 
 
 		 1322 aa  242  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5491  cell cycle control histidine kinase CckA  32.63 
 
 		 892 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 817 aa  241  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2943  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.31 
 
 		 981 aa  241  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 853 aa  240  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.47 
 
 		 643 aa  240  5e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535539  normal  0.0122943 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.01 
 
 		 758 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.34 
 
 		 857 aa  239  6.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 		 661 aa  239  6.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.65 
 
 		 673 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.13 
 
 		 1428 aa  239  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1847  histidine kinase  35.88 
 
 		 785 aa  239  9e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.83 
 
 		 1134 aa  239  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  34.89 
 
 		 1112 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2401  sensory box histidine kinase/response regulator  33.26 
 
 		 1015 aa  239  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 		 953 aa  238  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  35.87 
 
 		 824 aa  237  4e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0513  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.66 
 
 		 803 aa  237  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.883754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.18 
 
 		 814 aa  237  4e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3256  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 		 802 aa  237  4e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.3 
 
 		 721 aa  237  4e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.814379  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_004310  BR1039  sensory box histidine kinase/response regulator  36.84 
 
 		 945 aa  236  6e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.76 
 
 		 637 aa  236  7e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1276  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.88 
 
 		 642 aa  236  8e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0082  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 		 946 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.99 
 
 		 677 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0936  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.07 
 
 		 803 aa  234  3e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.6 
 
 		 653 aa  234  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0873112  normal  0.0648404 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.61 
 
 		 1418 aa  234  4.0000000000000004e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1004  sensory box histidine kinase/response regulator  36.6 
 
 		 945 aa  233  5e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.08 
 
 		 753 aa  233  6e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3741  putative PAS/PAC sensor protein  30.37 
 
 		 1268 aa  233  6e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1952  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.03 
 
 		 692 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2375  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.1 
 
 		 766 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.352057 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1727  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 		 793 aa  232  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>